A lack of p38γ and p38δ increases the efficiency of innate immune cells against systemic Candida albicans infection. This lack also reduces the elevated inflammation behind organ damage. Drugs that inhibit these proteins have potential use as therapy against systemic candidiasis, a condition affecting thousands of people each year worldwide.
The hormone triggers the defense response in non-vascular plants against such external stresses as pathogens and insects. Led by researchers from the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC (CNB-CSIC), the study has also identified the key steps in the synthesis of the hormone and the signaling pathway governing the activation of the plant defense response.
A study shows that the CXCR4 chemokine receptors form aggregates in the cell membrane to be activated and carry out their function. This aggregation process is regulated by the presence of a ligand, by membrane proteins, and by the cytoskeleton. Preventing the formation of these aggregates might be used as a therapeutic strategy against HIV, tumour metastasis, or autoimmune diseases
TIE1 promotes branching in Arabidopsis, leading to bushier plants. TIE1 carries out this function by interacting with BRANCHED1, another protein widely studied for its role in modulating plant architecture. Defining the processes that modulate branching in crop species might help to optimise agricultural production.
¡A new device enables lateral stretching of DNA molecules by applying force in a very controlled manner. Combining this technique with advanced fluorescence microscopy methods allows experiments that require visualization of DNA while it is being manipulated. This integration of state-of-the-art technologies is a powerful tool for molecular biology and biophysics studies.
A study funded by the Fundación Domingo Martínez shows that the protein superoxide dismutase 3 (SOD3) is essential for reprogramming the blood vessels that supply tumours and enhance the effect of antitumour drugs. The results, published in the journal Nature Communications, open a new route to improving the effectiveness of existing cancer treatments
Tumour cells with a large number of mitochondria are more sensitive to chemotherapy. This might explain why some cells die after anti-tumour treatment while others that are genetically identical can survive and cause the cancer to reappear. Mitochondria number might be used to predict patient sensitivity to a specific treatment.
The ParB non-specific binding domain for DNA and other proteins allow it to organize and condense the genetic material for bacterial division. This domain is described by scientists from the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) in a recent study in the journal eLife.
BMI1, a protein linked to stem cell maintenance in the heart, changes function in cell damage conditions and promotes cardiac stem cell differentiation. These findings are reported by scientists from the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) in a paper published in the journal Cell Death & Differentiation.
The external surface of some viruses that infect fungi have unanticipated enzyme activity. This is the conclusion of a study published in the journal PLoS Pathogens that analyzes the capsid structure of double-stranded RNA fungal viruses. Evolving to acquire these new functions would have allowed the viruses to establish a symbiotic relationship with their hosts
Plants use an alternative, previously unknown route to produce jasmonate. This hormone is of great importance in defence against pathogens and in stress situations. Unravelling the details of phytohormone production mechanisms can help to obtain more efficient, resistant crops
A study by scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) describes a new division system in Salmonella. This pathogenic bacterium uses this mechanism when it finds an acidic environment within the cell it has infected. The existence of this second division system, an alternative to that which was previously considered unique, offers possibilities for the development of antibiotics to fight intracellular infections.
Más de 600 invitados de todas las edades han participado presencialmente en las celebraciones del vigesimoquinto cumpleaños del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC. A ellos se suman más de 6000 visitantes virtuales que, a través del nuevo blog de divulgación, el boletín de noticias y diez nuevos audiovisuales, han participado este año de la ciencia y las celebraciones del centro. Todas las actividades quedan enmarcadas por una exposición que recoge la historia del CNB-CSIC en los últimos 25 años.
The structure of encapsulins –semiorganelles found in some species of bacteria– has been deciphered using electron cryomicroscopy techniques. In vitro and in vivo experiments show that these semiorganelles are very stable and functional. Encapsulins could be useful for biotechnological applications such as biosensors or as vehicles for controlled drug release.
On 20 December 2017, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 25th edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad.
During the whole day, we will host short talks by young postdoctoral scientist working abroad. Attendance is free and open to everybody.
Next 18 and 19 December, researchers from the different departments from CNB will explain their last scientific results at the XXV edition of the CNB Scientific Workshop that traditionally takes place before Christmas.
This year, same as last one, the programme includes participation by the PhD students from the CNB. Ther will be two sessions in which the young scientist will participate with short talks and two poster session during wich they will explain their work.
A study published in Nature Communications indicates that CD4+ T lymphocytes are able to act as antigen-presenting cells. This function could be exploited to develop a new generation of immunotherapies against cancer. This technology is protected by patent and has a business project to bring it to the market.
Mariano Esteban, investigador del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC), fue nombrado el pasado 31 de octubre presidente del Instituto de España (IdeE), institución considerada “el senado de la cultura española”.
Mariano Esteban es también, desde 2012, presidente de la Real Academia de Farmacia. El IdeE engloba las diez reales academias nacionales y se considera el máximo órgano exponente de la cultura española en el orden académico.
Mariano Esteban es pionero en el campo de las vacunas. Destacan sus trabajos con enfermedades víricas y parasitarias como el sida, la hepatitis C, chikungunya, malaria o leishmaniasis. Fue director del CNB de 1992 a 2003 donde continúa realizando su trabajo como investigador.
An organelle produced by the influenza virus transports the molecules of its genome needed to manufacture new viruses. The study involves a change in our knowledge of the virus that could lead to new drugs to combat it.
A study led by scientists from the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC finds fundamental genes for altering the intestinal mucosa. The research is a step toward development of an effective vaccine against Escherichia coli intestinal infections.
Scientists of the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC have identified a treatment that could end infections caused by antibiotic-resistant bacteria. The study, published in the journal Cell, used one of the most deadly bacteria, Staphylococcus aureus.
In the face of candidiasis, monocytes readjust their metabolic processes to optimize the organism’s defensive response. This discovery suggests potential new therapeutic targets against one of the main pathogens that affects humans
Los centros centros y unidades distinguidos con las acreditaciones Severo Ochoa y María Maeztu, entre los que se encuentra el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, unen fuerzas con la creación de la nueva Alianza de Excelencia Severo Ochoa y María de Maeztu. El principal objetivo de esta iniciativa es promover y fortalecer internacionalmente a los centros y unidades acreditados con esta distinción, así como dar mayor visibilidad a la investigación que realizan.
A new method allows the design and construction of nanometric cages using proteins. The structures are able to self-assemble inside cells and living beings. This protein “origami” could have applications in the development of new methods for administering drugs, vaccines, or molecular machines
On 20 December 2017, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 25th edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad. Open call for talk proposals until November 30th.
Lower levels of defective viral RNA molecules can make influenza viruses that affect humans more dangerous. This finding could help to guide patient treatment and provide important information for the design of influenza prevention strategies. The study, led by Dr. Ana Falcón in the laboratory of Dr. Amelia Nieto, has just been published in the journal PLoS Pathogens
A study of Staphylococcus aureus infections shows that bacterial populations are organized as “microbial cities”. Some bacterial subpopulations secrete toxins, others adhere to organs, and others combat the immune system
El segundo de los actos que celebran el 25 aniversario del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC) se celebrará el próximo viernes 27 de octubre. En la jornada participarán como ponentes algunos de los más prestigiosos científicos del mundo en las áreas de biología molecular, microbiología, biología estructural, biología de sistemas y virología.
Next September will begin the XXII CNB Seminar Series and the XI CNB Junior Seminar Series at the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC
This course, the Series will be inaugurated by Prof. Fernando Martín (IMDEA Nanociencia and UAM) and includes 20 speakers considered international reference in different areas of research in Life Science.
The talks will be held on Fridays at noon in the CNB Conference Room.
On August 31 and September 1, young European scientists will meet to discuss the possibilities that synthetic biology offers for building the society of the future. The EUSynBio 2017 Symposium will take place in Madrid at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC. Over these two days, there will be discussions of science and new strategies against environmental pollution, but also of the legal, ethical and social aspects of synthetic biology
A new perspective is needed that assesses pollution problems in all their complexity, as well as possible solutions for effective bioremediation strategies. Systems biology and synthetic biology offer the necessary tools to implement this new approach. This strategy opens the door to the use of microorganisms to reduce global problems such as climate change
Los microorganismos resistentes a antibióticos necesitan readaptar sus procesos metabólicos para no perder capacidad de supervivencia. Bloquear estos procesos de reorganización de la maquinaria interna de las bacterias puede ofrecer nuevas estrategias en la lucha contra los patógenos resistentes a antibióticos.
The high mutation frequency of some immunodeficiency genes determines the probability of changes that reverse the genetic defect that causes the disease. This is what researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) observed when analyzing in vitro the T lymphocytes of a patient with a primary immunodeficiency
Experts from across the continent recommend establishment of a European committee to review and evaluate the uses of new genetic tools. The new techniques are inexpensive, simple, rapid and have greatly expanded the range of potential applications; they are also moving millions of euros. Scientists consider it is time to launch a debate on the ethical and social implications of these tools, and to legislate their use and applicability.
Miguel Vicente, microbiólogo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC), ha sido elegido vocal de la International Union of Microbiological Societies (IUMS). El científico apoyará a la nueva presidenta de IUMS para reforzar la conexión con las sociedades y las federaciones regionales, y será responsable de promover el conocimiento público de la Microbiología.
“100xCiencia.2” tendrá lugar del 2 al 3 de noviembre de 2017 en Alicante. Acudirán destacados científicos de 40 centros y unidades de investigación “Severo Ochoa” y “María de Maeztu”, respectivamente. La inscripción al congreso ya está abierta en la página web del evento.
A team of scientists has described a new association system between proteins that form signaling complexes involved in activating immune system cells. The assembly model involves a network of several aromatic amino acids at the transmembrane regions of the proteins in the complex
An article published today in the journal Immunity describes the strategy used by cells of the innate immune system against a generalized fungal infection. The authors establish the spleen as a key organ that activates the defences responsible for terminating the Candida fungus that colonizes the whole body. The study shows the role of IL-15 in this process and opens a path to new, more effective therapies for fungal infections.
A study published today in the journal PNAS describes what happens at the atomic level when a double-stranded nucleic acid molecule is stretched. Using computer simulation, scientists found a way to explain why DNA coils when it is stretched, whereas double-stranded RNA unwinds. This type of simulation could lead to powerful tools that will help to understand how the structural properties of nucleic acids influence their biological function.
According to a study lead by researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC the same genes that are activated in the absence of nutrients also induce the dormant state in plant buds to stop the formation of new branches. This pattern of gene expression to prevent growth in fasting situations is detected in both herbaceous and in woody plants.
A team of researchers reveals the machinery that allows viruses that affect bacteria (or phages) to multiply. Scientists have shown that Sak and Sak4 proteins are essential for the DNA replication of phages that infect some clinically relevant bacteria. These viruses are partly responsible for the ability of pathogenic bacteria to cause infection in humans.
For years, p38γ and p38δ have been largely unknown, and have only recently begun to capture scientists’ attention. Researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) study these proteins and review the latest work on them in an article published this week in the journal Trends in Biochemical Sciences. The authors highlight the role of these two unknowns in certain diseases and discuss their potential in the development of new treatments.
Un estudio localiza la región celular donde se ensamblan estos virus, que pueden afectar gravemente a pacientes inmunodeprimidos, y visualiza cómo se forman. El hallazgo puede ayudar a diseñar antivirales para tratar enfermedades, así como virus que sirvan como herramientas terapéuticas.
El primero de los actos que celebran el 25 aniversario del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC) se celebrará el próximo viernes 5 de mayo. En la jornada participarán como ponentes antiguos miembros del CNB-CSIC que se han convertido en líderes en investigación e innovación biotecnológica. Presidirán la inauguración del acto la Secretaria de Estado Carmen Vela, el vicepresidente de CSIC Jose Ramón Urquijo y el Rector de la UAM José María Sanz, junto a miembros del equipo directivo del CNB-CSIC. El encuentro servirá de marco para la inauguración de una exposición que relata los 25 años de historia del centro.
The Calmette-Guérin bacillus is the treatment of choice for the most common type of bladder cancer. According to a study led by researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC, this bacterium activates the patient's natural killer cells, which are ultimately responsible for eliminating the tumor cells. Understanding the mechanism of action of this therapy could help to design new protocols and customize treatment of these cancers.
El ensayo clínico fase I de un procedimiento de vacunación basado en varios componentes combinados contra el virus VIH, causante del SIDA, ha concluido. La vacuna testada incluye un vector de ADN, un vector viral atenuado MVA y un componente proteico. Los resultados indican que el procedimiento de vacunación más efectivo consiste en administrar cada uno de los componentes por separado. El componente viral MVA ha sido desarrollado en los laboratorios del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC.
Different forms of the DIDO protein regulate activation of the differentiation process in embryonic stem cells. Advances in regenerative medicine require a closer look at stem cell biology and the molecular mechanisms that govern their activity. The study has been published in the scientific journal Stem Cell Reports.
Anna Tramontano, pionera de la biología computacional y estimado miembro de Comité Científico Asesor del CNB falleció el pasado 9 de marzo. El centro pudo contar con su valiosa experiencia y consejo en varias de sus evaluaciones, la última hace ahora un año.
