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Oportunidades predoctorales

 Oportunidades disponibles para hacer el doctorado en el CNB

 

NUEVO: AGOSTO 2023

Expresiones de interés para solicitar ayudas para la formación de doctores (antiguas FPI) concedidas en el CNB para contratos predoctorales 

 

A continuacion detallamos los grupos del CNB interesados en contactar con personas que quieran solicitar estos contratos.

 

1- Título del proyecto: Identificación y caracterización de nuevos genes responsables de la diversidad natural de los tricomas de las plantas.  IP: Carlos Alonso Blanco. Más información del grupo de investigación

Referencia del proyecto: PID2022-136893NB-I00  Resumen del proyecto de tesis: El objetivo de esta tesis es identificar nuevos genes implicados en la variación natural para la cantidad de tricomas que las plantas desarrollan para adaptarse a distintos factores ambientales, tanto abióticos (ej. altas temperaturas), como bióticos ej. herbivoría). En concreto, se pretende realizar un análisis comparativo de dichos genes en dos especies modelo de la familia Brassiciceae que se separaron hace 30 millones de años: Arabidopsis thaliana y Cardamine hirsuta. Para alcanzar este objetivo se aplicarán las últimas metodologías de mapeo genético basado en la secuenciación masiva de genomas en plantas con fenotipos extremos. Los genes identificados se caracterizarán molecularmente a través de mutantes que se generarán mediante la técnica de edición génica CRISPR/Cas9.

 Ámbito: Genética Molecular de Plantas Palabras clave: Genética, genómica, adaptación, tricoma, Arabidopsis, Cardamine, locus de carácter cuantitativo (QTL)

 

2- Título del proyecto: Diacylglycerol Kinase targeting to overcome resistance of solid tumors to immunotherapy (DGKTARGET. IP: Isabel Mérida, Más información del grupo

Referencia: PID2022-136871OB-I00

Summary: The candidate will join a project that investigates the mechanisms that DGKs use to limit T cell responses and how to circumvent their action to eliminate advanced tumors. The studies have important translational potential and will provide an excellent opportunity to acquire proficiency in a variety of methodologies including use of animal models, cytometry, microscopy, cell culture and molecular biology.
We are looking for highly motivated candidates with interest in the fields of T lymphocyte biology and cancer immunotherapy. The candidate will join a team of reference in the DGK field that, along the years, has generated a large body of knowledge as well as many tools for DGK research. The group has a large expertise in the study of T cell signaling and has optimized several techniques of use in the area of immuno-oncology including characterization of tumor-infiltrating-lymphocytes by flow cytometry, 3D cultures and xenograft models. The CNB provides an excellent framework for the development of this project providing all the necessary equipment, facilities and common services. Applicants must be EU nationals or have permanent residence in Spain and should hold an excellent Degree in fields related to Biomedical Sciences. A Master’s degree would be advantageous. Indispensable a good level of English.
If interested please submit your CV and a covering letter to Drs Merida or Avila-Flores .

 

3- Título el proyecto: Maquinarias de ubiquitinación como nodos en el control de programas transcripcionales y epigenéticos en plantas. IP: Vicente Rubio. Más información del grupo
Referencia del proyecto: PID2022-142741NB-I00  Resumen del proyecto de tesis: Crop yield has to increase dramatically to secure future food supplies due to a growing world population and changing climate. Development of high-yielding plant varieties with increased tolerance to abiotic stresses and to extensive farming practice is key within the frame of a sustainable and environmentally respectful agriculture. For this, understanding the regulatory networks that allow plants to integrate simultaneous stress signals and to translate them into adaptive growth and developmental changes is of up-most importance.
CRL4-CDDD complexes act as hubs to integrate stress and environmental signals to trigger coherent adaptive and developmental plant responses. Moreover, CRL4-CDDD help to carve the epigenome landscape in response to light/dark transitions, leading to adaptive transcriptional reprogramming. Such a function is tightly connected with modulation of transcription elongation (TE) and RNA Pol II processivity. Thus, manipulation of CRL4-CDDD function holds a potential to finely regulate epigenome dynamics and targeted gene expression.
In this project, the PhD candidate will characterize the role of CRL4-CDDD in controlling the activity of TE factors and RNA Pol II. For this, molecular, biochemical, proteomics, and epigenomics approaches will be used. The expected results will uncover molecular mechanisms with agrotech potential that allow plant adaptation to environmental changes, leading to technologies towards increased crop yield and stress tolerance.

