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A través del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, que alberga la unidad de procesamiento de imágenes en microscopía electrónica líder en Europa, España se ha integrado en la mayor infraestructura europea de investigación en biología estructural (Instruct, en sus siglas en inglés).

CarazoGracias al acuerdo firmado entre el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) e Instruct, la comunidad científica española tendrá acceso a una red de infraestructuras científicas con capacidades en tecnologías clave para el estudio de la biología estructural de Alemania, Bélgica, Francia, Israel, Italia, Holanda, Portugal, Reino Unido y República Checa. Además, los españoles podrán participar activamente y de forma prioritaria en la preparación y puesta en marcha de nuevos proyectos europeos.

Los científicos españoles podrán participar activamente y acceder a múltiples infraestructuras Europeas para el desarrollo de sus proyectos de investigación.  “El objetivo de esta iniciativa es unir los esfuerzos de varios países que comparten sus instalaciones para avanzar en biología y biomedicina. Los investigadores tendremos acceso a tecnologías de vanguardia, desde sincrotrones hasta grandes instalaciones de resonancia magnética nuclear”, ha señalado el investigador del CSIC José María Carazo.

El Centro Nacional de Biotecnología del CSIC coordina el proyecto en el ámbito del procesamiento de imagen en microscopía electrónica y una de sus misiones será involucrar a diversas instituciones y potenciar sinergias con otros centros de investigación e instalaciones singulares, como por ejemplo, el sincrotrón ALBA, el acelerador de partículas instalado en Cerdanyola del Vallès (Barcelona).

“Supone un gran reconocimiento internacional y nuestro compromiso será el desarrollar la nueva generación de infraestructuras en procesamiento de imagen en microscopía electrónica. Proporcionaremos apoyo a los biólogos experimentales y ayudaremos a maximizar la obtención de conocimiento biológico a partir de imágenes de microscopía. Es todo un honor y un reto el saber que la tecnología que diseñe nuestro grupo será la que se use a nivel europeo en el marco de Instruct”, ha precisado Carazo.

Instruct, la infraestructura europea de investigación en biología estructural, es una de las 48 que forman parte de la hoja de ruta del Foro Estratégico Europeo para las Infraestructuras de Investigación (ESFRI, en sus siglas en inglés). Estas grandes infraestructuras científicas internacionales constituyen la columna vertebral del Espacio Europeo de Investigación y son motor del desarrollo económico de los países involucrados en su construcción, favoreciendo la creación de economías más competitivas e impulsando la recuperación económica en momentos de crisis.

Miércoles, 29 Mayo 2013 11:59

CNB workshop 'Division from A to Z'

7 June 2013

THE WORKSHOP: The divisome is an assembly of proteins involved in bacterial division. Some of its components, as FtsA and FtsZ, share structural and functional homologies with cytoskeletal proteins.  Procedures to reconstruct divisomes in the test tube provide further insights on division and supply new discovery platforms to find new antibiotics.

The purpose of the workshop is to discuss the advances in the study of bacterial division.

KEYNOTE SPEAKER: From his postdoctoral at the University of Edinburgh to his present position at the University of Kansas Medical School, Professor Joe Lutkenhaus pioneering work has been crucial for the discovery and study of divisome components.  He has received several academic recognitions, among them the prestigious Louisa Gross Horwitz Prize in 2012.

THE PROGRAMME: We have gathered Spanish microbiologists working on bacterial cell division and some investigators whose work, coming from fields different from microbiology, provide important advances to study bacterial division in the light of novel synthetic biology approaches.

VENUE: At the main CNB lecture room. C/ Darwin nº3. 28049 Madrid. Tel: +34 91 585 45 00

Attendance is free but room capacity is limited.

ORGANIZATION: Miguel Vicente (scientific) and Moira Torrent (technical)

 

WORKSHOP PROGRAMME (pdf)


10:00 - 10:30: José M. Valpuesta (CNB, Madrid) The folding pathway of actin and tubulin mediated by an assembly line of molecular chaperones

10:30 - 11:00: Luis M. Liz-Marzán (CIC biomaGUNE) Nanoplasmonic Biodetection

11:00 - 11:30: Miguel A. de Pedro (CBMSO, Madrid) Cell wall elongation and septation: Who leads whom?

11:30 - 12:00: Juan Ayala (CBMSO, Madrid) Endopeptidases and carboxypeptidases in bacterial cell cycle. How many and for what purpose?