Profesora de bioquímica en la Universidad de Sapienza de Roma, Anna Tramontano dedicó su vida a la investigación y fue una de los mayores exponentes de la bioinformática en todo el mundo. Permanecerá presente en la memoria de todos por su entusiasta dedicación y valiosas aportaciones a la ciencia. D.E.P.
El próximo 7 de abril se celebrará en el CNB-CSIC el Workshop Mycobacterium: Molecular Microbiology organizado por los investigadores Miguel Vicente y Susanne Gola. El workshop contará como ponente invitada con Sabine Ehrt, del Weill Cornell Medical College de Nueva York. Junto a ella, otros siete ponentes completarán el panel de expertos que participará en el workshop.
Pulmonary inflammation associated with the severe acute respiratory syndrome (SARS) is caused in part by tiny RNA molecules produced by the virus. Infected rodents treated with inhibitors of these small RNAs reduced lung inflammation. These findings could lead to new forms of therapy for patients affected by the disease.
Con motivo del Día Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia, los estudiantes de 6º de primaria del Colegio Príncipe de Asturias entrevistaron a cuatro investigadoras del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC). Susanna Manrubia, Ana Cuenda, Silvia Hormeño y Carmen Simón se sometieron a todas sus preguntas. Estas son algunas de ellas.
El Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB-CSIC) participa en un proyecto europeo cuyo objetivo es controlar la replicación del virus del sida sin necesidad de utilizar terapia con antirretrovirales.
The miniprotein Prli42 assists anchoring of the stressosome, a macrocomplex that acts as an antenna, to the bacterial membrane. The discovery, made with the participation of the Centro Nacional de Biotecnología (CNB) of the CSIC and the Universidad Autónoma of Madrid (UAM), was possible via a massive identification of the initial (N-terminal) residue of proteins produced by an organism.
Throughout 2017, a whole range of scientific events, outreach activities other events will take place to celebrate the 25th aniversary of the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC.
An article published in Nature Communications shows that some microorganisms have a hitherto unknown system for detection and correction of errors in the genetic material. This mechanism prevents some bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis, from easily developing resistance to antibiotics. This research opens the door to the development of new strategies to combat antibiotic resistance of pathogenic bacteria. It can also be used to improve performance in biotechnological processes of industrial interest
One of the basic features that farmers must manipulate to improve crop yield is the branching pattern in plants. CNB-CSIC researchers have identified several genes that regulate new branch formation as a function of ambient light. Detailed knowledge of these molecular processes is important for developing methods to control plant growth and optimize agricultural production
On 22 December 2016, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 24th edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad.
During the whole day, we will host short talks by young postdoctoral scientist working abroad. Attendance is free and open to everybody.
Next 20 and 21 December, researchers from the different departments from CNB will explain their last scientific results at the XXIV edition of the CNB Scientific Workshop that traditionally takes place before Christmas.
This year, same as last one, the programme includes participation by the PhD students from the CNB. Ther will be two sessions in which the young scientist will participate with short talks and two poster session during wich they will explain their work.
All the experts who participated on 23 November in the Global ImasT agree: we must take action or we will miss the train of modernity. A new collaborative model is needed between the public and private sectors to promote entry of venture/risk capital into the country, as well as a commitment by the political class to innovation and to education that awakens adventurous talent and enhances entrepreneurial spirit.
"It is imperative to undertake, to act and to do. We must stand on tiptoe and look at the horizon. We must learn to dream," says Iñaki Gabilondo.
The Flow Cytometry Service at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) has been designated by Beckman Coulter as a Flow Cytometry Reference Centre. This nomination recognizes the quality of the work by the service, which will form part of a European network of leading centres in this technique.
A collaborative strategy among weaker communities leads to a more beneficial overall outcome than submission to the strongest community. In addition, the weaker competitors in a network of networks hold the fate of the group in their hands, independently of the actions of the most powerful. This is the finding of a study recently published in the journal Nature Communications. Microcredit networks among the peoples of India, collaboration among groups for Ebola research, or conservation of fragmented habitats such as that of the Pyrenean brown bear are just some examples in which this model is applicable.
The event will take place simultaneously on 23 November at 12 venues to activate the ecosystems of innovation and entrepreneurship in Spain. The 4th Edition of Global I + T will be inaugurated by the journalist Iñaki Gabilondo. Daniel Isenberg will be among the primary speakers of the day. At the CNB-CSIC, participating speakers will include as Ion Arocena (director of ASEBIO) and Enrique Castellón (CRB Inverbio), to promote synergies among the various stakeholders in the biotechnology sector.
The new INPhINIT programme promoted by the Obra Social "la Caixa" will finance three-year contracts for 57 students to carry out doctoral studies in leading research centres in Spain. Among other possibilities, the candidates can opt for one of the 36 project proposals in laboratories at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC).
The European Commission recently granted eight million euros to develop a project called Rafts4Biotech, coordinated by Daniel López from the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC). The project involves 12 institutions from all over the continent that seek to exploit the lipid rafts in synthetic bacteria to optimise processes of interest to the pharmaceutical, cosmetic and food industries.
For the third consecutive year, QUO magazine has selected the 12 most prominent researchers in Spanish science. Among them is Mariano Esteban, a virologist at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC), who runs the poxvirus and vaccines laboratory at the centre.
On 22 December 2016, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 24th edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad. Open call for talk proposals until November 30th.
El pasado viernes día 30 de septiembre, los científicos del CNB-CSIC se unieron a las celebraciones europeas por la Noche de los Investigadores. El centro se convirtió por unas horas en un escenario hollywoodiense el que público de todas las edades pudo interaccionar con los investigadores para descubrir los secretos de la ciencia escondida detrás de superproducciones de ciencia-ficción como Blade Runner, Avatar o Marte.
The rhodopsin, a protein almost unknown until a few years ago, allows many marine bacteria and archaea to capture the sun's energy and use it to grow faster and survive in the absence of nutrients. An article with the participation of the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC (CNB-CSIC) reviews all the studies done to date about these microorganisms. The analysis reveals the importance of rhodopsin in marine ecology and its great potential for biotechnological applications.
Next October will begin the XXI CNB Seminar Series and the X CNB Junior Seminar Series at the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC
This course, with the sponsorship VWR, the Series will include 21 speakers considered international reference in different areas of research in Life Science. Also, this year will take place two scientific workshops.
The talks will be held on Fridays at noon in the CNB Conference Room.
Next Monday September 26 the CNB will celebrate a symposium in honor of Juan Ortín. The virologist has belonged to the CNB since its beginings. For his retirement, the center brings together some of the best virologists in a symposium held in his honor under the title "Old and New Perspectives in Virology". In this event will participate as speakers Richard Randall of the University of St Andrews (UK), Fernando Rojo, Jaime Martin-Benito, Luis Enjuanes and Mariano Esteban, all of them from the CNB.
The protein RepC only acts on negatively supercoiled plasmids (circular DNA molecules present in bacteria), this means, twisted in counter to the normal winding direction of the double helix. This is the conclusion of a recently published study by researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC). The work sheds light on the mechanism of replication of these circular DNA molecules that, among other things, allow certain bacteria become resistant to antibiotics.
A recent study found that Salmonella -an intracellular bacterial pathogen that infects humans- promotes the elimination of some of the bacteria inside the eukaryotic cell taking advantage of a process called aggrephagy. This way, the pathogen effectively controls the size of its progeny. This mechanism prevents the death of the host cell by an excessive number of bacteria inside it and promotes persistent infection over time.
A study conducted jointly by scientists from the United States and Spain shows how Hsp70 chaperones work. As if they were nanomachines, the Hsp70 generate force on other proteins through collisions and stretching, to break bonds between them or transport them through the membranes of different cell compartments.
Two outstanding representatives of CRISPR-Cas have come together to tell the story of a technique that, based on a secret closly guarded by bacteria for millions of years , has revolutionized the world of genetic editing. In a review article, the authors pay homage to basic research that, sooner or later, yields benefits.
Scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) have identified p21 as a key player in regulating inflammation. This protein controls macrophage transformation from an active, proinflammatory state to an anti-inflammatory, healing role. Maintaining an adequate balance of activation in the immune system is essential for coping with conditions such as sepsis, cancer or autoimmune disease
Scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) and the ALBA Synchrotron have developed the 3D map of the interior of cells affected by the hepatitis C virus. They could observe the changes caused by the hepatitis C virus in the endoplasmic reticulum and mitochondria of infected cells. These defects were reversed by treatment with the most common antiviral drugs for hepatitis C.
Marginal zone lymphomas are tumours that affect B cells. There are several types, but they are rare and there is no specific treatment for them. An international study shows that an excess of the protein NKX2-3 promotes development of these cancers by altering normal B lymphocyte activity. The study suggests new targets for the treatment of these lymphomas and offers a new model for research on the disease.
The European consortium CARE-MI has released the first results of its phase I/II clinical trial with cardiac stem cells for large myocardial infarction. At six months post-treatment, initial results indicate that the treatment is safe. The final results on safety and efficacy will be made public in 2017
The Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) participates as a collaborator institution in three of the best Spanish masters, according to the annual ranking published by El Mundo.
Next Monday 27 of June will take place for the second consecutive year the Workshop by CNB PhD Students.
Starting at 14.30pm, two PhD representatives from each CNB department will give a short talk addressed to their fellows. This workshop is specifically addressed to the PhD CNB community.
Roberto Solano, of the Centro Nacional de Biotecnología, is among 58 researchers named today as new members of EMBO. This distinction is awarded annually to outstanding scientists worldwide in recognition of their research excellence in the life sciences
Breaking-Cas is a web tool, developed at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC), that facilitates the design of gene editing experiments using the well-known CRISPR/Cas technique.The programme enables the design of the guide RNA (gRNA) needed for this technique, which is specific for each experiment.The software will allow researchers around the world to carry out CRISPR genome editing in nearly 700 eukaryotic organisms.
Bioinformaticians at the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) have developed a new version of MBROLE, a web server that analyses the results of metabolomics studies. This tool allows interpretation and helps to make biological sense of the lists of hundreds of metabolites that molecular biology techniques obtain for an organism.
The Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) joins the celebrations of World Intellectual Property Day that will take place around the world on Tuesday, 26 April. Three speakers from the biotechnology industry will share their experiences on the role of intellectual property in their business models
Juan Ortín is a pioneer in the structural and functional analysis of replication and gene expression in influenza virus. His research lines have been central to understanding this virus. Ortín has formed part of the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) since its opening in the 1980s.
On 18 and 19 April, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) welcomes the first Congress of the AdenoNet network. This conference will bring together leading scientists in research on adenovirus, a virus that can cause disease but can also be useful for new therapeutic treatments. The congress will address the use of these viruses in gene therapy, virotherapy for cancer, as well as their pathology and molecular structure.
The Andigena potato variety produces its tubers in winter, when days are short and temperatures are low. Scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) have discovered the molecular mechanism that allows the plant to identify day length and start tuberization. The UN considers the potato as a key food in the fight against hunger. Understanding the molecular mechanisms that govern its life cycle could be useful for adapting its growth to warm tropical areas where yields are much lower.
Histones regulate the organisation of DNA throughout the cell cycle. Changes in these proteins determine the degree of compaction of the genetic material and expression of its genes. This is what is termed epigenetics: information not contained in the genes but that influences them. Scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) have analysed how the combination of several modifications allows epigenetic information to be maintained when cells divide.
The brain consumes 20% of the energy produced by our body. This organ holds many secrets and the scope of its function is still being studied. Neurological disorders are diseases of the central and peripheral nervous systems. With population aging, diseases such as epilepsy, multiple sclerosis, migraine, Alzheimer's or Parkinson's affect more and more people. Hundreds of millions of patients worldwide suffer from these diseases.
The proposal of the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC and the University of Santiago de Compostela is one of the six winning projects of the Discovery Fast Track programme of the company GSK. The initiative is focused on searching new drugs against cancer.
3 million Spaniards suffer from one of the diseases classified as rare. Albinism is one of these and affects 1 in every 17,000 inhabitants. At the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), Lluis Montoliu’s laboratory seeks to broaden our knowledge of this disease to improve diagnosis and find customized therapies for these patients. The CNB-CSIC joins the celebration of this day to promote understanding and social awareness of these diseases.
The deregulated expression of a micro-RNA identified as miR-148a facilitates the development of autoimmune diseases such as lupus. This is shown in a study published in the journal Nature Immunology with the collaboration of scientists from the USA and the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC).
The European Research Council has awarded Fernando Moreno a Consolidator Grant. The amount granted amounts to nearly €2 million, which will allow him to consolidate his research group over the next five years and continue to develop their studies.
The research group led by Dr Mar Valés-Gómez at the National Center for Biotechnology (CNB-CSIC), has filed at the Spanish Patent and Trademark Office a new patent application for a method which predicts and monitors the therapeutic response of bladder cancer patients to anti-cancer immunotherapy based on the intravesical administration of Bacille Calmette-Guérin (a very common treatment for this condition).
This new method has been developed together with scientists from the Hospital Infanta Sofía (Madrid) and the National Institute for Biological Standards and Control (NIBSC) from UK.