Ámbito: Genética, epigenética y Biología Molecular de Plantas, Palabras clave: Proteostasis vegetal, regulación epigenética, ubiquitinación, estrés abiótico, señalización ambiental, cromatina, elongación transcripcional, CRL4-CDDD, RNA Pol II

 

4- Título del proyecto: In vivo communication through extracellular microRNA carriers and their role in metabolic diseases. IP: Rubén García Martín. Group information
 Referencia del proyecto: PID2022-141519OA-I00  Resumen del proyecto de tesis: Our lab is focused on new modes of intercellular communication, including extracellular vesicles, protein complexes and lipoproteins. These have emerged as novel modes of intertissue communication by carrying specific repertoires of proteins, RNAs (especially microRNAs), lipids and metabolites. This cargo is incorporated to target cells, leading to changes in cellular function.  They are linked to the development of many physiological and pathological processes, including metabolic diseases, cancer, cardiovascular diseases and many others in ways we do not understand yet. From these, the most abundant in the circulation are protein complexes, especially the central effector of microRNA actions, Argonaute2. They transport microRNAs from one cell to another. microRNAs represent one of the most important posttranscriptional regulators of gene expression. However, despite its high abundance, there are many unresolved fundamental questions regarding this communication system. In this PhD project, we aim to characterize the cell-to-cell communication events happening through extracellular Argonaute2 by using innovative in vitro and in vivo models, with a major interest in its implications for the development of metabolic and immune diseases such as obesity and diabetes.  Experiments will consist in the application of multiple in vitro biotechnology tools, molecular biology, viral vectors, immunoblotting, microRNA profiling, etc. as well as analysis of tissue and systemic metabolism and inflammation in mice.
Ámbito: Metabolismo, Comunicación intercelular, Fisiología  Palabras clave: Metabolismo, Comunicación intercelular, Fisiología, microRNAs, Argonaute2

 

5- Título el proyecto. Novel regulators of the MpCOI1-dependent and -independent JA pathways (NOVEL). IP: IP1 Roberto Solano, IP2 Andrea Chini Referencia del proyecto PID2022-140766OB-I00

Resumen del proyecto de tesis Jasmonates are essential phytohormones in streptophytes (land plants and algae). This project aims to dissect the molecular function of jasmonate signaling components recently identified in our lab using the model bryophyte Marchantia polymorpha. The specific objectives are based in the following recent discoveries:

- The components of the jasmonate signaling pathway are conserved in bryophytes and eudicots. However, the bioactive hormone binding the COI1 receptor that activates the pathway is different: dn-OPDA in Marchantia and JA-Ile in eudicots (Monte et al. 2018; Peñuelas et al. 2019; Monte et al. 2019; Soriano et al. 2022; Kneeshaw et al. 2022; Monte et al. 2022; Chini et al. 2023). 
- The electrophilic nature of dn-cis-OPDA activates a previously unknown COI1-independent pathway regulating thermotolerance (Monte et al. 2020). MpHSFA and MpREIL are involved in regulating this thermotolerance mechanism. 
- MpTIFY8, a JAZ-related protein, regulates dn-OPDA responses, suggesting that TIFY8 has a function opposite to that of MpJAZ. 
- Several MpbHLH TFs regulate secondary metabolism in Marchantia, a plant rich secondary metabolites with a great pharmacological potential almost unexplored so far.
In this proposal, the early-stage researcher will be involved in the characterization of different signaling elements (MpTIFY8 and MpbHLHs) modulating the canonical dn-OPDA pathway regulating defenses against different biotic and abiotic stresses. The ESR will also study the function of elements (MpHSFA and MpREIL) of the dn-OPDA regulated, COI1-independent “ancestral” pathway that will help to define plant thermotolerance and adaptive responses to heat stress.
Ámbito: Plant Molecular Genetic/Genética Molecular de Plantas
Palabras clave: Plant Molecular Biology, Signal transduction, Phytohormones, Bryophyte, Marchantia polymorpha, Jasmonates, stress responses, COI1, thermotolerance
 

