RESUMEN DE INVESTIGACION

Nuestro grupo está interesado en diferentes aspectos de la Bioinformática y la Biología de Sistemas. Nuestro objetivo es obtener conocimiento biológico siguiendo una aproximación in silico que complementa a las in vivo e in vitro de la Biología.

También colaboramos con grupos experimentales proveyéndolos con soporte bioinformático, y participamos en varias iniciativas de enseñanza.

Predicción de sitios funcionales y de unión en proteínas.

Hemos desarrollado métodos basados en evolución para la predicción de residuos con algún tipo de importancia funcional partiendo de secuencias y/o estructuras. Los métodos que desarrollamos en esta área aprovechan las huellas relacionadas con función dejadas por la evolución en secuencias y estructuras.

Predicción de interacciones entre proteínas.

Las funciones de muchas proteínas solo se pueden explicar en el contexto de sus interacciones con otras. Hemos desarrollado métodos de base evolutiva para la predicción de compañeros de interacción que han sido ampliamente aceptados y seguidos por la comunidad. Esos métodos están basados en la hipótesis de que las proteínas interaccionantes o funcionalmente relacionadas tienden a co-adaptarse durante el proceso evolutivo (co-evolución).

Estudio funcional de redes biológicas.

El estudio de los fenómenos biológicos desde un punto de vista sistémico está proporcionando conocimiento que nunca se podría haber obtenido del estudio detallado de los componentes individuales (genes, proteínas...) Como prototipo de sistemas complejos, en muchos sistemas biológicos “el todo es más que la suma de las partes”. Nosotros estudiamos las redes metabólicas y las redes de interacción entre proteínas con este nuevo enfoque.

Soporte bioinformático para grupos experimentales.

Muchas herramientas bioinformáticas pueden ser fácilmente usadas por la comunidad a través de interfaces web. Sin embargo, otras son más difíciles de usar o interpretar sus resultados no es trivial. Además, muchos protocolos bioinformáticos son difíciles de implementar en herramientas automáticas y requieren intervención manual o conocimiento experto para llevarse a cabo. Nosotros damos a los grupos experimentales soporte bioinformático, especialmente en el área de análisis de secuencias (detección de homología remota, identificación de dominios, evolución funcional, etc.).