Plant-pathogen interaction in viral infections

Garcia

 ERojo

Juan Antonio García

Group Leader

Contact

 

Carmen Simón

Group Leader

Contact

 

 

Research summary

Plant viruses depend largely on host factors to replicate in the cell and to propagate throughout the plant and between individual plants. Plants in turn have developed antiviral defence mechanisms that must be counteracted by viral factors. These factors appear to be preferred targets for alternative plant defences. In our laboratory, we try to understand this complex interplay, mainly in the infection of the potyvirus Plum pox virus (PPV), the causal agent of sharka, a damaging disease of Prunus trees. We are especially interested in defence responses related to RNA silencing and its viral suppressors.

 

Publications

Pasin F, Bedoya LC, Bernabé-Orts JM, Gallo A, Simón-Mateo C, Orzaez D, García JA. Multiple T-DNA delivery to plants using novel mini binary vectors with compatible replication originsACS Synth Biol 2017 Oct 20;6(10):1962-1968

Gallo A, Valli A, Calvo M, García JA. A functional link between RNA replication and virion assembly in the potyvirus Plum pox virus. J. Virol. 2018; 92, e02179-17.

Ochoa J, Valli A, Martín-Trillo M, Simón-Mateo C, García JA, Rodamilans B. Sterol isomerase HYDRA1 interacts with RNA silencing suppressor P1b and restricts potyviral infection. Plant Cell Environ 2019; 42: 3015-3026

Hervás M, Navajas R, Chagoyen M, Garcia JA, Martinez-Turiño, S. Phosphorylation-related cross-talk between distant regions of the core region of the coat protein contributes to virion assembly of Plum pox virus. . Mol Plant Microbe Interact 2020; 33: 653-667

González de Prádena A, Sánchez Jiménez A, San León D, Simmonds P, García JA, Valli AA. Plant virus genome is shaped by specific dinucleotide restrictions that influence viral infectionMBio 2020; 11: e02818-02819

 

Fig.2RedA complex plant-virus interactive network modulates infectivity and symptom severity. Most plant viruses cannot infect all their potential hosts, and when they do, serious illness is not the norm, as revealed by recent metagenomic studies. Our laboratory studies this interaction network, which facilitates virus replication and propagation, but also induces plant defense responses and disease symptoms. Plum pox virus, our main subject of study, belongs to the family Potyviridae, the largest group of plant RNA viruses and causes sharka, a serious disease of stone fruit trees.

We are especially interested in defense responses related to RNA silencing and its viral suppressors. The typical silencing suppressor of potyvirids is HCPro, but the existence of additional silencing suppressors in different potyvirids, prompted us to suggest that escaping RNA silencing-mediated antiviral defenses is a powerful driving force of virus evolution. Potyvirid genomic RNAs are expressed through the synthesis of large polyproteins, processed by viral-encoded endopeptidases.

We are studying how host-specific modulation of this processing can contribute to potyviral pathogenicity and host range definition. Encapsidation of potyvirid genome is an active process. We have demonstrated a functional link between potyvirus RNA replication and virion assembly, and we are studying how posttranslational modifications of the capsid protein can contribute to sort the potyviral RNA into translation, replication or encapsidation. An important goal of our laboratory is applying our basic research results to control viral diseases through novel strategies. For instance, we are attenuating plant viruses by recoding their genomes in order to use them as cross-protection agents. We are also interested in developing other valuable biotools, such as a novel T-DNA delivery system, which can be used to efficiently inoculate plants with infectious viral cDNA clones, among other multiple applications.

  Fig.1Red

 

Garcia simon grupo 2018 

Name
Position
Contact
Juan Antonio García Principal investigator
Carmen Simón Principal investigator
Adrian Valli Ramón y Cajal researcher
Bernardo Rodamilans Postdoctoral scientist
Sandra Martínez Turiño Postdoctoral scientist
Alfonso González de Prádena Predoctoral scientist
Rafael García Predoctoral scientist
Beatriz García Technician
Irene Gonzalo Technician

¡Atención! Este sitio usa cookies y tecnologías similares.

Si continua navegando o no cambia su configuración, consideramos que acepta su uso. Saber más

Acepto

POLÍTICA DE COOKIES

Una cookie es un archivo de texto que se almacena en el ordenador o dispositivo móvil mediante un servidor Web y tan solo ese servidor será capaz de recuperar o leer el contenido de la cookie y permiten al Sitio Web recordar preferencias de navegación y navegar de manera eficiente. Las cookies hacen la interacción entre el usuario y el sitio Web más rápida y fácil.

Información general

Está página Web utiliza cookies. Las cookies son pequeños archivos de texto generados por las páginas web que usted visita, las cuales contienen los datos de sesión que pueden ser de utilidad posteriormente en la página web. De esta forma esta Web recuerda información sobre su visita, lo que puede facilitar su próxima visita y hacer que el sitio Web le resulte más útil.

¿Cómo funcionan las cookies?

Las cookies sólo pueden almacenar texto, por lo general siempre es anónimo y cifrado. No se almacenarán información personal alguna en una cookie, ni pueden asociarse a persona identificada o identificable.

Los datos permiten que esta Web pueda mantener su información entre las páginas, y también para analizar la forma de interactuar con el sitio Web. Las cookies son seguras ya que sólo pueden almacenar la información que se puso en su lugar por el navegador, lo que es información que el usuario ha introducido en el navegador o la que se incluye en la solicitud de página. No puede ejecutar el código y no se puede utilizar para acceder a su ordenador. Si una página web cifra la información de la cookie, sólo la página web puede leer la información.

¿Qué tipos de cookies utilizamos?