12:00 -12:30 COFFEE BREAK

12:30 - 13:15: Joe Lutkenhaus (U. Kansas) Min system and the Z ring
   
13:15 - 13:45: Jesús Mingorance (Hospital La Paz, Madrid) FtsA, bacterial division and the quest for a role

14:00 - 15:30 LUNCH

15:30 - 16:00: Marisela Vélez (ICP, Madrid) Looking at individual FtsZ filaments on surfaces in solution: what we have learned so far

16:00 - 16:30: Germán Rivas (CIB, Madrid) Macromolecular interactions of FtsZ: from physical biochemistry to reconstructing minimal divisomes in cell-like environments

16:30 - 17:00: José M. Andreu (CIB, Madrid) Targeting bacterial cell division protein FtsZ with small molecules

17:00 - 17:30: Paulino Gómez-Puertas (CBMSO, Madrid) In silico design of new antimicrobial compounds directed against FtsZ

17:30 - 18:00: Francisco Monroy (U. Complutense, Madrid) Membrane mechanics of bacterial division: a connection to Z ring mechanistic

18:00 - 18:30: Miguel Vicente (CNB, Madrid) Zipping the Z

El grupo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC dirigido por Jesús M. Salvador acaba de publicar que la expresión del gen Gadd45g es crítica durante el desarrollo embrionario para la formación de testículos. Al generar ratones deficientes en la proteína Gadd45g se dieron cuenta de que sorprendentemente todas las crías eran fenotípicamente hembras.

Reversión del sexo XYAunque los ratones deficientes en Gadd45g tienen el cromosomas Y y por tanto genéticamente se considerarían machos, no desarrollan testículos por un problema en la señalización durante el desarrollo embrionario. La ausencia de Gadd45g origina una anomalía de la diferenciación sexual que ocasiona el desarrollo de ovarios independientemente de la presencia del cromosoma Y.

En humanos, las anomalías de la diferenciación sexual son un grupo amplio de patologías ocasionadas por diferentes alteraciones en alguna de las etapas del desarrollo fetal necesarias para el desarrollo normal del sexo genético y gonadal. Están consideradas dentro del grupo de patologías raras por su baja frecuencia inferior a 1/4.500 recién nacidos. La etiología de este tipo de patologías es genética y aunque se han descrito algunas mutaciones inactivadoras en un grupo muy reducido de genes, existe un gran número de casos  sin diagnóstico definido. Por tanto la identificación de este gen de la familia Gadd45 puede ser muy importante en el esclarecimiento del diagnóstico etiológico de este tipo de patologías.

La familia de genes Gadd45, está compuesta por tres miembros, Gadd45a, Gadd45b y Gadd45g. En el laboratprio de Salvador han generado ratones deficientes en cada una de estas proteínas y observaron que Gadd45g es el único miembro de la familia que tiene una función esencial en la determinación del sexo y el desarrollo de testículos.

Además, en este estudio describen el mecanismo que ocasiona la anomalía en el desarrollo testicular.  Gadd45g es un regulador positivo del gen SRY que se encuentra en el cromosoma Y. La ausencia de Gadd45g evita la expresión de SRY y SOX9, evitando el desarrollo de gónadas masculinas.

Las plantas, al contrario que los animales, son incapaces de ir de un sitio a otro en busca de alimento. Pero eso no les impide moverse e intentar de conseguir las condiciones de luz más favorables para ellas.

Eduardo González-Grandío y Pilar Cubas en el invernadero del CNB Las plantas son capaces de percibir otras plantas en su proximidad y cuando esto sucede ponen en marcha un programa genético conocido como el síndrome de huida de la sombra. Un síndrome que, entre otras características, consiste en la supresión del crecimiento de las ramas laterales, lo que a su vez favorece el crecimiento del tallo principal. De ahí que las plantas que crecen muy juntas sean más altas que las que lo hacen disponiendo de más espacio.

En su laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, Pilar Cubas ha descubierto que el gen BRANCHED1 se activa en las yemas axilares cuando hay plantas cercanas. Según acaba de publicar en la revista Plant Cell, al ponerse en funcionamiento este factor de transcripción TCP se encarga de reprimir la transcripción de un gran número de genes implicados tanto en el ciclo celular como en la síntesis de proteínas. Además, también promueve la acción de una hormona asociada a la dormición, el ácido abscísico. Como resultado, las yemas laterales entran en reposo y no crecen nuevas ramas. De este modo, la planta mejora su captación de luz y evita ser cubierta por las plantas que la rodean.

Conocer el funcionamiento de BRANCHED1 puede permitir en el futuro suprimir el crecimiento de ramas no deseadas en especies de interés agronómico en las que la poda supone un elevado coste de manejo y, explica Cubas, "mejorar la arquitectura de otras especies para favorecer su cosechado".