The method consist in a urine analysis and in is simpler, more reliable, and less invasive than other alternative methods. It is useful for predicting bladder cancer recurrence following treatment before new tumor cells are released to the urine, allowing early selection of patients for alternative anti-cancer therapies.
The Community of Madrid has awarded the Miguel Catalán Prize for researchers under 40 years to Fernando Moreno, a researcher at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC).
Spanish researchers from ten centers, among them the group of Mar Valés at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC), have joined to form the Network of Excellence and Innovation in Exosomes (REDIEX in its Spanish initials). This initiative aims to promote the development of new therapeutic strategies for cancer and parasitic diseases.
The carnivorous plant known as the Venus flytrap knows how to count, and uses this ability to decide when to trap and digest their victims. This is shown in a study published in Current Biology in which researchers from the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) participated, with scientists from German and Australian centres.
Media
The laboratory of researcher Mariano Esteban, at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC), forms part of the new European alliance for a vaccine against HIV (EHVA). The association is made up of 39 institutions from around the world and funded with 28.2 million euros. Its aim is to foster the development of new preventive and therapeutic approaches with which to face the challenge of HIV/AIDS.
Researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) have published a study in the journal Nucleic Acids Research that sheds light on the molecular mechanism used by bacteria to incorporate changes into their genome through horizontal gene transfer.
It has been granted in the United States (US) a patent which is being developed at the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC (CNB-CSIC) by the former group of researchers led Juan Pablo Albar.
The patent was granted in Europe in 2013. Proteobotics, a spin off of the CSIC headed by Antonio Ramos, has a development contract with an option to license this patent.
The patent is a method to integrate data from mass spectrometry which greatly increases the performance in identifying peptides and proteins
Researcher Roberto Solano, of the CNB-CSIC Department of Plant Molecular Genetics, is among the most influential scientific minds in the world for the second consecutive year according to Thomson Reuters.
Researchers at the Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), in collaboration with other European centres, have reconstructed the three-dimensional structure of the CCR4-NOT complex. CCR4-NOT consists of eight proteins involved in cell division. Its malfunction can lead to serious problems such as cardiomyopathy or various types of cancer
A study by researchers at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) indicates that postnatal brain activity is essential for establishing connections between the two hemispheres. Cux1 and Kv1 are two proteins involved in this process. Their absence leads to a “wiring” defect similar to that seen in mental disorders such as autism. According to the study, in rodents there is a time period after birth in which it would be possible to recover the lost connections
Media
Last 14th January 2016 the Royal Academy of Pharmacy of Spain celebrated the Solemn Opening Session for the Academic Course 2016. During the event, the researcher Mariano Esteban from the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) took office for a second consecutive term as president of the Royal Academy of Pharmacy of Spain.
Doctor Pablo Gastaminza, from the Department of Molecular and Cellular Biology and on behalf of the research group led by Dr. Xavier Forns in the Hospital Clinic in Barcelona, attended yesterday the Awards Ceremony for the winner projects of the third edition of the Research projects in HIV, Hepatitis and Hematology-Oncology 2015 Fellowship Program by the pharmaceutical Gilead. Dr. Gastaminza will be on board for a project called “Virological and immunological factors associated with hepatitis C and hepatitis B virus infection recurrence after treatment discontinuation”. He will contribute by providing his experience and reagents required for the study of the genetic and phenotypical characteristics of the hepatitis C virus, isolated from patients who suffer from reoccurring infections after the completion of their treatment with direct-acting antivirals.
On 22 December 2015, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 23rd edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad. Attendance is free and open to everybody.
Next 15 and 16 December, researchers from the different departments from CNB will explain their last scientific results at the XXIII edition of the CNB Scientific Workshop that traditionally takes place before Christmas.
Researchers from several European centres have announced the end of the patient recruitment phase for the CAREMI clinical trial. This assay hopes to confirm the safety and efficacy of a new therapy based on donor-derived allogeneic stem cells to treat myocardial infarction patients. Preliminary data are promising, although the final results are expected in 2017.
Natural killer (NK) cells are white blood cells that detect and eliminate virus infections. Unlike T cells, they need not have seen the virus previously to be able to respond (they form part of the innate immune response); to be effective, however, they must undergo a very precise maturation process. Thanks to the study of a patient with congenital immunodeficiency due to the lack of the gene that encodes CD247, a protein essential for T cell receptor assembly, CNB-CSIC researchers found that this protein is also indispensable for correct NK cell maturation.
On november 25th the CNB will participate in the Global ImasT, an event dedicated to technological innovation that will take place at a national level. Other 14 institutions, among wich some of the best universities and research centres can be found, will participate in the event.
Two scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of CSIC are among the 14 young researchers selected to participate in the program ComFuturo. Their projects will be funded during three years by CSIC and other eight private institutions that sponsor the initiative.
Scientists at the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) have developed a vaccine against SARS. This new version of the vaccine solves the safety problems of the previous prototype and continues to provide full protection against the disease in mouse models.
Media
Nine senior African women researchers will be deepening and sharing knowledge in prestigious Spanish institutions through Women for Africa’s project "Science by Women".Thirty entries from all over Africa applied for the selection process. Two of the selected researchers will stay at the laboratories of the CNB.
On 22 December 2015, the Centro Nacional de Biotecnología of the CSIC (CNB-CSIC) will hold the 23rd edition of the traditional conference Advances in Molecular Biology by Young Researchers Abroad.
The CNB aims to incorporate up to eleven postdoctoral scientists through two-year working contracts, financed by a Severo Ochoa Centres of Excellence grant
To proliferate, bacteria such as Escherichia coli form a ring that constricts the membrane until the original cell becomes two. The FtsZ protein is the basis of this structure, but the process would not be possible without the support of many other proteins. In a recent article, CNB-CSIC researchers explain how this group of proteins is coordinated so that nothing goes wrong.
CNB scientists have shown how the protein ALIX regulates phosphate transporters on the cell membranes of the plant Arabidopsis thaliana. When the amount of phosphate in the milieu is sufficient, the transporters are internalised from the membrane to the cell’s degradation machinery in the vacuoles. The plant is thus able to maintain its internal phosphate levels constant.
International travel and trade as well as rising temperatures bring diseases to our country that we thought were confined to the tropics. A group of scientists from the CNB wants to fight them, both here and in their place of origin. Starting today, anyone who wants to help them achieve this can do so through the PRECIPITA platform of the Spanish Foundation for Science and Technology.
Biogen Foundation has announced the X edition of the Prizes for Young Researchers. Two different awards will be given, one for clinical research and another one for basic research. The aim is to award the best works of young scientist both in Spain and abroad.
Protein ω2 is tightly related to antibiotic resistance of some pathogenic bacteria such us Streptococcus, Enterococcus or Staphylococcus. A group of researchers at the CNB has identified how this protein acts in order to modulate the transcription of certain genes which allow microorganisms became resistant to antibiotics and survive clinical treatments.
The XX CNB Seminar Series will start on 23 September 2015 with a conference by the Centre for Genomic Regulation researcher James Sharpe.
With the collaboration of VWR, the 2015-2016 Seminar Series will held talks of 13 renowned scientists in the field of life sciences.
The talks will be held on Fridays at noon in the CNB Conference Room.
The IX CNB Junior Seminar Series will start on 19 September 2015 with a conference by the researcher of the University of Copenhagen Kenn Gerdes.
With the collaboration of VWR, CNB PhD students organised a series of 10 conferences by renowned scientists in the field of life sciences.
The talks will be held on Fridays at noon in the CNB Conference Room.
Lluis Montoliu's laboratory, in collaboration with other groups, has identified a function for sequences found in human non-coding DNA. They act as insulators, that is, they allow the transcription of genes independently of the chromosomal environment, according to the cell’s needs at any given time.
Plants have various mechanisms to adapt to the environment they live in. A group of scientists from the Centro Nacional de Biotecnología (CNB) recently discovered how species of the genus Solanum control the growth of new branches depending on the presence or absence of light and on plant hormones. Two different products of the BRANCHED1a gene are responsible for this.
El investigador del CNB Pablo Gastaminza ha recibido el premio Virólogo Joven 2015 de la Sociedad Española de Virología por su brillante carrera científica. Gastaminza fue galardonado durante la celebración en Madrid del XIII Congreso Nacional de Virología.
Gastaminza se incorporó al Centro Nacional de Biotecnología en 2010. Su laboratorio estudia los procesos celulares y moleculares que subyacen en diferentes aspectos de la biología y patogénesis del virus de la hepatitis C (VHC) con la intención de descubrir nuevas estrategias de lucha contra el virus. Recientemente describieron un factor celular, el receptor sigma-1 (S1R), como potencial diana para terapia antiviral.
Con el uso de un sistema de análisis desarrollado por ellos mismos, identificaron en su laboratorio 12 fármacos empleados en distintas enfermedades que selectivamente bloquean la entrada del virus de la hepatitis C en nuestras células. Sus artículos han sido citados en más de 2.500 ocasiones.
Durante los días 7 y 8 de octubre, la isla de la Palma acogerá la primera edición del Congreso 100xCiencia (Communicating Frontier Science). En él, los 20 centros de investigación españoles reconocidos por el programa de excelencia “Severo Ochoa” (SO) acercaremos nuestra ciencia de frontera a los medios de comunicación y al público general. También será un foro de debate sobre la comunicación y divulgación de la ciencia: mediante mesas redondas y ponencias de comunicadores y periodistas internacionales, reflexionaremos sobre las estrategias de comunicación y el impacto de la ciencia en los medios y en la sociedad.
100xCiencia pretende ser un lugar de encuentro entre científicos, periodistas y divulgadores. “Con este foro –explica Rafael Rebolo, presidente del Comité Organizador- queremos impulsar y crear nuevas formas de colaboración que nos permitan acercar más y mejor nuestras investigaciones a la sociedad en general y, en particular, a los más jóvenes. El futuro de una sociedad está muy ligado a la calidad de su ciencia, al trabajo y entrega de sus científicos, pero también al apoyo y los recursos que reciben. Incrementar el interés de la gente por la ciencia es esencial para lograr más apoyo. Por eso queremos y necesitamos transmitir mejor lo que hace la ciencia por todos”.
Contaremos con la presencia de una delegación invitada de reconocidos comunicadores de la ciencia y representantes de grandes medios de comunicación nacionales e internacionales que tomarán parte activa durante la celebración del evento. El programa completo se irá actualizando en las próximas semanas. La inscripción ya está abierta.
Los centros “Severo Ochoa” cubrimos prácticamente todas las áreas del conocimiento, desde astrofísica y matemáticas hasta medio ambiente y biomedicina, pasando por las humanidades. El foro ofrecerá una visión completa de la investigación de frontera que se realiza en España, con ponencias divulgativas en las que representantes de cada centro presentarán a los periodistas los nuevos resultados de investigación, así como los retos de futuro en su área de acción.
En las mesas redondas debatiremos cuestiones de interés para comunicadores y científicos, como la presencia de la ciencia en los medios de comunicación, el papel de la investigación en los grandes retos de la sociedad actual, el impacto de las acciones de divulgación y la situación de política científica en España y Europa. El congreso se complementa con actividades de divulgación dirigidas a los habitantes de La Palma.
El Centro Nacional de Biotecnología (CNB) del CSIC, acreditado como centro de excelencia Severo Ochoa, invita a catedráticos y profesores de enseñanza secundaria a participar en la primera edición del curso presencial de actualización docente La biotecnología ante los retos de la sociedad actual que se impartirá del 29 de junio al 3 de julio de 2015, en el campus de Cantoblanco, Madrid.
El curso, equivalente a 2 créditos, ha sido autorizado por la Dirección General de Mejora de la Calidad de la Enseñanza, está dirigido a profesores de Biología, Geología, Química y Tecnología, y será impartido por investigadores del CNB con amplia experiencia en comunicación científica. Tiene como objetivo contribuir a actualizar la formación de los docentes en Microbiología, Virología, Inmunología, Oncología, Genética Molecular de Plantas y Biología Molecular, Estructural y Celular.
La inscripción estará abierta hasta el 12 de junio de 2015 y se realizará por correo electrónico a la dirección . Las plazas se adjudicarán en base al orden de recepción de las solicitudes.
La información del curso puede consultarse en el sitio web de la convocatoria:
Durante la sesión de hoy del simposio internacional Microbiología: TRANSMISIÓN, José Luis Martínez recibirá el Premio Fundación Lilly a una Carrera Distinguida.
Desde 2001, el grupo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC dirigido por Martínez estudia los mecanismos por los que las bacterias de origen medioambiental adquieren resistencias a los antibióticos. Sus resultados han sido esenciales para comprender cómo evolucionan las bacterias durantres las infecciones crónicas.
Con su investigación analiza el papel que juegan los ecosistemas naturales en la adquisición y la evolución de la resistencia a los antibióticos. Aunque los antibióticos se empezaron a usar como medicamentos en los años 40, Martínez explica que la adquisición de resitencia a ellos por parte de las bacterias "es el resultado de millones de años de evolución en ecosistemas naturales no clínicos".