ENERO 2023

Oportunidades de SOLICITAR contratos FPU2022 en Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) 
 
El grupo de Carmen San Martín ofrece la posibilidad de trabajar en estructura de virus. En el laboratorio se utilizan técnicas avanzadas de microscopía (óptica, electrónica, fuerzas atómicas) en un entorno interdisciplinar, para comprender cómo las partículas virales se ensamblan, se desensamblan, y adquieren su función infectiva. Perfil: bioquímica, biología molecular, virología
Nota Exp>8,5. Los interesados pueden contactar cn la Dra San Martín aquí
 
El grupo de Sandra Fonseca ofrece la posibilidad de trabajar en el conocimiento de los mecanismos moleculares que permiten a las plantas adaptarse a estreses múltiples y entender el rol de las altas intensidades de luz en ese proceso. Se utilizarán técnicas de biología molecular, bioquímica, genética y genómica. La persona seleccionada estará integrada en un ambiente científico dinámico e internacional, participará en cursos formativos de desarrollo de carrera científica, así como en seminarios y congresos. Mas información y contacto aquí.
 
El grupo de Isabel Mérida busca candidatos/as para realizar una tesis doctoral en los mecanismos moleculares de la limitada respuesta antitumoral mediada por linfocitos T. Más información y contacto con Antonia Avila Flores, aquí.
 
El grupo Patógenos Bacterianos Intracelulares, dirigido por Francisco García del Portillo, trabaja en la función del peptidoglicano de la pared bacteriana de Salmonella. Más infomación aquí.

El grupo de Modelos animales por modificación genética, dirigido por Lluís Montoliu, trabaja en la optimización y validación de sistemas CRISPR-Cas como herramientas de edición genética, y en la investigación en enfermedades raras, como el albinismo. Contamos con financiación del Plan Nacional, del CIBER de Enfermedades Raras y de la Fundación Ramón Areces, además de participar en varios consorcios europeos. Más información aquí. Interesados/as pueden contactar por email
 
El grupo de Dra. Esther Ortega en el Dpto de Estructura de Macromoléculas se centra en el estudio de complejos proteicos que interactúan con DNA y con híbridos DNA:RNA, con el objetivo de determinar cuáles son los mecanismos moleculares de su función y su implicación en condiciones de estrés replicativo en eucariotas. Más información aquí

El grupo del Dr Eduardo González en el Departamento de Genética Molecular de Plantas busca candidatos/as para el proyecto "Desarrollo de herramientas de biología sintética vegetal para modificar la ramificación de plantas de tomate". Más información aquí

30 de diciembre 2022

Expresiones de Interes para la contratación de personal investigador predoctoral en formación

La Comunidad de Madrid ha anunciado la próxima publicación de una convocatoria de ayudas para contratar a personal investigador predoctoral. Cuando se publique la convocatoria en el BOCM habrá 15 días hábiles para presentar candidatos/as. Por este motivo, a continuacion detallamos los grupos del CNB interesados en contactar con personas que quieran solicitar estos contratos.

El grupo Patógenos Bacterianos Intracelulares, dirigido por Francisco García del Portillo, trabaja en la función del peptidoglicano de la pared bacteriana de Salmonella. Más infomación aquí.

El grupo de Modelos animales por modificación genética, dirigido por Lluís Montoliu, trabaja en la optimización y validación de sistemas CRISPR-Cas como herramientas de edición genética, y en la investigación en enfermedades raras, como el albinismo. Contamos con financiación del Plan Nacional, del CIBER de Enfermedades Raras y de la Fundación Ramón Areces, además de participar en varios consorcios europeos. Más información aquí. Interesados/as pueden contactar por email
 
El grupo de Dra. Esther Ortega en el Dpto de Estructura de Macromoléculas se centra en el estudio de complejos proteicos que interactúan con DNA y con híbridos DNA:RNA, con el objetivo de determinar cuáles son los mecanismos moleculares de su función y su implicación en condiciones de estrés replicativo en eucariotas. Más información aquí
 