Según se van sintetizando las proteínas en los ribosomas, éstas tienen que ir tomando la forma adecuada para poder ejercer su función. Aunque las características físico-químicas de los aminoácidos que las forman determinan en gran parte la forma que adquieren, hay muchas proteínas que necesitan ayuda extra de parte de un grupo de proteínas conocidas como chaperonas.

José María Valpuesta y Jorge Cuéllar junto al microscopio electrónico del CNBPara comprender mejor cómo funcionan estas proteínas, en su laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB), el grupo dirigido por José María Valpuesta ha utilizado la microscopía electrónica. Gracias a esta técnica han podido determinar por primera vez la estructura de un complejo formado por la chaperona DnaJ y su sustrato, lo que les ha permitido observar cómo la chaperona cambia la estructura del sustrato y con ello su función.

En colaboración con la Universidad del País Vasco, el investigador postdoctoral del CNB Jorge Cuéllar ha identificado además en dicha chaperona una zona de gran flexibilidad que le permite adaptarse a la forma de distintas proteínas. Como se puede apreciar en la imagen de abajo, la forma que adopta la chaperona DnaJ (en azul) cambia radicalmente en función del sustrato al que se une (RepE1-144, RepE o Rep54; en amarillo). De este modo, una misma chaperona es capaz de unirse a una variedad de proteínas diferentes, consiguiendo en todas ellas que adquieran la forma necesaria para funcionar.

chaperona DnaJ

Un estudio internacional en el que ha participado la investigadora del CNB Cristina Risco ha publicado en la revista PNAS la estructura de la ribonucleoproteína del virus Bunyamwera, modelo de estudio de los integrantes de la familia Bunyaviridae, a la que también pertenecen los virus que provocan la fiebre hemorrágica de Congo y Crimea y la fiebre del valle del Rift.

"Uno de los principales resultados de esta investigación es que la flexibilidad de la nucleoproteína que envuelve el ARN de Bunyamwera facilita el empaquetamiento de su material genético en las partículas virales y su replicación una vez fuera del virus. La estructura atómica muestra que el plegamiento de la nucleoproteína es, además, diferente al observado en las demás nucleoproteínas de virus conocidas”, explica Risco.

Este estudio muestra que, a pesar de su flexibilidad, el complejo que recubre el material genético lo protege completamente del ataque de las nucleasas, las enzimas que rompen las moléculas de ARN.

Los resultados de este estudio ayudan a entender mejor el mecanismo molecular mediante el que se ensamblan las ribonucleoproteínas virales. "Este conocimiento permitirá avanzar en el desarrollo de compuestos para atacar a estos complejos macromoleculares que son esenciales para la supervivencia de los virus ARN", añade desde el mismo laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC la investigadora Isabel Fernández de Castro.

Los hallazgos logrados por este estudio, liderado por investigadores chinos, ha sido posible mediante el uso de cristalografía de rayos X y microscopía electrónica. Como se aprecia en la imagen, el complejo formado por el monómero de la proteína viral NP y el ARN, la flexibilidad de este complejo respecto a los adyacentes es el elemento básico que dirige la oligomerización y ensamblaje de las ribonucleoproteínas lineales y flexibles del virus Bunyamwera.

Nucleocápside

El Campus de Excelencia Internacional UAM+CSIC (CEI UAM+CSIC) tiene como una de sus líneas de actuación esenciales la captación de talento tanto a nivel nacional como internacional. Y con la intención de atraer científicos y profesores de primer nivel, acaba de convocar el Premio de Investigación CEI UAM+CSIC en el área de la Biología Molecular Física y Sintética.

Premio de Investigación CEI UAM+CSICEl objetivo de este premio, compatible con cualquier otro tipo de premio y/o ayuda, es el de favorecer que profesionales de otros centros de investigación puedan trasladarse al CNB para desarrollar una línea de investigación que se centre en el estudio del plegamiento y función de proteínas. Para ello, deberán integrar métodos experimentales de alta resolución temporal, estructural y de moléculas únicas, modelización teórica y simulaciones computacionales.

El premio tiene una dotación económica de 30.000 € anuales de libre disposición durante tres años, prorrogables a otros dos. Para solicitarlo, el investigador debe tener una vinculación permanente con el CSIC y no podrá estar adscrito a ningún centro del CEI UAM+CSIC.

Las solicitudes se presentarán en el registro general de la UAM desde el 8 de abril al 22 de abril de 2013.

Miércoles, 13 Febrero 2013 11:52

La Reina Doña Sofía visitó el CNB

Con motivo del vigésimo aniversario del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB), la semana pasada, la Reina Doña Sofía visitó sus laboratorios en compañía de la directora del CNB, Carmen Castresana, y de su antecesor en el cargo, José María Valpuesta.