Su trabajo aporta información para la búsqueda de nuevos fármacos que puedan ayudar a reducir la resistencia a los antibióticos. Entre las dianas terapéuticas que ha encontrado, actualmente centra sus estudios en un sistema de bombeo múltiple de drogas presente en todos los seres vivos y que contribuye tanto a la resistencia a la quimioterapia como a los antibióticos. Su grupo encontró recientemenet que la expresión de la bomba SmeDEF de Stenotrophomonas maltophilia se iniciada en presencia del biocida triclosa, suguiriendo que los biocidas que usamos habitualmente podrían llegar a seleccionar microrganismos resistentes a los antibióticos.
The Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) is organising its 3rd Course on Introduction to Research for students in the final years of any university degree in science. The course is designed for qualified, highly motivated students who would like to contact the scientists at the CNB. The goal of this course is to provide an overview of the centre’s cutting-edge research facilities.
The four-week course will be held on 6 – 31 July 2015. Up to 12 selected students will be registered free of charge.
For four weeks, the students will participate in the scientific activities of two research departments of their choice (2 weeks each), attend seminars on hot topics in today’s life sciences, and meet and talk with CNB scientists. Candidates are counselled to visit our website to learn about our projects and interests.
The completed application (doc/odt/pdf) form must be received before 29 May 2015, by e-mail to Alfonso Mora or by post to the Centro Nacional de Biotecnología (2nd Course on Introduction to Research), c/ Darwin #3, 28049 Madrid, Spain.
Women for Africa Foundation is launching a call for applications to the programme Science by Women, aimed at selecting 2 senior African women scientists to be integrated for 6 months in the Spanish Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) in the following areas: health, agriculture and food security, water, energy and climatic change.
The programme´s ultimate goal is to enable African women researchers to play a leading role in the transition of Africa to a knowledge-based and innovation-led economy.
Deadline for proposal submission: 15 June 2015
Applications will be subjected to a rigorous selection process, evaluating the scientific merits and leadership of the applicants as well as the scientific quality and expected impact of their research projects. Selected candidates will receive training and integration in a dynamic, multidisciplinary and highly competitive working team, where they will be able to develop their research projects and acquire complementary skills, empowering them to transfer their research results into tangible economic and social benefits.
Angiogenesis, the formation of new vessels from pre-existing ones, is essential to provide oxygen and nutrients to damaged and proliferating tissues.
Tumor vessels have multiple structural and functional abnormalities compared to normal blood vessels. They are not well organized, show unusual leakiness, and are poorly functional contributing to increased tissue hypoxia. Since angiogenesis was proposed as a new target to ‘starve’ tumor cells, a greater understanding has achieved about the complexity of the cellular components and molecular pathways involved in tumor angiogenesis.
However, open questions and new challenges remain including inhibition versus normalization of the tumor vasculature, selective targeting of endothelial cells or other cellular players such as inflammatory cells, novel targets that could avoid tumor cell scape strategies to anti-angiogenic therapies, etc. Advances in new methodologies for the engineering and production of human recombinant antibodies are making it possible to image the tumor blood vessels and to provide new opportunities for delivering and targeting bioactive molecules and cellular subsets in the tumor vasculature in a selective and efficient way
In this event, which will be held in Madrid this coming June, experts from international research institutes will review the current concept of targeting tumor blood vessels, the potential of antibody-based therapies, and will try to identify future challenges in the field through an interdisciplinary approach.
PROGRAMME
Un grupo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB), en colaboración con investigadores del Instituto Max-Planck de Golm (Alemania) y de la Fundación Noble (USA) han descubierto que una proporción importante de los RNAs mensajeros de una planta se mueven entre distintos órganos. De hecho, se estima que más del 25% (8000) de los RNAs mensajeros son móviles.
Para demostrarlo los investigadores han utilizado una estrategia basada en la obtención de injertos entre ecotipos de plantas que muestran suficientes diferencias de secuencia de sus RNAs como para poder detectar la presencia de RNAs móviles que atraviesan el sitio del injerto en la planta receptora. Esta investigación se publica en el último número de la revista Nature Plants. Javier Paz-Ares, co-director del estudio junto con Fritz Kragler (Alemania) y Wolf Scheible (EE.UU.), explica que aunque la actividad de los RNAs mensajeros se ha asociado tradicionalmente al sitio donde se sintetizan, se conocían un pequeño número de excepciones de RNAs que se mueven. “Lo que constatamos en nuestro trabajo y en otro reciente de otro grupo es que el movimiento de RNAs es más una de las reglas que la excepción”.
Independientemente de su interés intrínseco, estos resultados suscitan más preguntas que las que contestan. En concreto, ¿Cuál es el significado biológico de estos resultados? ¿Para qué se mueven los RNAs? ¿Tienen los RNAs funciones distintas en el sitio de síntesis que en el lugar al que se mueven? ¿Cómo se regula el movimiento de RNAs?
En otro orden de cosas, los resultados, explica Paz-Ares, demuestran que hay movimiento de material con información genética hereditaria a través de injertos de plantas y los injertos de plantas se utilizan por el hombre desde la antigüedad; se considera que los injertos entre especies vegetales ya se utilizaban en la civilización china hace 4000 años. Por ello, llevamos mucho tiempo comiendo frutas con RNAs que en buena lid no les pertenecen. Dado que no se tiene ninguna evidencia de que tal práctica haya supuesto ningún peligro para la especie humana o para el ecosistema, cabría preguntarse si están justificadas la posiciones tan contrarias por una buena parte de la sociedad a la utilización de organismos modificados genéticamente con genes de especies relacionadas o si se puede sosegar el debate, concluye Paz-Ares.
- Thieme CJ, Rojas-Triana M, Stecyk E, Schudoma C, Zhang W, Yang L, Miñambres M, Walther D, Schulze WX, Paz-Ares J, Scheible WR, Kragler F. Endogenous Arabidopsis messenger RNAs transported to distant tissues. Nature Plants 2015; doi: 10.1038/nplants.2015.25.
En el marco del Foro de la industria farmacéutica, biofarmacéutica, cosmética y tecnología de laboratorios FARMAFORUM, la Fundación Madri+d organizó, los días 4 y 5 de Marzo unas Jornadas de Encuentros Bilaterales para la Transferencia de Tecnología en Ciencias de la Vida en las que participó el CNB.
Los objetivos de la participación fueron promocionar las capacidades del CNB entre las industrias del sector, así como comercializar las patentes en el área de ciencias de la vida. En concreto, el CNB promocionó las siguientes Ofertas:
- Máquina para generar hipertermia en células mediante nanopartículas magnéticas.
- An engineered bacteria to deliver intracellular single domain antibodies into human cells.
- Nanobody-based electrochemical immunosensor for fibrinogen quantification in plasma.
- Nanobody to detect fibrinogen in blood.
Actividades Previas
Se creó un perfil en la aplicación Web creada por la Organización para tal fin. El perfil se centró en las patentes del CNB en al área de Ciencias de la vida. A continuación se recibieron solicitudes de reunión de distintas empresas. Asimismo, se solicitaron reuniones con empresas que podrían ser potencialmente interesantes para promocionar las Ofertas del CNB. Se solicitaron 6 reuniones y se recibieron 2 solicitudes de reunión para dar un total de 8 reuniones con empresas. El día previo, la organización envió la agenda donde se establecían 8 reuniones con una duración máxima de 30 min/c.u.
Resultados
Se mantuvieron reuniones con 7 empresas/universidades.
Bionanoplus
Contacto: Ricardo Palacios, Director de Desarrollo de negocio.
Es una empresa de Navarra con 4 años de trayectoria, y que cuenta con 9 personas. Se dedica a nanopartículas poliméricas con dos aplicaciones. Por un lado, para encapsular moléculas y antígenos que no son solubles en agua, y por otro lado, para vacunas. Las nanopartículas poliméricas tienen un efecto adyuvante sobre todo en vacunas mucosales, aumentan además la vida media porque la liberación es controlada. Interesados en desarrollo de nuevas vacunas utilizando su tecnología, sobre todo en el campo de veterinaria y para enferm,edades bacterianas.
Muestra interés por conocer las capacidades del CNB en cuanto a modelos animales con los que trabajamos y principales líneas de trabajo.
Protein Alternatives (ProAlt)
Contacto: Irene Herrera.
ProAlt es una empresa biotecnológica focalizada en el desarrollo y comercialización de ensayos basados en biomarcadores para el diagnóstico del cáncer y el manejo clínico de la enfermedad. Tienen un test para screeneing de cáncer colorectal tipo ELISA que está en proceso de validación y esperan que llegue al mercado en vernao de 2015. Además, están desarrollando otro producto para el diagnóstico de glioblastoma.
La compañía también ofrece productos propios innovadores, como proteínas recombinantes y anticuerpos, y diferentes servicios a medida del cliente para el diseño y expresión de proteínas y/o anticuerpos de interés. Muestra interés por el nanobody frente al fibrinógeno y por otros posibles anticuerpos o proteínas que disponga para comercializar el CNB.
Proporciona el contacto de Ximbio, Hugh Spotswood, empresa del Reino Unido que comercializa anticuerpos, proteínas recombinantes, modelos animales, plásmidos, etc. “Ximbio is an online portal for the life science community to exchange knowledge and trade reagents. Developed to change the way that research reagents are searched, sourced and shared, Ximbio aims to broaden the range of tools available to scientists globally, supporting and advancing life science research”.
Myriad Genetics
Felis Iglesias no pudo acudir a la reunión.
Myriad genetics es una de las primeras empresas de genómica, desarrolla productos de diagnóstico molecular. En 2011 adquirió Rules-Based Medicine, con capacidad de desarrollar inmunoensayos multiplex. En 2012 han abierto un laboratorio en Munich.
Se les contactará por email para ver si hay interés en colaboraciones.
Fundación Universidad Autónoma de Madrid (OTRI)
Contacto: Ester García García
Se habló con ella para retomar la posible licencia de un software de análisis de la calidad del esperma desarrollado por investigadores del CNB-CSIC y la UAM.
Ibersens
Contacto: Arantzazu González García, Directora técnica
Es una empresa fundada en 2014. Los fundadores provienen del Grupo de Biosensores de la Univwersidad de Alcalá. Tienen patentado un soporte para inmunosensores que es multiplex. El usuario solo pone la muestra y el sustrato de revelado.
Muestran interés por el anticuerpo R5 de detección del gluten del CNB. Quieren saber si es posible licenciarlo para su formato de kit y si podrían probarlo en su sensor.
Grifols Engineering
Contacto: Oriol Argemi Febrer
Grifols engineering se dedican a la puetsa a punto de plantas de fabricación de productos biológicos, y a la venta de maquinaria para la industria bioetch. No hay muchas posibilidades de colaboración con el CNB.
Anaxomics
Contacto: Mireia Coma, Directora de desarrollo de negocio.
Anaxomics es una empresa de servicios de biología de sistemas. Creada en 2007 y con oficinas en Barcelona. Han desarrollado una tecnología llamada TPMS (Therapeutic Perfomance Mapping System): Crea modelos matemáticos que integran todo el conocimiento disponible en cuanto a biología, clínica, omics, farmacología, etc para estimular el desarrollo de fármacos. Utilizando la información disponible en cuanto a un fármaco y las enfermedades, realizan un mapa de dianas y efectores, y a través de modelos matemáticos y estudio de la información manual llegan a unas conclusiones biológicas y clínicas. Por ej, sus servicios sirven de apoyo a los investigadores para seleccionar determinadas proteínas de experimentos de proteómica o de deep sequencing, o miRNAs, etc.
Se les presentó el Programa de Biología de Sistemas del CNB.
3P Biopharmaceuticals
Contacto: Lucía Erroba, Desarrollo de negocio.
Desarrollo y producción de productos biofarmacéuticos desde el laboratorio hasta ensayos clínicos (GMP).
Posibles colaboraciones para la producción de proteínas recombinantes y anticuerpos.
Un equipo de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) ha hallado un nuevo mecanismo por el que una familia de virus, los poxvirus, inducen respuestas inmunes específicas frente a antígenos del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH).
Esta respuesta más específica contra el VIH podría contribuir a mejorar las vacunas contra el sida. El miembro más representativo de los poxvirus fue utilizado para erradicar la viruela. Las conclusiones del estudio se publican en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences USA.
Los investigadores, liderados por el profesor Mariano Esteban, han usado la estirpe New York del virus vaccinia para identificar el mecanismo de acción de tres genes virales que bloquean el factor clave en la regulación de genes celulares. Al eliminarlos del ADN viral consiguen que en las células infectadas aumenten los niveles de moléculas estimuladoras de la respuesta innata, como son citoquinas, quimioquinas y otras, que atraen a los neutrófilos (células de la sangre) hacia el lugar de la infección, según explica Esteban.
Este reclutamiento de neutrófilos genera un aumento en la producción de linfocitos específicos (T CD8+), que juegan un papel importante en el control de infecciones. El hallazgo ha sido confirmado mediante un virus recombinante del virus vaccina, que expresa distintos antígenos del VIH. “Los resultados de estas investigaciones tienen aplicabilidad en la mejora de vacunas frente al VIH y a otros patógenos”, concluye Esteban.