19 de diciembre 2022

CONTRATO PREDOCTORAL de cuatro años de duración

El grupo de Carlos Ardavín busca candidatos/as para solicitar un contrato predoctoral FPI asociado al proyecto: Función de los macrófagos peritoneales en la implantación de metástasis de tumores colorrectales en el omento: base inmunológica para el desarrollo de inmunoterapia frente a metastasis de cancer colorrectal basada en la reprogramación de los macrófagos (PID2021-122748OB-I00). Para más información, contactar con el  Dr C. Ardavín

 

El grupo de Fernando Rojo busca candidatos/as para solicitar un contrato predoctoral FPI, de cara a la realización de una tesis doctoral dentro del proyecto PID2021-122230NB-I00 (MICIN/AEI), para trabajar en aspectos moleculares de la regulación de la expresión génica en la bacteria Pseudomonas putida. Para más información, contactar con Dr. Fernando Rojo antes del 31 de enero 2023.

 

CERRADAS

Convocatoria INPhiNIT Incoming La caixa

El CNB, centro de excelencia Severo Ochoa, ofrece hasta 10 plazas dentro del programa "INPhiNIT Incoming la Caixa". Este programa de becas de doctorado  está destinado a atraer a jóvenes talentos investigadores, de cualquier nacionalidad, que deseen realizar estudios de doctorado en territorio español o portugués. Promovido por la Fundación ”la Caixa”, tiene como objetivo apoyar al mejor talento científico y fomentar la investigación innovadora y de alta calidad en España y Portugal mediante la contratación de estudiantes internacionales destacados y ofrecerles un entorno atractivo y competitivo para realizar una investigación de excelencia. Las becas de doctorado INPhINIT ofrecen un salario altamente competitivo y oportunidades complementarias para la capacitación en habilidades transversales (mediante sesiones de formación anuales), estancias temporales en la industria, incentivos al finalizar la tesis, y un conjunto de aspectos que sitúan a estas becas entre las más atractivas y completas de Europa.

Esta modalidad se centra exclusivamente en las disciplinas STEM: ciencias de la vida y la salud, ciencias experimentales, física, química y matemáticas.

Para realizar su investigación en instituciones españolas, los candidatos deben haber residido en España durante menos de 12 meses en los últimos 3 años, mientras que para las instituciones portuguesas, los candidatos deben haber residido en Portugal durante menos de 12 meses en los últimos 3 años.

El plazo para presentar solicitudes estará abierto hasta el 27 de enero de 2022 a las 14:00

PROCEDIMIENTO DE SOLICITUD: https://candidate.lacaixafellowships.org/login

Proyectos en el CNB:

  • Analysis of cryo-Electron Microscopy images by Deep Learning approaches. IP: Dr. José María Carazo García
  • CAPN12-IO: Development of a new strategy for cancer immunotherapy based in selective, orally-available inhibitors of CALPAIN 12. IP: Dr Santos Mañes
  • Deciphering the molecular basis of IBDV persistence. IP: Dr. Dolores Rodríguez Aguirre
  • Functional and structural studies of virus-host interactions during plus-strand RNA virus infections. IP: Dr. Pablo Gastaminza Landart
  • In-cell structural biology of viral infections. IP: Dr. Carmen San Martín Pastrana
  • Inflammation and Colon cancer: Implication of Stress signalling and Gut microbiota. IP: Dr. Ana Isabel Cuenda Méndez
  • Single-molecule approaches to study protein machines involved in DNA repair. IP:Dr. Fernando Moreno Herrero
  • Study on the origin of the domain bacteria based on phylogenomics and analysis of the cell wall. IP: Dr. Francisco García del Portillo
  • Synthetic Biology tools to re-program bacterial adhesion for constructing catalytic consortia. IP: Dr. Víctor de Lorenzo Prieto
  • Understanding the molecular mechanisms lying behind Bruton’s tyrosine kinase regulation of B lymphocyte dynamics and function: implications in pathology. IP: Dr. Yolanda Rodríguez Carrasco

 

Convocatoria INPhiNIT Retaining La Caixa

Doctorado INPhINIT Retaining: 30 becas de doctorado para investigadores que quieran llevar a cabo su proyecto de doctorado en cualquier ámbito de investigación y cualquier universidad o centro de investigación en España o Portugal.