Las cookies que utiliza esta página Web se pueden distinguir según los siguientes criterios:

1. Tipos de cookies según la entidad que las gestiona:

Según quien sea la entidad que gestione el equipo o dominio desde donde se envían las cookies y trate los datos que se obtengan, podemos distinguir:

- Cookies propias: son aquellas que se envían al equipo terminal del usuario desde un equipo o dominio gestionado por el propio editor y desde el que se presta el servicio solicitado por el usuario.

- Cookies de terceros: son aquellas que se envían al equipo terminal del usuario desde un equipo o dominio que no es gestionado por el editor, sino por otra entidad que trata los datos obtenidos través de las cookies.

En el caso de que las cookies sean instaladas desde un equipo o dominio gestionado por el propio editor pero la información que se recoja mediante éstas sea gestionada por un tercero, no pueden ser consideradas como cookies propias.

2. Tipos de cookies según el plazo de tiempo que permanecen activadas:

Según el plazo de tiempo que permanecen activadas en el equipo terminal podemos distinguir:

- Cookies de sesión: son un tipo de cookies diseñadas para recabar y almacenar datos mientras el usuario accede a una página web. Se suelen emplear para almacenar información que solo interesa conservar para la prestación del servicio solicitado por el usuario en una sola ocasión (p.e. una lista de productos adquiridos).

- Cookies persistentes: son un tipo de cookies en el que los datos siguen almacenados en el terminal y pueden ser accedidos y tratados durante un periodo definido por el responsable de la cookie, y que puede ir de unos minutos a varios años.

3. Tipos de cookies según su finalidad:

Según la finalidad para la que se traten los datos obtenidos a través de las cookies, podemos distinguir entre:

- Cookies técnicas: son aquellas que permiten al usuario la navegación a través de una página web, plataforma o aplicación y la utilización de las diferentes opciones o servicios que en ella existan como, por ejemplo, controlar el tráfico y la comunicación de datos, identificar la sesión, acceder a partes de acceso restringido, recordar los elementos que integran un pedido, realizar el proceso de compra de un pedido, realizar la solicitud de inscripción o participación en un evento, utilizar elementos de seguridad durante la navegación, almacenar contenidos para la difusión de vídeos o sonido o compartir contenidos a través de redes sociales.

- Cookies de personalización: son aquellas que permiten al usuario acceder al servicio con algunas características de carácter general predefinidas en función de una serie de criterios en el terminal del usuario como por ejemplo serian el idioma, el tipo de navegador a través del cual accede al servicio, la configuración regional desde donde accede al servicio, etc.

- Cookies de análisis: son aquellas que permiten al responsable de las mismas, el seguimiento y análisis del comportamiento de los usuarios de los sitios web a los que están vinculadas. La información recogida mediante este tipo de cookies se utiliza en la medición de la actividad de los sitios web, aplicación o plataforma y para la elaboración de perfiles de navegación de los usuarios de dichos sitios, aplicaciones y plataformas, con el fin de introducir mejoras en función del análisis de los datos de uso que hacen los usuarios del servicio.

Herramienta de gestión de las cookies

Está página Web utiliza Google Analytics.

Google Analytics es una herramienta gratuita de análisis web de Google que principalmente permite que los propietarios de sitios web conozcan cómo interactúan los usuarios con su sitio web. Asimismo, habilita cookies en el dominio del sitio en el que te encuentras y utiliza un conjunto de cookies denominadas "__utma" y "__utmz" para recopilar información de forma anónima y elaborar informes de tendencias de sitios web sin identificar a usuarios individuales.

Para realizar las estadísticas de uso de esta Web utilizamos las cookies con la finalidad de conocer el nivel de recurrencia de nuestros visitantes y los contenidos que resultan más interesantes. De esta manera podemos concentrar nuestros esfuerzos en mejorar las áreas más visitadas y hacer que el usuario encuentre más fácilmente lo que busca. En esta Web puede utilizarse la información de su visita para realizar evaluaciones y cálculos estadísticos sobre datos anónimos, así como para garantizar la continuidad del servicio o para realizar mejoras en sus sitios Web. Para más detalles, consulte en el siguiente enlace la política de privacidad [http://www.google.com/intl/es/policies/privacy/]

Cómo gestionar las cookies en su equipo: la desactivación y eliminación de las cookies

Todos los navegadores de Internet le permiten limitar el comportamiento de una cookie o desactivar las cookies dentro de la configuración o las opciones del navegador. Los pasos para hacerlo son diferentes para cada navegador, se pueden encontrar instrucciones en el menú de ayuda de su navegador.

Si no acepta el uso de las cookies, ya que es posible gracias a los menús de preferencias o ajustes de su navegador, rechazarlas, este sitio Web seguirá funcionando adecuadamente sin el uso de las mismas.

Puede usted permitir, bloquear o eliminar las cookies instaladas en su equipo mediante la configuración de las opciones del navegador instalado en su ordenador:

- Para más información sobre Internet Explorer pulse aquí.
- Para más información sobre Chrome pulse aquí.
- Para más información sobre Safari pulse aquí.
- Para más información sobre Firefox pulse aquí.

A través de su navegador, usted también puede ver las cookies que están en su ordenador, y borrarlas según crea conveniente. Las cookies son archivos de texto, los puede abrir y leer el contenido. Los datos dentro de ellos casi siempre están cifrados con una clave numérica que corresponde a una sesión en Internet por lo que muchas veces no tienen sentido más allá que la página web que los escribió.

Consentimiento informado

La utilización de la presente página Web por su parte, implica que Vd. presta su consentimiento expreso e inequívoco a la utilización de cookies, en los términos y condiciones previstos en esta Política de Cookies, sin perjuicio de las medidas de desactivación y eliminación de las cookies que Vd. pueda adoptar, y que se mencionan en el apartado anterior.