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Unidad de Genómica

 

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UNIDAD DE GENÓMICA

  Responsable: José Manuel Franco Zorrilla
 
  Personal: Gloria García Casado
                     Eduardo Gil Vilariño
                     Marta Godoy Ciudad
                     Irene López-Vidriero
                     Iria Calvete Silva
                     Juan Carlos Oliveros Collazos
                     Juan Antonio García Martín
 
 Más información en nuestra web:
Unidad de genómica



DESCRIPCIÓN DEL SERVICIO

genomicaEl trabajo de la Unidad de Genómica se centra en el análisis de expresión génica o variación estructural mediante la hibridación en micromatrices (o “microarrays”) de DNA. Esta técnica permite comparar niveles de expresión génica de muestras biológicamente diferentes, interrogando el comportamiento de miles de genes al mismo tiempo para así poder determinar su función biológica.

La Unidad está dotada con el equipamiento necesario para realizar hibridaciones de 1 ó 2 colores de las plataformas de Agilent, Affymetrix y NimbleGen-Roche. Los soportes de estas compañías contienen una elevada densidad de puntos, de manera que permiten analizar de forma independiente y simultánea varias muestras, abaratando los costes del experimento. La Unidad ofrece otros servicios relacionados, como es el análisis de la integridad de RNA (Bionalyzer 2100 de Agilent) o la impresión “a la carta” de micromatrices a partir de colecciones de oligonucleótidos o DNAs aportadas por el usuario.

El análisis de los datos incluye la aplicación de los métodos estadísticos más comúnmente usados. Además, los resultados se ofrecen en forma de un visualizador interactivo de fácil interpretación por parte de los usuarios.

La Unidad también ha desarrollado algunas herramientas innovadoras para el análisis genómico, como es la identificación de la especificidad de unión de proteína-DNA, cuya aplicación se ofrecerá próximamente como servicio.

Los servicios que ofrece la Unidad de Genómica incluyen:

  • Asesoramiento en el diseño experimental.
  • Verificación del RNA de partida.
  • Marcaje de las muestras e hibridación de micromatrices.
  • Análisis de resultados.
  • Asesoramiento en la interpretación biológica de los resultados.