- Di Pilato M, Mejías-Pérez E, Zonca M, Perdiguero B, Gómez CE, Trakala M, Nieto J, Nájera JL, Sorzano CO, Combadière C, Pantaleo G, Planelles L, Esteban M. NFκB activation by modified vaccinia virus as a novel strategy to enhance neutrophil migration and HIV-specific T-cell responses. PNAS. 2015; doi: 10.1073/pnas.142434112.
Un grupo de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han identificado un mecanismo por el que la proteína G Gβ se pliega y forma el complejo funcional que participa en la respuesta de la célula tanto a las hormonas como a los neurotransmisores.
La señalización de las proteína G interviene en casi todos los aspectos de la fisiología celular, desde el desarrollo embrionario y el metabolismos hasta el aprendizaje y la memoria. Para que la señalización funcione de forma adecuada, las proteínas G α, β y γ deben ensamblarse, para lo cual necesitan la participación tanto de la chaperona CCT como de su cochaperona PhLP1. El grupo de investigación liderado por el científico del CNB José María Valpuesta, en colaboración con el laboratorio de Barry Willardson de la Bringham Young University de Utah, describe en un artículo en la revista the Proceedings of the National Academy of Sciences USA, las bases moleculares de dicho proceso. Según comenta Valpuesta, esperan que sus resultados “puedan eventualmente ser utilizados para diseñar nuevos fármacos que regulen la señalización de las proteínas G”.
Gracias al uso de la criomicroscopía electrónica y del crosslinking químico, han determinado las estructuras de las proteínas durante los dos primeros pasos del ensamblaje. Primero una molécula de Gβ que todavía no está plegada correctamente, tiene que ser reconocida por la chaperona CCT. Sólo entonces la cochaperona PhLP1 interacciona con CCT provocando la separación de Gβ y liberándose el complejo PhLP1:Gβ. Ahora la molécula de Gβ puede unirse a otra de Gγ, formándose el complejo Gβγ que controla una parte importantísima de la respuesta de la célula a hormonas o neurotransmisores.
Como los investigadores comienzan a entender los mecanismos moleculares de este proceso, explica Valpuesta, empezará a ser posible “tratar alguna a los muchas enfermedades debidas a defectos en la señalización de las proteínas G”.
- Plimpton RL, Cuéllar J, Lai CW, Aoba T, Makaju A, Franklin S, Mathis AD, Prince JT, Carrascosa JL, Valpuesta JM, Willardson BM. Structures of the Gβ-CCT and PhLP1-Gβ-CCT complexes reveal a mechanism for G-protein β-subunit folding and Gβγ dimer assembly. PNAS. 2015; 112 (8): 2413-2418.
El grupo de Santos Mañes en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, en colaboración con investigadores de Harvard Medical School de los Estados Unidos, han descubierto que la proteína filamina A es esencial para contrarrestar las mutaciones que originan el Síndrome de WHIM, una inmunodeficiencia congénita rara caracterizada por una neutropenia severa, una linfopenia de células B, hipogammaglobulinemia, infecciones bacterianas y virales recurrentes, y retención de neutrófilos en la médula ósea (mielocatexis).
WHIM es un acrónimo de los principales síntomas de la enfermedad: verrugas (Warts, en inglés), que se originan por infecciones crónicas con el virus del papiloma humano, hipogammaglobulinemia, infecciones y mielocatexis. Su prevalencia o incidencia en la población general es desconocida, aunque es extremadamente baja, en torno a 0.2/millón de nacimientos. Sólo se han descrito unos 60 casos en la literatura médica, la mayoría en países del sur de Europa (Francia e Italia) y en Estados Unidos. Hasta el momento no se han reportado casos de este Síndrome en España.
El Síndrome de WHIM se origina como consecuencia de mutaciones en el gen que codifica para el receptor de quimioquinas CXCR4. CXCR4 es una proteína de la superficie de las células sanguíneas, que se activa de forma transitoria tras unirse a otra proteína llamada CXCL12; la activación de CXCR4 hace que este se introduzca dentro de las células (un proceso llamado endocitosis) provocando así el apagamiento de la señal. Las mutaciones asociadas al Síndrome de WHIM imposibilitan que CXCR4 se internalice en la célula, haciendo que el receptor esté funcionando continuamente. Según explica Mañes, sus investigaciones muestran que “la filamina A es esencial para que el CXCR4 permanezca funcionando continuamente en los pacientes con Síndrome de WHIM.
Filamina A es una proteína encargada de anclar los receptores de membrana al esqueleto celular. El grupo de Mañes ya sabía que filamina A era capaz de unirse una porción terminal de CXCR4, justamente aquella porción donde se acumulan las mutaciones asociadas al Síndrome de WHIM. Usando estrategias bioinformáticas han encontrado que filamina A también se une a otra región de CXCR4, llamada bucle intracelular 3, y esta unión hace que el receptor se mantenga funcionando por más tiempo en la superficie de las células. Cuando los investigadores impidieron la unión de filamina A al bucle intracelular 3 de receptores con Síndrome de WHIM, estos receptores se internalizaban y recuperaban su función normal. Los resultados obtenidos señalan que fármacos que consigan bloquear la interacción entre filamina A y el CXCR4 mutado pueden constituir nuevas aproximaciones terapéuticas para una enfermedad para la que no existe tratamiento en la actualidad.
- Gómez-Moutón C, Fischer T, Peregil RM, Jiménez-Baranda S, Stossel TP, Nakamura F, Mañes S. Filamin A interaction with the CXCR4 third intracellular loop regulates endocytosis and signaling of WT and WHIM-like receptors. Blood. 2015; 125 (7).
Tras el apagón causado por el incendio de la instalación eléctrica, el Centro Nacional de Biotecnología (CNB), recupera hoy su actividad normal.
Los análisis de la calidad del aire realizados "indican que se puede volver a trabajar sin problema ni riesgo para la salud", explica la directora del CNB Carmen Castresana. Los resultados obtenidos son satisfactorios ya que en ningún punto se han superado los valores límite umbral ambiental establecidos para partículas en suspensión, compuestos volátiles totales y CO2. En el caso concreto del parámetro más crítico, presencia de compuestos volátiles totales, los valores obtenidos estuvieron muy por debajo incluso del 25% del valor límite umbral ambiental, lo cual, según palabra de Fernando Usera, responsable del Servicio de Seguridad Biológica del centro, "produce una gran tranquilidad en cuanto la presencia de posibles restos de hollín".
Con los trabajos de limpieza del centro aún en marcha, Castresana vuelve a agradecer "el trabajo de todos los que han estado en primera línea resolviendo la grave incidencia que hemos sufrido y cuya dedicación ha permitido evitar o paliar lo qué podía haber sido una gran catástrofe".
El apagón causado por el incendio de la instalación eléctrica del Centro Nacional de Biotecnología (CNB) impide desde el sábado su funcionamiento. Afortunadamente, no ha habido daños personales, aunque, como explica la directora del CNB, Carmen Castresana, la instalación eléctrica quedó destrozada por lo que se ha tenido que contratar una instalación eléctrica provisional, para cuya puesta en marcha se ha trabajado sin descanso durante 48 horas.
Todavía no se conocen las causas del incendio, aunque la principal preocupación es volver a la normalidad lo antes posible. En estos momentos el personal de mantenimiento está procediendo a restituir la energía eléctrica en todos los puntos del centro, algo que se concluirá a lo largo de esta semana. A este respecto, la directora del CNB quiere resaltar la colaboración de todo el personal del CNB, y en especial el extraordinario trabajo realizado por los servicios de Mantenimiento, Vigilancia, Seguridad, así como de todos aquellos a los que se les ha solicitado su colaboración.
El CNB ha estado sin electricidad alrededor de 24 horas, por lo que no se ha podido evitar que los experimentos que estaban en marcha se hayan estropeado. No obstante, se espera que dada la rapidez de la actuación, el centro haya podido salvar, explica Castresana, “la gran cantidad de materiales almacenados, fruto del trabajo de muchos años”.
En la mañana del martes se ha incorporado a su trabajo el personal de administración, proyectos, servicios generales y compras, con lo que su parada ha sido mínima. Igualmente se han iniciado las tareas dirigidas a revisar los equipos de los laboratorios, iniciándose la limpieza de todas las instalaciones y el acondicionamiento general del centro.
El V Curso de Proteómica Cuantitativa pretende ofrecer una exhaustiva visión teórica y práctica de algunas de las aproximaciones experimentales más utilizadas en proteómica diferencial.
Del 23 al 27 de marzo de 2015 en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, se analizarán en detalle técnicas como el marcaje isotópico diferencial con reactivos como ICPL y iTRAQ, seguido de fraccionamiento por cromatografía líquida y análisis mediante espectrometría de masas y técnicas de proteómica cuantitativa dirigida (MRM).
La inscripción se puede realizar del 1 al 15 de febrero de 2015 en la página web del Servicio de Proteómica del CNB (http://proteo.cnb.csic.es/qproteomics/index.html).
Las clases teóricas se combinarán con clases prácticas que permitirán al investigador familiarizarse con estas técnicas y descubrir todo su potencial.
PROGRAMA
Con el objetivo de hacer conocer los fundamentos teóricos y las técnicas básicas necesarias para diseñar los procedimientos en experimentos científicos que empleen animales, se va a celebrar del 2 al 5 de febrero de 2015 en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC un curso para el personal responsable de dirigir o diseñar este tipo de experimentos.
Acreditado por la Comunidad de Madrid, este curso puente está destinado a la obtención de la Categoría C de experimentación animal. Para poder asistir, es necesario rellenar el formulario de incripción y enviarlo a .
Los alumnos obtendrán conocimientos sobre:
- Aspectos éticos y legislación.
- Biología y mantenimiento de los animales de experimentación.
- Microbiología y enfermedades.
- Diseño de procedimientos con animales.
- Anestesia, analgesia y procedimientos experimentales.
- Alternativas al uso de animales.
- Análisis de la literatura científica apropiada.
Como viene siendo tradicional desde 1992, un grupo de jóvenes científicos que trabajan en el extranjero se reunieron en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC. Este año la la vigesimosegunda edición de la jornada Avances en Biología Molecular por Jóvenes Investigadores en el Extranjero se celebró hoy lunes 22 de diciembre.
Mientras la gran mayoría de españoles estaban pendiente del sorteo de lotería, estos jóvenes científicos estuvieron explicando sus últimos resultados y hablando de las técnicas de investigación más actuales.
Como no podía ser de otra manera, uno de los principales temas de conversión de este día ha sido la situación actual y las posibilidades que hay de volver a España para desarrollar una carrera científica. De hecho, la jornada finalizó con una mesa redonda moderada por la directora del CNB, Carmen Castresana en la que se trataron nuevas oportunidades de subvencionar la investigación. A ella asistieron Federico Mayor Zaragoza (Presidente del Consejo Científico de la Fundación Ramón Areces), María Sanz Vicente (Subdirectora de la Fundación General CSIC), Inés Antón (Fundación Apadrina la Ciencia) y Ana Fernández-Zubieta (Vórticex: crowdfunding and crowdsourcing en I+D+i).
PROGRAMA
Since 2008 Obra Social ‘la Caixa’ fund an International PhD Fellowship Programme to provide highly talented PhD students with a unique opportunity to start a scientific career at the Spanish National Biotechnology Centre (Centro Nacional de Biotecnología, CNB).
2015 call
The Spanish National Biotechnology Centre (Centro Nacional de Biotecnología, CNB) offers three 4-year working contracts, funded by Obra Social ‘la Caixa’, to provide highly talented PhD students with a unique opportunity to start a scientific career at one of the Spanish ‘Severo Ochoa’ Centres of Excellence. Working contracts will begin between September and October 2015 and include an annual gross salary that increases progressively from €18,546 in the first year to €22,558 in the fourth year, with an annual allowance for thesis-related expenses (€1,500 in the first and second years, €1,700 in the third and fourth years), and full social insurance coverage.
Applications must be submitted to the CNB umbrella organisation, the Spanish National Research Council (Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas, CSIC):
- Instructions and application form (applications until 9 February 2015)
- Guidelines to fill the forms (in English)
- Provisional list of candidates
- Initial evaluation of the candidates
- Candidates selected for the interview (15 April 2015)
- Evaluation of the interviewed candidates
Successful candidates will be contracted between September and October 2015.
The CNB invites applications for Group Leader positions in its Departments of Cellular and Molecular Biology (2 positions) and Plant Molecular Genetics (1 position).
Specific areas of interest are:
Cellular and Molecular Biology
- Genes and Disease
- Virus-Host Interactions
Plant Molecular Genetics
- Plant Cell Division and Differentiation
- Plant Productivity and Developmental/Environmental/Stress Response Networks
This call is targeted at scientists who wish to transfer their research group to the CNB. Group Leaders will be offered suitable office and laboratory space to accommodate research groups of up to 10 people. They will have full access to the CNB’s extensive research facilities and to dedicated support for project management, technology transfer, outreach and administrative issues.
The CNB forms part of the Spanish National Research Council (Consejo Superior de Investigaciones Científicas – CSIC) and is one of the seven Spanish ’Severo Ochoa’ Centres of Excellence in Life Sciences and Medicine. The implementation of cutting edge Computational, Systems and Synthetic Biology approaches is a strategic priority of the CNB’s research programme.