Entrada del CNBDoña Sofía, acompañada, entre otras autoridades, por la ministra de Fomento, Ana Pastor, el presidente del CSIC, Emilio Lora-Tamayo, y el rector de la Universidad Autónoma de Madrid, José Mª Sanz Martínez, mantuvo una reunión de trabajo con el director saliente, José María Valpuesta; su sucesora, Carmen Castresana; tres investigadores que también ocuparon este puesto (Mariano Esteban, José Ramón Naranjo y José López Carrascosa); y el científico del CNB Carlos Martínez-Alonso, quien fuera en su momento presidente del CSIC y anterior Secretario de Estado de Investigación.

Durante la reunión, Naranjo expuso los pormenores de su proyecto de investigación sobre el alzheimer que se financia, en parte, gracias a la Fundación Reina Sofía. Mariano Esteban tuvo ocasión asimismo de exponer a la Reina los avances obtenidos en los ensayos clínicos de su vacuna contra el sida y sus experimentos con vacunas contra la malaria, la leishmaniasis y la gripe. López Carrascosa, por su parte, explicó la marcha de sus trabajos sobre la estructura de los virus. Finalmente Martínez-Alonso habló de sus estudios sobre el papel de las células madre en el desarrollo y la metástasis del cáncer.

Reunión de trabajoA continuación realizaron un recorrido por las instalaciones del CNB, entre las que destacan el servicio de microscopía confocal, el microscopio electrónico, el citómetro de flujo, el laboratorio de pinzas ópticas y las instalaciones de cultivo de plantas del CNB.

La visita comenzó en el laboratorio de microscopía confocal. En el, Sylvia Gutiérrez Erlandsson mostró las imágenes digitales que se obtienen actualmente de las células gracias al empleo de láseres. Con esta tecnología y el uso de marcadores fluorescentes en las muestras, se pueden localizar los distintos componentes de las células.

Durante la visita al microscopio electrónico, Jaime Martín-Benito le pudo explicar cómo funcionan este tipo de microscopios y le estuvo enseñando algunos ejemplos como su último trabajo publicado en la revista Science en el que describen la estructura de las proteínas responsables de la replicación y expresión del material genético del virus de la gripe A.

Citometría de flujoA continuación, María del Carmen Moreno-Ortiz explicó a Doña Sofía en qué consiste la técnica de la citometría de flujo. Entre los ejemplos interesantes de cómo se pueden analizar las distintas poblaciones celulares de una muestra, Moreno tuvo la oportunidad de mostrar cómo se pueden separar las células tumorales de las células normales.

Su Majestad tuvo la oportunidad de conocer de mano de Elías Herrero y Borja Ibarra la llamada técnica de pinzas ópticas. Esta revolucionaria técnica permite a los investigadores atrapar cualquier molécula individualmente (desde una proteína al ADN) y medir los cambios que sufre mientras ejerce su función.

Finalmente, en el invernadero del CNB, Carlos Alonso y Salomé Prat tuvieron la oportunidad de mostrar brevemente las plantas que se cultivan y explicar las últimas investigaciones llevadas a cabo por los científicos del Departamento de Genética Molecular de Plantas.

Invernadero

El CSIC ha renovado el panel de integrantes de su Comité Científico Asesor. La nueva lista de 23 miembros se ha cerrado con siete nuevas incorporaciones. Entre otras la de investigador del Centro Nacional de Biotecnología Mariano Esteban.

Mariano Esteban en su laboratorioEl órgano, cuya presidencia ostenta el presidente del CSIC, Emilio Lora-Tamayo, se compone de científicos y tecnólogos de las distintas áreas de conocimiento en las que está distribuida la actividad científica del CSIC. Según el Estatuto del organismo, tiene la función de informar y asesorar en aspectos científico-tecnológicos a la Presidencia del CSIC y al Consejo Rector.

Los siete vocales que se incorporan al comité son: Juan Albadalejo Montoro (profesor de Investigación del CSIC adscrito al Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura), Mariano Esteban Rodríguez (profesor de Investigación del CSIC adscrito al Centro Nacional de Biotecnología), Ángel Messeguer Peypoch (profesor de Investigación del CSIC adscrito al Instituto de Química Avanzada de Cataluña) y Juan Moreno Klemming (profesor de Investigación del CSIC adscrito al Museo Nacional de Ciencias Naturales)

Esteban es pionero en el campo de las vacunas, donde destaca en la lucha contra el sida empleando procedimientos de inmunización combinada de vectores. Sus trabajos, que están siendo financiados por distintos organismos nacionales e internacionales como la Fundación Bill y Melinda Gates, tienen aplicación en enfermedades como la hepatitis C, la gripe o el cáncer de próstata.

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