  • Los candidatos deben haber residido o llevado a cabo su actividad principal en el mismo país, ya sea España o Portugal, más de 12 meses en los últimos 3 años.  Los interesados deben presentar su candidatura directamente, no hay plazas especificas asociadas a los centros de investigación.

El plazo para presentar solicitudes estará abierto hasta el 16 de febrero de 2022 a las 14:00 H

PROCEDIMIENTO DE SOLICITUD: https://candidate.lacaixafellowships.org/login

 

Octubre 2021

El grupo de la Dra. Carmen San Martín busca candidatos/as para solicitar un contrato predoctoral FPU, de cara a la realización de una tesis doctoral en temas relacionados con el ensamblaje de virus complejos, utilizando técnicas avanzadas de crio-microscopía electrónica. más información aquí

 

El laboratorio "Receptores de quimioquinas: nuevas dianas para intervención terapeutica" dirigido por Mario Mellado está buscando candidatos/as interesdado en la solcitud de un contrato FPI asociado al proyecto PID2020-114980RB-I00 para realizar la tesis doctoral durante 4 años en el laboratorio. Los objetivos, requisitos y proceso de selección se indican en este documento.

 

El laboratorio "Infección por Virus de la Hepatitis C y virus relacionados" dirigido por Pablo Gastaminza está buscando candidatos/as interesados en la solicitud de un contrato FPI para realizar la tesis doctoral durante 4 años en el laboratorio. Los objetivos, requisitos y proceso de selección se indican en este documento.

 

El laboratorio Máquinas moleculares virales dirigido por José Ruiz Castón está buscando candidatos/as interesados en la solicitud de un contrato FPI asociado al proyecto de investigación PID2020-113287RB-I00 para realizar la tesis doctoral durante 4 años en el laboratorio. Los objetivos, requisitos y proceso de selección se indican en este documento.

 

Los laboratorios de Lógica de Sistemas Genómicos y Biomedicina de Sistemas buscan candidato para una tesis doctoral financiada por un contrato predoctoral FPI asociada a Centros de Excelencia Severo Ochoa. La tesis se enmarcaría en el interés de ambos laboratorios en la identificación de principios cuantitativos en los sistemas biológicos y la aplicación de estos en biomedicina. Más información aquí

Aquellos interesados pueden mandar su CV, una breve nota con sus intereses y dos cartas de recomendación a Juan Poyatos y/o Mónica Chagoyen. Para cualquier duda respecto a la adecuación individual a estos condicionantes contactar con cualquiera de los dos investigadores involucrados.

 

Hasta el 4 de febrero 2021:

El CNB, centro de excelencia Severo Ochoa, ofrece hasta 10 plazas dentro del programa "INPhiNIT Incoming la Caixa". Este programa de becas de doctorado  está destinado a atraer a jóvenes talentos investigadores, de cualquier nacionalidad, que deseen realizar estudios de doctorado en territorio español o portugués. Promovido por la Fundación ”la Caixa”, tiene como objetivo apoyar al mejor talento científico y fomentar la investigación innovadora y de alta calidad en España y Portugal mediante la contratación de estudiantes internacionales destacados y ofrecerles un entorno atractivo y competitivo para realizar una investigación de excelencia. Las becas de doctorado INPhINIT ofrecen un salario altamente competitivo y oportunidades complementarias para la capacitación en habilidades transversales (mediante sesiones de formación anuales), estancias temporales en la industria, incentivos al finalizar la tesis, y un conjunto de aspectos que sitúan a estas becas entre las más atractivas y completas de Europa.

  • Doctorado INPhINIT Incoming: 35 becas de doctorado (con 10 plazas ofertdas en el CNB) para investigadores que quieran llevar a cabo su proyecto de doctorado en centros de investigación acreditados con el Sello de Excelencia español Severo Ochoa, María de Maeztu o el Instituto de Salud Carlos III y unidades portuguesas acreditadas como "excelentes" según la evaluación de la Fundação de Ciência e Tecnologia. Solicitudes hasta el 4 de febrero de 2021.