For further information, please contact with the CNB at: .
Applicants should provide the following documents (in English):
- Letter of intent
- Summary of scientific achievements including a list of 5 key publications (max. 2 pages)
- Outline of current research interests and future research projects (max. 4 pages)
- Curriculum vitae including a complete list of publications, patents and funded projects
Candidates will be evaluated by the CNB’s Scientific Advisory Board and selected solely based on their scientific merits, leadership, fund-raising capabilities and strategic fit into the centre’s scientific priorities.
Applications should be submitted by e-mail no later than March 31, 2015 to: .
La vigésimo segunda edición de las tradicionales Jornadas Científicas del CNB se celebrará este año los días 16 y 17 de diciembre de 2014. Como se puede apreciar en el programa, 24 científicos del CNB explicarán sus investigaciones, siendo una magnífica oportunidad de ponerse al día de las investigaciones que se llevan a cabo en la actualidad en el campo de las ciencias de la vida.
Como en años anteriores, desde el 9 de diciembre, se desarrolla en paralelo una sesión de pósters en la que los estudiantes de doctorado muestran sus trabajos. Tras la sesión presencial del jueves 11 de 11:00 a 13:00, se elegirán los dos mejores que darán una charla en la última sesión del miércoles 17 de diciembre. Este año además, gracias al patrocinio de IESMAT, serán obsequiados con un lector de libros digitales.
PROGRAMA
The Spanish National Biotechnology Centre (Centro Nacional de Biotecnología, CNB) offers three 4-year working contracts, funded by Obra Social ‘la Caixa’, to provide highly talented PhD students with a unique opportunity to start a scientific career at one of the Spanish ‘Severo Ochoa’ Centres of Excellence. Working contracts will begin between September and October 2015 and include an annual gross salary that increases progressively from €18,546 in the first year to €22,558 in the fourth year, with an annual allowance for thesis-related expenses (€1,500 in the first and second years, €1,700 in the third and fourth years), and full social insurance coverage.
Who are we?
The CNB is a multidisciplinary research centre, located on the Campus of the Universidad Autónoma de Madrid, that engages in the most relevant areas of contemporary biotechnology, with a focus on four major challenges to society: infectious diseases, inflammation & cancer, sustainability of food production, and environmental pollution. These areas are covered by complementary research approaches in:
- Macromolecular structures
- Cellular & molecular biology
- Microbial biotechnology
- Plant molecular genetics
- Immunology & oncology
- Systems & synthetic biology
Who we are looking for?
The International PhD Fellowship Programme ‘la Caixa - Severo Ochoa’ is committed to scientific excellence. Successful applicants for one of the three contracts available are expected to have outstanding academic qualifications and a strong motivation to join one of our currently active research lines in biomedical or agricultural sciences.
Who can apply?
NOTE: The following points are meant to provide a brief and orientative overview of the main eligibility criteria. Please refer to the forthcoming call or contact us for detailed information (see below).
- NATIONALITY. This call is open to applicants of all nationalities. Students with nationalities outside the European Union need to accredit legal immigration in Spain before the application deadline. If selected, non-Spanish residents must have a valid work permit before signing a work contract with the CNB.
- AGE. No specific age restrictions apply for this call.
- ACADEMIC DEGREE. Students must hold a university degree that qualifies them to initiate a PhD thesis in Spain. Specifically, they must accredit that they have applied for admission or have already been admitted to a PhD programme in a Spanish university before the application deadline; before signing a work contract with the CNB, selected candidates must have successfully completed the admission process. If they hold academic degrees obtained from a university outside of Spain, PhD students must have homologated these academic degrees or accredit that they have already initiated their homologation in Spain before signing a work contract with the CNB.
- PREVIOUS PhD FELLOWSHIPS. Applicants must not have been beneficiaries of a previous PhD fellowship funded by the ‘la Caixa’ Foundation nor have been contracted as a PhD student for more than four years (six years in the case of disabled students) by any other institution; in the case of PhD students who previously obtained a Spanish fellowship according to Royal Decree 63/2006-January 27, a 12-month limit applies.
How to apply?
Applications must be submitted to the CNB umbrella organisation, the Spanish National Research Council (Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas, CSIC), according to the instructions in the call for applications that will be published before January 31, 2015; the call will be open for 20 days. An independent selection committee will evaluate the academic and scientific merits of eligible candidates. Top-ranked candidates will continue the selection process by passing an interview with the selection committee. The selection process will be terminated before the end of July 2015, and successful candidates will be contracted between September and October 2015. Please consult our web page on a regular basis for updated information on the call and selection process.
How we can assist you in your fellowship application?
To confirm that your academic qualifications fulfil the expectations of this PhD Programme of Excellence, to check whether you comply with the eligibility criteria of this call, to inform you when the call is published, and to eventually guide you through the application process, we encourage you to contact our academic officer by e-mail () as soon as possible and attach the following documents in Word document or PDF format:
- letter of intent, specifying which CNB research group(s) you wish to join, and
- curriculum vitae, including your academic degrees and grades
En honor de Juan Pablo Albar, el martes 2 de diciembre de 2014 se celebró en el CNB el siguiente acto:
Juan Pablo Albar (1953-2014), amante de grandes retos, explorador incansable, partió a su última expedición, esa que uno emprende en solitario. El escalador de cimas; el corredor de fondo; el aventurero del proteoma humano y, sin duda, el bioquímico más conocido de la Antártida, nos dejó la madrugada del pasado 19 de julio. Entre proteínas e increíbles aventuras, solo al alcance de unos pocos, se marchó sin avisar a nadie, como el susurro del viento de las nevadas cumbres que tanto amaba. En él, ciencia, deporte y aventura se fundían en su más íntima esencia, en la nobleza, superación de nuevos retos, conseguir nuevos conocimientos y, en definitiva, en hacer un poquito más grande al ser humano. Los límites entre sus tres aficiones eran tenues, su naturaleza de científico y explorador le condujo a recorrer la Antártida en el Proyecto Trineo, desde su entrada por Sudáfrica hasta su salida por bahías repletas de pingüinos. “Me alegro de haber ido”, dijo y convocó “cálidamente”, desde el mismísimo Polo Sur, a la comunidad científica para trabajar con él en uno de los más grandes retos de la Biología, el Proyecto Proteoma Humano.
Juan Pablo Albar se licenció en Ciencias Químicas en la Universidad Complutense de Madrid, donde unos años más tarde, en 1981, obtuvo el título de Doctor. Tras unos años de trabajo en el sector privado, comenzó su trayectoria académica en el Centro Nacional de Biotecnología del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CNB-CSIC), donde se convirtió en uno de los pioneros y principales impulsores de la proteómica en España, punto de referencia necesario en grandes iniciativas, nacionales e internacionales, destinadas a entender la biología humana y las causas de la enfermedad. Fue Investigador Científico del CSIC, Director de la Unidad de Proteómica del CNB, coordinador de la Plataforma de Proteómica en Red del Instituto de Salud Carlos III (ProteoRed-ISCIII), coordinador de la Plataforma de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos, PRB2-ISCIII, miembro de las Juntas Directivas de la Sociedad Española de Proteómica (SEProt), de la Asociación de Proteómica Europea (EuPA), de la Organización del Proteoma Humano (HUPO), miembro del Comité Ejecutivo del Proyecto Proteoma Humano (HPP), Director del Proyecto Proteoma Humano Español centrado en investigar el proteoma asociado al cromosoma 16. Su trabajo ha dado lugar a más de 160 publicaciones científicas y ha servido de inspiración a numerosos investigadores en el ámbito de la proteómica y de la bioquímica en general.
Gran científico, deportista y, sobre todo amigo, Juan Pablo nos dejó un legado de optimismo y saber hacer que nos guiará en el desarrollo futuro de los proyectos que él inició y que han permitido convertir a nuestro país en una referencia indiscutible dentro de una disciplina emergente, como lo es la Proteómica y sus aplicaciones en el ámbito de la salud.
Una investigación llevada a cabo en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) ha contribuido a determinar en términos estructurales el mecanismo por el que la proteína Hop media en el correcto plegamiento del receptor de una hormona mediante la interacción de forma sucesiva con las chaperonas Hsp70 y Hsp90.
Bajo la dirección del científico del CNB José María Valpuesta, los investigadores han sido capaces de superar la flexibilidad intrínseca de estas proteínas y determinas las estructuras, usando técnicas de microscopía electrónica diversas, los diferentes complejos entre las chaperonas Hsp70 y Hsp90 con el sustrato, el receptor de glucocorticoides.
Como se muestra en este estudio publicado en la revista Nature Communications Como se muestra en este estudio publicado en la revista Nature Communications, el plegamiento, el ensamblaje y la maduración de receptor de glucocorticoides empieza cuando es reconocido por la chaperona Hsp70, una proteína esencial para controlar la calidad de las proteínas de la célula.
El complejo entre Hsp70 y el receptor de glucocorticoides es a su vez reconocido por otro complejo, el formado por la co-chaperona Hop y el dímero de la chaperona Hsp90. Mediante el procesamiento de las imágenes obtenidas por microscopía electrónica, los investigadores han podido observar que la flexibilidad del dímero de Hsp90 se reduce tras la unión de una molécula de la proteína Hop. De este modo, se produce una reorganización de esta estructura que da lugar principalmente a dos conformaciones del complejo Hsp90:Hop, explica Valpuesta, “una estructura extendida que reconoce el complejo Hsp70:receptor de glucocorticoides e interacciona con él y otra compacta en la que Hsp70 contacta con uno de los monómeros de Hsp90”. Precisamente, es este movimiento entre una conformación y la otra el que sirve para traspasar la molécula del receptor de glucocorticoides al dímero de Hsp90, el cual se encargará de paso final en el proceso de plegamiento.
- Alvira S, Cuéllar J, Röhl A, Yamamoto S, Ito H, Alfonso CB, Rivas G, Buchner J, Valpuesta JM. Structural characterization of the substrate transfer mechanism in HSP70/Hsp90 folding machinery mediated by Hop. Nat Commun. 2014; 5: 5484.
Describen cómo Listeria regula la expresión de una proteína de superficie dentro de nuestras células
Un grupo de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) ha descubierto un mecanismo por el que la bacteria patógena Listeria monocytogenes aumenta la expresión de una proteína de su pared cuando crece dentro de células eucariotas.
Con una mortalidad estimada de un 20–30%, las infecciones por L. monocytogenes progresan rápidamente debido a que el patógeno es capaz de cruzar nuestras barreras de defensa (epitelio intestinal, placenta, barrera hematoencefálica). A continuación, la bacteria invade las células del hospedador y prolifera dentro de ellas. Las bases moleculares que sustentan la capacidad de L. monocytogenes para adaptarse y vivir dentro de células eucariotas son en gran medida desconocidas. No obstante, datos recientes obtenidos por técnicas de proteómica y transcriptómica muestran una expresión selectiva de determinados genes y proteínas cuando el patógeno crece en el interior de la célula hospedadora.
Dirigidos por el microbiólogo del CNB Francisco García-del Portillo, un grupo de científicos acaba de publicar en la revista PLOS Genetics un mecanismo de regulación de una proteína anclada a la pared bacteriana de L. monocytogenes por parte de un “ARN pequeño”. Este proceso culmina con la producción preferencial de la proteína sólo cuando el patógeno crece en la célula eucariota. En colaboración con la investigadora de la Universidad Autónoma de Madrid, Graciela Pucciarelli, han descubierto que “esta especificidad se consigue porque las bacterias intracelulares transcriben una variante del ARN mensajero que contiene una región no traducida (UTR) en el extremo 5’ inusualmente larga (234 nucleótidos) a la que podría unirse el ARN regulador”.
Esta regulación “espacial” consigue que la producción de esta proteína esté fuertemente apagada cuando la bacteria crece en medios de laboratorio. La situación se invierte en bacteria intracelular, cuando se produce de forma mayoritaria una variante del ARN mensajero reconocida por el ARN regulador.
Reforzando este mecanismo, los autores describen que la bacteria intracelular aumenta la cantidad del ARN pequeño Rli27 durante el ciclo infectivo. Según explica García-del Portillo, el aumento de ambos elementos en respuesta a la infección, tanto del ARN regulador (Rli27) como de la variante del ARN mensajero del gen diana que expone un sitio de unión para ese ARN, asegura que “esta proteína de superficie del patógeno se produzca de forma selectiva dentro de la célula hospedadora” en lugar del ambiente extracelular.
- Quereda JJ, Ortega ÁD, Pucciarelli MG, García-del Portillo F. The Listeria small RNA Rli27 regulates a cell wall protein inside eukaryotic cells by targeting a long 5′-UTR variant. PLoS Genet. 10 (10): e1004765.
El Centro Nacional de Biotecnología del CSIC celebrará en Madrid el lunes 22 de diciembre de 2014 la vigesimosegunda edición de su tradicional jornada Avances en Biología Molecular por Jóvenes Investigadores en el Extranjero. En ella participan, año tras años científicos postdoctorales españoles que trabajan fuera de nuestras fronteras y que vuelven a casa por Navidad.
La asistencia es libre y las jornadas finalizarán con una mesa redonda en la que se comentarán las distintas posibilidades de financiación dentro del sistema científico español.
