Jefe de Departamento: Fernando Rojo.

La investigación del Departamento de Biotecnología Microbiana está centrada en microorganismos con relevancia clínica o medioambiental, tratando de conectar la generación de conocimiento con el desarrollo de aplicaciones biotecnológicas. El trabajo incluye varias aproximaciones basadas en biología molecular, genómica, proteómica y metagenómica, con ayuda de biología sintética y de sistemas. El Departamento está organizado en doce grupos de investigación, cuyos objetivos cubren cinco aspectos complementarios de la biología de microorganismos:

• Microbiología mediaombiental. Tratamos de entender cómo los microorganismos degradan compuestos orgánicos que generan problemas ambientales, y por que un microorganismo que puede degradar eficientemente un compuesto de interés en condiciones de laboratorio frecuentemente es menos eficaz en condiciones naturales. Esto permitirá optimizar estrategias de biorremediación dirigidas a reducir el impacto de contaminantes en el medio ambiente.
• Patógenos microbianos. Los esfuerzos están dirigidos a entender cómo los microorganismos patógenos infectan o invaden un huésped eucariota, con especial énfasis en las interacciones que ocurren entre el patógeno y la célula infectada. El trabajo está centrado tanto en bacterias intracelulares como en hongos fitopatógenos. Entender estos procesos facilitará la búsqueda de nuevas estrategias para combatir infecciones, y nuevas dianas para desarrollar antibióticos frente a microorganismos relevantes para la salud humana y la agricultura.
• Resistencia microbiana a los antibióticos y búsqueda de nuevos antimicrobianos. La resistencia de las bacterias a los antibióticos es un problema grave que está derivando en una creciente disminución de la eficacia de las herramientas disponibles para combatir infecciones. Las investigaciones en curso tratan de entender los mecanismos por los que las bacterias se vuelven resistentes a los antibióticos, y como responden las bacterias cuando están expuestas a concentraciones sub-letales de antibióticos. Además, buscamos nuevas dianas potenciales que permitan desarrollar antibióticos diferentes.
• Respuesta de los microorganismos a ambientes hostiles. El objetivo es entender cómo responden las bacterias a situaciones estresantes, por ejemplo cuando se enfrentan a los sistemas de defensa de los organismos que infectan, o a diferentes agentes que dañan el ADN. Estudiamos cómo los patógenos oportunistas se adaptan para sobrevivir en los organismos que infectan, evadiendo su respuesta inmune, y cómo las bacterias y hongos replican y reparan su ADN para mejorar la estabilidad de su genoma. Esto permitirá combatir mejor los microorganismos patógenos .
• Ingeniería microbiana. El propósito es generar cepas bacterianas optimizadas para obtener productos de interés (anticuerpos recombinantes, enzimas hidrolíticas o compuestos antimicrobianos), o para detectar y degradar compuestos contaminantes.

NUESTRAS LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN:

• Estabilidad genética. Juan Carlos Alonso.
• Replicación dependiente de recombinación homóloga. Silvia Ayora.
• Estrés y evolución bacteriana. Jesús Blázquez.
• Ciclo celular, replicación del DNA y estabilidad del genoma en eucariotas. Arturo Calzada.
• Secreción de proteínas y expresión de anticuerpos. Luis Ángel Fernández.
• Biología celular y molecular de patógenos bacterianos intracelulares. Francisco García-del Portillo.
• Patógenos oportunistas. José Luis Martínez.
• Mecanismos moleculares de la virulencia fúngica. José Pérez Martín.
• Expresión génica y secreción heteróloga en bacterias Gram-positivas de aplicación industrial. Rafael Pérez Mellado.
• Regulación del metabolismo de hidrocarburos en bacterias. Fernando Rojo.
• Modelado de comunidades microbianas. Javier Tamames de la Huerta.
• Control genético del ciclo celular. Miguel Vicente.