    Esta modalidad se centra exclusivamente en las disciplinas STEM: ciencias de la vida y la salud, ciencias experimentales, física, química y matemáticas.

    Para realizar su investigación en instituciones españolas, los candidatos deben haber residido en España durante menos de 12 meses en los últimos 3 años, mientras que para las instituciones portuguesas, los candidatos deben haber residido en Portugal durante menos de 12 meses en los últimos 3 años.

PROYECTOS DEL CNB:

  • Assembly, structure and physical properties of double jelly roll viruses with implications in biomedicine, ecology and virus evolution

          Group leader Dr. Carmen San Martín  Research group

  •  Bacterial antibiotic addiction: exploring a new concept in the war against multi-drug resistant pathogens

           Group leader Dr. Daniel López Serrano  Research group

  •  Disruption of protein folding using small drugs as an anti-cancer strategy: CCT chaperonin as therapeutic target

           Group leader: Dr. José María Valpuesta Research group

  • Exploiting natural variation following comparative GWAS analysis to unravel phosphate starvation signaling in plants

          Group leader Dr. Javier Paz-Ares Research group

  • Exploring newly discovered microbiomes: on the origins of the bacterial cell wall

          Group leader Dr. Francisco García del Portillo Research group

  • Investigating the interplay between activity and the neuron’s identity during cerebral cortical wiring. Reprograming and brain repair

           Group leader Dr. Marta Nieto Research group

  • Structural and Functional Analysis of the IYO protein 

          Group leader Dr. Enrique Rojo  Research group

  • Targeting of Diacylglycerol Kinases for cancer immunotherapy

         Group leader Dr. Isabel Mérida Research group

  • Towards precision medicine: robustness and variability in complex phenotypes

          Group leader Dr. Juan F. Poyatos  Research group

  • Vaccine development against SARS-CoV-2 by B and T cell multiepitope protein components

        Group leader Dr. Mariano Esteban  Research group

 

Solicitudes hasta el 21 de febrero de 2021.

Doctorado INPhINIT Retaining: 30 becas de doctorado para investigadores que quieran llevar a cabo su proyecto de doctorado en cualquier ámbito de investigación y cualquier universidad o centro de investigación en España o Portugal.

  • Los candidatos deben haber residido o llevado a cabo su actividad principal en el mismo país, ya sea España o Portugal, más de 12 meses en los últimos 3 años.  Los interesados deben presentar su candidatura directamente, no hay plazas especificas asociadas a los centros de investigación.

 

 

Ofertas hasta el 27 de Octubre 2020.

El grupo de Carlos Alonso busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto "Bases genéticas y moleculares de la variación natural para el patrón de tricomas en Cardamine hirsuta y Arabidopsis thaliana" . Más información aquí

El grupo de Carlos Martínez y Karel van Wely busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto "Regulación del metabolismo de ARN por Dido: Implicaciones en el desarrollo de células madre, síndrome metabólico, y cáncer". Más información aquí

El grupo de Jose María Valpuesta busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto "Chaperonas moleculares: actores claves en la homeostasis proteica” (PID2019-105872GB-I00). Más información aquí

El grupo de Vicente Rubio busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto “New chromatin remodeling pathways in the plant response to environmental signals”(ref# PID2019-105495GB-I00). Más información aquí

El grupo de Juan Antonio García busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto "Profundizar en el conocimiento de las infecciones potyvirales para el desarrollo de nuevas estrategias antivirales"  Más información aquí

El grupo de Ana Cuenda busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto "Stress activated protein kinases p38MAPKs in human diseases". Más información aquí

El grupo de Javier Tamames y Carlos Pedrós-Alió busca candidatos/as para la realización de una tesis doctoral asociada al proyecto " TRAITS: Studying the structure of guilds beyond the species rank. Development of methods for the fast analysis of microbiomes “ ( PID2019-110011RB-C31). Más información aquí

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