PROGRAMA
Un grupo de científicos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) ha descubierto una proteína que actúa como un sensor de fosfato en plantas. Según explica Javier Paz-Ares, director de este estudio, habrá que tener en cuenta esta proteína para a la hora de desarrollar una agricultura más sostenible.
El fósforo es un nutriente fundamental para todos los organismos. Las plantas lo toman del suelo en forma de fosfato, pero al ser muy insoluble, comenta Paz-Ares, en la mayoría de los suelos se encuentra en bajas concentraciones comprometiéndose el rendimiento de las cosechas. La identificación de esta proteína, capaz de percibir la disponibilidad de fosfato en plantas y promover la adaptación del crecimiento, desarrollo y metabolismo acorde con dicha disponibilidad, provee de una herramienta biotecnológica para mejorar la eficiencia en la utilización de fosfato por las plantas, y así reducir las necesidades de fertilizantes.
En colaboración con investigadores del Instituto Max Planck de Colonia y de la Universidad de Zheijang, las investigadoras del CNB Mabel Puga e Isabel Mateos identificaron este sensor mediante la búsqueda de proteínas que interaccionaban con un activador clave de la respuesta al ayuno de fosfato en plantas. Posteriormente comprobaron que la interacción entre la proteína sensora y el activador sólo tiene lugar cuando las plantas tienen suficiente cantidad de fosfato y que conlleva la inhibición de la respuesta. Es decir, el sistema de respuesta al ayuno de fosfato, más que activarse cuando la planta sufre carencia de fosfato, se inactiva cuando la planta recibe suficiente fosfato.
Este sensor de fosfato de plantas que acaban de descubrir muestra parecido con uno descrito en levaduras, pero “es llamativo que los mecanismos de acción de los sensores de ambos organismos sean muy distintos”, recalca Paz-Ares. Mientras que en el caso de levaduras, el sensor inhibe a un represor de las respuestas al ayuno cuando el fosfato es escaso, en plantas el sensor inhibe a un activador de las respuestas al ayuno cuando hay suficiente fosfato. Como se ve, se puede conseguir un mismo efecto –que la respuesta al ayuno de fosfato se produzca sólo cuando no hay fosfato- de dos maneras opuestas. Para Paz-Ares, ahora “queda por entender el porqué de estas diferencias”. Si es que hay un porqué, más allá de que plantas y levaduras son organismos que han divergido hace muchos millones de años.
- Puga MI, Mateos I, Rajulu C, Wang Z, Franco-Zorrilla JM, de Lorenzo L, Irigoyen ML, Masiero S, Bustos R, Rodríguez JF, Leyva A, Rubio V, Sommer H, Paz-Ares J. SPX1 is a phosphate-dependent inhibitor of PHOSPHATE STARVATION RESPONSE1 in Arabidopsis. PNAS. 2014; MS# 2014-04654R.
Un grupo de investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han sido capaces de reducir drásticamente el desarrollo de tumores y la inflamación del colon en ratones. Para ello han tenido que identificar dos proteínas que no se sabía que estaban implicadas en este tipo de enfermedades.
El grupo dirigido por Ana Cuenda ha utilizado una serie de modelos de ratón que les ha permitido estudiar porqué los pacientes con inflamación crónica en el intestino, como los que padecen la enfermedad de Crohn, desarrollan tumores de colon en una proporción mucho más alta que la población normal.
Sus resultados, que se acaban de publicar en la revista Cancer Research, describen cómo en un modelo de cáncer de colon asociado a colitis, la eliminación de las proteínas quinasas p38γ y p38δ reduce drásticamente el desarrollo de tumores y la inflamación en el colon. Analizando en detalle el mecanismo detrás de este descubrimiento, han observado que estas dos proteínas regulan tanto el reclutamiento de células del sistema inmune, como neutrófilos o macrófagos, a los focos de inflamación como la producción de citoquinas.
Estos hallazgos indican que p38γ y p38δ tienen un papel pro-oncogénico asociando procesos inflamatorios con el desarrollo de tumores y, según comenta Cuenda, “son posibles dianas terapéuticas en el tratamiento contra el cáncer de colon”.
- Del Reino P, Alsina-Beauchamp D, Escós A, Cerezo-Guisado MI, Risco A, Aparicio N, Zur R, Fernandez-Estevez M, Collantes E, Montans J, Cuenda A. Pro-oncogenic role of alternative p38 mitogen-activated protein kinases p38γ and p38δ, linking inflammation and cancer in colitis-associated colon cancer. Cancer Res. 2014; doi: 10.1158/0008-5472.CAN-14-0870.
The 'Severo Ochoa' Excellence PhD Programme offers up to six 4-year working contracts, funded by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, to provide highly talented PhD students with the opportunity to start their scientific career at one of the first class research centers in Europe, the Spanish National Centre for Biotechnology (CNB).
In 2014, the CNB was accredited as one of the seven Spanish 'Severo Ochoa' Centres of Excellence in the area of Life Sciences and Medicine. The CNB is a multidisciplinary research centre that engages in the most relevant areas of red and green Biotechnology, with a strong focus on four major societal challenges, namely infectious diseases, inflammation & cancer, sustainability of food production, and environmental pollution. These areas are covered by complementary research approaches in the areas of:
- Macromolecular Structures
- Cellular and Molecular Biology
- Microbial Biotechnology
- Plant Molecular Genetics
- Immunology and Oncology
- Systems and Synthetic Biology
The Severo Ochoa Excellence PhD Programme reflects on our centre's effort to implement novel research approaches related to Systems and Synthetic Biology. During their PhD training, students will become immersed into a versatile and multidisciplinary scientific approach, combining gene-based technologies with frontier research in functional and structural biology to bridge information gaps between the wealth of newly identified biological blocks and their functional interplay in living organisms. They will have the opportunity to participate in international flagship projects of contemporary Systems & Synthetic Biology. They will have access to excellent research facilities (high-throughput genomics, proteomics etc.) and state-of-the-art technology (genetic engineering, structure solving, imaging, computational biology etc.). Training at the CNB will prepare PhD students to lead discovery and application of Biotechnology to meet the needs of a modern society and the challenges of a dynamic world.
We encourage applications from highly talented and motivated PhD students with outstanding qualifications. Before applying, please consult our web on http://www.cnb.csic.es/index.php/en/investigacion/departamentos.html to find out which research group(s) best fit your expectations.
On-line applications are directed directly to the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness
DEADLINE: September 19, 2014
La capacidad de polarización eléctrica del ADN es una propiedad fundamental que influye directamente en sus funciones biológicas. Sin embargo, a pesar de la importancia de esta propiedad no ha sido posible medirla hasta ahora
En un estudio publicado en la revista PNAS los investigadores en el Instituto de Bioingeniería de Cataluña (IBEC) dirigidos por Laura Fumagalli, investigadora sénior en el IBEC y profesora de la Universidad de Barcelona (UB), y sus colaboradores del Instituto de Investigación Biomédica de Barcelona (IRB), del Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) y del Instituto IMDEA de Nanociencia en Madrid, describen cómo han encontrado una manera para medir directamente la capacidad de polarización eléctrica del ADN - representada por su constante dieléctrica que indica cómo reacciona un material a la aplicación de un campo eléctrico - por primera vez en la historia.
Los investigadores lo han logrado gracias al uso de su propia técnica, desarrollada recientemente en el IBEC, basada en el microscopio de fuerza electrostática (EFM, del inglés electrostatic force microscopy). Este tipo de microscopio permite a los investigadores explorar no sólo la morfología de los complejos biológicos individuales en su entorno natural, sino también para medir las propiedades electrostáticas que hacen que cada objeto sea único. Sin embargo, hasta ahora esta propiedad clave del ADN - su capacidad de polarización eléctrica - ha permanecido desconocida, debido a las dificultades inherentes para conseguir dicha medida dada la compleja estructura del ADN.
Los investigadores han sido capaces de cuantificar la constante dieléctrica del ADN de una manera no invasiva mediante la medición del ADN en su estado nativo, condensado, dentro de un bacteriófago - un virus que infecta y se replica dentro de una bacteria. La naturaleza especial de estos virus significa que llevan información genética condensada en una pequeña carcasa, lo que significa que mantienen el ADN en una estructura casi cristalina que los investigadores fueron capaces de diseccionar para determinar las constantes dieléctricas de los principales componentes; la cubierta de proteína y el ADN.
Los resultados muestran que la constante dieléctrica del ADN está alrededor de 8, muy por encima de lo que se suele suponer, y los investigadores confirmarn este valor basándose en cálculos teóricos muy precisos, utilizando herramientas computacionales atomísticas de última generación y los recursos computacionales del Barcelona Supercomputing Center (BSC). Los cálculos dieron como resultado prácticamente el mismo valor, alrededor de 8, que coincide con sus observaciones experimentales.
"Nuestros experimentos y cálculos revelan una propiedad propia de ADN que permite la predicción realista de su conformación y sus funciones sobre la base de herramientas computacionales y nos ayuden a comprender mejor las funciones esenciales que el ADN desempeña en nuestro cuerpo", dice Modesto Orozco, jefe del grupo del IRB y profesor de la UB. "Estos experimentos también abren nuevas vías para explorar propiedades de polarización fundamentales de otras biomoléculas".
- Cuervo A, Dans PD, Carrascosa JL, Orozco M, Gomila G, Fumagalli L. Direct measurement of the dielectric polarization properties of DNA. Proc Natl Acad Sci USA. 2014; pii: 201405702.
Científicos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC han descubierto una arsenato reductasa en plantas que podría ser útil para descontaminar el agua y los suelos de arsenato. En la actualidad, explica Antonio Leyva, el investigador del CNB responsable de este trabajo, hay millones de personas en todo el mundo expuestas a este contaminante y "esta proteína presenta un tremendo potencial para la biorremediación".
Los investigadores analizaron la tolerancia al arsenato de 82 variedades naturales de la planta Arabidopsis thaliana y encontraron en el cromosoma 2 un región relacionada con un mejor crecimeinto de las raíces en presencia de arsenato. En colaboración con otros grupos del CNB, Eduardo Sánchez-Bermejo fue capaz de determinar en el laboratorio de Leyva la proteína responsable de la tolerancia al arsenato. Tras analizar la secuencia de su ADN y estudiar su actividad bioquímica, los científicos la han identificado como una nueva arsenato reductasa que permite a las plantas secuestrar el arsenato.
Además, las variaciones de esta proteína explican los diversos grados de tolerancia que de forma natural se encuenran en las plantas. Como estas variaciones no son obtenidas en el laboratorio, sino que se encuentran en la naturaleza, Leyva espera que se conservarían si se utilizaran alguna de estas variedades en suelos o aguas contaminados con arsenato.
- Sánchez-Bermejo E, Castrillo G, Navarro C, del Llano B, Zarco-Fernández S, Martinez-Herrera DJ, Leo-del Puerto Y, Muñoz R, Cámara C, Paz-Ares J, Alonso-Blanco C, Leyva A. Natural variation in arsenate tolerance identifies an arsenate reductase in Arabidopsis thaliana. Nat Commun. 2014; 5: 4617.
El próximo 19 de septiembre de 2014 comienza el VIII Ciclo de Seminarios Júnior del CNB con una conferencia impartida por el investigador del Istituto di Ricerca in Biomedicina Santiago F. González.
Con la colaboración de VWR, los estudiantes predoctorales del CNB han organizado una serie de 11 conferencias que nos permitirá contar a lo largo del curso 2014-2015 con la presencia de 11 magníficos científicos que explicarán sus últimas investigaciones en el campo de la Ciencias de la vida. El ciclo finalizará en junio con la conferencia de José A. Bengoechea de la Queen's University de Belfast.
Los seminarios tendrán lugar los viernes a las 12:00 en el Salón de Actos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC.
Científicos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) describen el proceso de interacciones entre neuronas mediado por “Intercellular Cell Adhesion Molecule-5” (ICAM-5). Esta proteína interviene en la adhesión celular entre neuronas y juega un papel clave en su desarrollo.
Encontrada exclusivamente en las membranas de las neuronas del telencéfalo, explica José M Casasnovas, el investigador del CNB responsable principal de este estudio, “se ha visto que ICAM-5 se asocia a un tipo de proteínas cuyas mutaciones se han relacionado con el desarrollo de la enfermedad de Alzheimer”. Con la información estructural que han conseguido en este estudio y en otro previo, se puede ahora entender cómo esta proteína establece uniones entre neuronas y participa en el tráfico de los leucocitos en el cerebro.
En este trabajo se ha utilizado la cristalografía de rayos X para determinar la estructura de la parte más expuesta de la proteína en neuronas, que es la responsable de la unión entre células. Este fragmento de ICAM-5 tiene una distribución de cargas polarizada, una característica que la diferencia del resto de proteínas de la misma familia. La molécula adopta una configuración curvada (S) que favorece la formación de un complejo de adhesión entre moléculas que se encuentran en la superficie de las neuronas.
- Recacha R, Jiménez D, Tian L, Barredo R, Gahmberg CG, Casasnovas JM. Crystal structures of an ICAM-5 ectodomain fragment show electrostatic-based homophilic adhesions. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2014; 70 (Pt 7): 1934-1943.
El próximo 24 de octubre de 2014 comienza el XIX Ciclo de Seminarios del CNB con una conferencia impartida por el investigador de la Universidad de Cambridge Alfonso Martínez-Arias.
Con la colaboración de VWR, a lo largo del curso 2014-2015 contaremos con la presencia de 12 magníficos científicos que explicarán sus últimas investigaciones en el campo de la Ciencias de la vida. El ciclo finalizará con la conferencia de Rafael Yuste de la Universidad de Columbia de Nueva York.
Los seminarios tendrán lugar los viernes a las 12:00 en el Salón de Actos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC.
Con el fallecimiento, durante este fin de semana, de Juan Pablo Albar, el CNB no sólo pierde uno de los mayores expertos internacionales en proteómica sino también a una magnífica persona, cercana y pertrechada de una gran fuerza y ética.
Licenciado en Químicas por la Universidad Complutense de Madrid, donde se doctoró en 1981, Albar dirigía en el CNB tanto el Servicio de Proteómica, como su propio grupo de investigación que centraba sus esfuerzos en el desarrollo y aplicación de herramientas para detectar las proteínas implicadas en las interacciones y rutas metabólicas más relevantes desde el punto de vista de la enfermedad.
Para todos aquellos que hemos disfrutado en el CNB de su compañía y amistad durante todo este tiempo, es un verdadero orgullo haber trabajado con uno de los responsables del despegue de la proteómica en España. Juan Pablo era desde 2005 el coordinador general de ProteoRed, y a partir de 2013, coordinador general de la Plataforma en Red de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos del Instituto de Salud Carlos III
Su trabajo actual radicaba, dentro de la iniciativa Human Proteome Organization de la que formaba parte de su consejo de dirección, en la caracterización de las proteínas codificadas por el cromosoma 16. Un trabajo que es esencial para poder desarrollar nuevos métodos de diagnóstico, prevención y tratamiento de enfermedades humanas.
Nacido en Aranjuez el 3 de enero de 1953, su pasión por la Naturaleza se vio reflejada tanto en su gran afición a la montaña, de la que se encontraba disfrutando horas antes de sufrir el infarto que acabó con su vida, como en el aspecto profesional, siendo el coordinador científico de la expedición Trineo de Viento. Como tal, se responsabilizó de la toma de muestras en la Antártida para proyectos científicos tales como la determinación isotópica de oxígeno e hidrógeno en la nieve, o la búsqueda de contaminantes orgánicos persistentes en el aire.
Nos gustaría recordarle en este vídeo que grabó en el Polo Sur geográfico invitando a todo el mundo a asistir al 13th Annual World Congress of the Human Proteome Organization (Madrid, 5 al 8 de octubre de 2014), a cuya organización dedicó grandes esfuerzos.
Son muchos los mensajes de cariño que hemos recibido estos días en memoria de Juan Pablo. Nos despedimos de él con las palabras escritas por Mariano Esteban que quizá sean las que mejor reflejen nuestros sentimientos y el deseo de todos nosotros:
Querido Juan Pablo:
No nos podemos hacer a la idea de que nos has dejado para siempre, si no mas bien pensamos que te has ido de escalada a explorar esas montañas y naturaleza viva de la que siempre has disfrutado y te has sentido unido. Serás siempre el explorador y apasionado científico del que nos sentiremos orgullosos por haberte conocido. Que sigas por tus montañas.
Con todo nuestro afecto y cariño,
Tus compañeros
Una vez terminado el VII Ciclo de Seminarios Júnior, los estudiantes de doctorado del CNB se reunieron para celebrarlo y empezar a organizar el siguiente.
Investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han participado en un estudio que aumenta nuestros conocimientos sobre la infectividad de los rotavirus, los cuales, según los datos de la Organización Mundial de la Salud, cada año causan la muerte en todo el mundo de casi medio millón de niños menores de 5 años.
Aunque los rotavirus se encuentren en el intestino, explican los investigadores del CNB José L. Carrascosa y José R. Castón “estos no entran en las células hasta que las proteasas del hospedador eliminan una serie de protuberancias que se encuentran en la superficie del virus”. En este trabajo, publicado en la revista PLoS Pathogens, los científicos se centran en el estudio de los cambios conformacionales de las protuberancias esenciales para que el virus sea infectivo.
En colaboración con los laboratorios de Javier María Rodríguez y Daniel Luque en el Centro Nacional de Microbiología del ISCIII, Castón y Carrascosa emplearon diferentes técnicas de microscopía electrónica que les han permitido la construcción de un modelo tridimensional de las protuberancias. Comparando las estructuras de las mismas antes y después del tratamiento con las proteasas, los investigadores han descartado que estas las estabilicen, aunque sí que son las causantes de una serie de movimientos en las protuberancias que le dan al virus su capacidad infectiva.
Los investigadores sugieren que como “los cambios en las protuberancias son necesarios para que los rotavirus entren en las células”, podrían llegar a ser en el futuro un buen punto contra el que dirigir fármacos. De este modo, los datos estructurales obtenidos en estos laboratorios serían de utilidad a la hora de diseñar medicamentos que bloqueen los cambios que permiten la entrada de los virus en las células.
- Rodríguez JM, Chichón FJ, Martín-Forero E, González-Camacho F, Carrascosa JL, Castón JR, Luque D. New insights into rotavirus entry machinery: stabilization of rotavirus spike conformation is independent of trypsin cleavage. PLoS Pathog. 2014; 10(5): e1004157.
Científicos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han desarrollado un antagonista de la hormona jasmonato que potencia las defensas de las plantas y reduce la infección por diversos tipos de microorganismos patógenos. El compuesto desarrollado en el laboratorio de Roberto Solano, coronatine-O-methyloxima (COR-MO), es útil como herramienta bioquímica para estudiar las funciones de esta hormona y podría ser empleado para controlar las infecciones en los cultivos.
Desde que el grupo de Solano descubriera la forma activa de la hormona jasmonato, ha habido varios intentos de modular esta vía hormonal que regula en plantas tanto el desarrollo como la respuesta al estrés. La clave para sintetizar el primer antagonista potente y específico del jasmonato ha sido una toxina bacteriana que imita los efectos de la hormona y suprime las defensas de las plantas.
El análisis de la estructura de dicha toxina y de su diana en las células de las plantas (el receptor del jasmonato) ha permitido que en el laboratorio de Solano en el CNB Isabel Monte haya identificado los residuos de la toxina esenciales para su funcionamiento. A partir de estos datos, han podido diseñar una serie de modificaciones que permiten atenuar las respuestas de las plantas al jasmonato. Así, su nuevo compuesto previene en diferentes especies de plantas los efectos de la toxina durante las infecciones bacterianas, señalando de este modo el potencial biotecnológico del COR-MO a la hora de controlar las infecciones en los cultivos de una forma más segura.
- Monte I, Hamberg M, Chini A, Gimenez-Ibanez S, García-Casado G, Porzel A, Pazos F, Boter M, Solano R. Rational design of a ligand-based antagonist of jasmonate perception. Nat Chem Biol. 2014; doi: 10.1038/nchembio.1575.
En su listado de los científicos más influyentes del mundo Thomson Reuters ha incluido a Roberto Solano. Este biólogo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC es uno de los 47 investigadores españoles que se encuentran entre el 1% más destacado de los científicos más citados del mundo en sus respectivas áreas de trabajo. A Solano podemos encontrarle junto a los 176 científicos que Thomson Reuters incluye en el área de Ciencias Animales y de Plantas.
Solano estudia en su laboratorio los mecanismos moleculares que permiten a las plantas adaptarse al medio ambiente, centrándose en el funcionamiento del jasmonato, una hormona imprescindible para responder al estrés. Sus trabajos han llevado al descubrimiento de la forma activa de esta hormona y al de una familia de proteínas imprescindibles para que el jasmonato ejerza su acción. Estos dos descubrimientos, publicados en las revistas Nature y Nature Chemical Biology, han sido ya citados por otros investigadores más de 750 veces.
El número de citas de un trabajo es un indicador tanto del interés como de la influencia de dicho estudio para otros investigadores. Además, el prestigio de formar parte de la lista de Highly Cited Researchers también recae sobre las instituciones en las que se desarrollan los proyectos científicos. Estos datos los emplea el conocido como Ranking de Shanghái para valorar a las universidades y centros de investigación.
Además de Solano, otros 12 científicos del CSIC se encuentran incluidos en este prestigioso listado.
Investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han descubierto el mecanismo por el que la sombra reduce las defensas de las plantas. Este descubrimiento puede ayudar a diseñar estrategias biotecnológicas que mejoren la producción agrícola en condiciones de alta densidad de cultivo.
La alta densidad de cultivos en la agricultura moderna es responsable del aumento de productividad de las explotaciones agrarias. Sin embargo, tiene un efecto negativo sobre la capacidad de las plantas de defenderse contra insectos y otros patógenos. Según explica el investigador del CNB Roberto Solano, “la sombra que genera la alta densidad de cultivo actúa como una señal que induce el crecimiento vegetal para alcanzar la luz, pero esa redistribución de recursos para el crecimiento tiene como contrapartida una disminución de la capacidad de activación de defensas, entre ellas las que dependen de la fitohormona jasmonato”.
El grupo dirigido por Solano acaba de publicar un trabajo en la revista Plant Cell en el que identifican por primera vez los factores de transcripción necesarios para activar las defensas de la planta frente a insectos y patógenos necrótrofos. En el laboratorio del CNB, José Manuel Chico ha descubierto que los activadores transcripcionales MYC2, MYC3 y MYC4 están regulados negativamente por los represores JAZ. En condiciones de luz, los fotorreceptores de la planta (principalmente PhyB) mantienen niveles altos de MYC2, MYC3 y MYC4. Sin embargo, la sombra inactiva a PhyB y eso reduce la estabilidad de estos activadores transcripcionales, reduciendo los niveles de estas proteínas. Al mismo tiempo, la sombra estabiliza a los represores JAZ, aumentando los niveles de estos represores, lo que contribuye a reducir la capacidad de activación de defensas de la planta por los factores MYC.
- Chico JM, Fernández-Barbero G, Chini A, Fernández-Calvo P, Díez-Díaz M, Solano R. Repression of jasmonate-dependent defenses by shade involves differential regulation of protein stability of MYC transcription factors and their JAZ repressors in Arabidopsis. Plant Cell. 2014; pii: tpc.114.125047.
El viernes 10 de octubre de 2014 se celebrará en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC el 1er Meeting de la Iniciativa en NanoBiomedicina del CNB con el fin de dar visibilidad a la investigación que llevamos a cabo en el área de la NanoBiomedicina tanto grupos del CNB como grupos colaboradores de esta iniciativa pertenecientes al Campus de Excelencia UAM+CSIC.
PROGRAMA
Nanomedicine (Chairs: Luis Ángel Fernández and Domingo F. Barber)
- 9:30 - María del Puerto Morales (Nanocrystals and Chemistry Group, Department of Biomaterials and Bioinspired Materials, ICMM, CSIC). Nanometrology, Standardization Methods for the synthesis and characterization of Magnetic Nanoparticles with applications in biomedicine
- 9:55 - Andrés de la Escosura (Nanoscience and Molecular Materials research Group, Department of Organic Chemistry, Faculty of Science, UAM). Hierarchical and Cooperative Supramolecular Strategies Towards Functional. Virus-Like Nanoparticles
- 10:20 - Luis Ángel Fernández (Department of Microbial Biotechnology & NanoBiomedicine Initiative, CNB, CSIC). Nanobodies and E. coli nanocells
- 10:45 - COFFEE
- 11:15 - Domingo F. Barber (Department of Immunology and Oncology & NanoBiomedicine Initiative, CNB, CSIC). Nanoparticles for targeted release in Immunotherapy
- 11:40 - Fernando Herranz (Advanced Imaging Unit, CNIC). Radionuclide-Fe3O4 nanoparticles: a core-doped nanosystem for dual hot spot imaging
- 12:05 - Aitziber López-Cortajarena / Alvaro Somoza (CNB-IMDEA Nanociencia Associated Unit). Nanoparticle uses in nanomedicine: Nanoparticule Modification and Gold nanoparticles as gene sensors
- 12:30 - Jesús M. de la Fuente (Instituto de Ciencia de materiales, ICMA-CSIC). Designing Inorganic Nanoparticles for Therapy and Diagnosis
- 13:15 - LUNCH
Single Molecule & Nanomachines (Chairs: José L. Carrascosa and Fernando Moreno Herrero)
- 14:30 - Pedro de Pablo (Departamento de Física de la Materia Condensada, UAM). Mechanical properties of viral particles
- 14:55 - Mauricio García Mateu (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, CSIC-UAM). Engineering at the nanoscale
- 15:25 - Julio Gómez-Herrero (Departamento de Física de la Materia Condensada, UAM). New AFM perspectives and modes
- 15:50 - Ricardo Arias-González (CNB-IMDEA Nanociencia Associated Unit). Laser manipulation of biomolecules and functional nanoparticles
- 16:15 - COFFEE
- 16:40 - Fernando Moreno-Herrero (Department of Macromolecular Structures & NanoBiomedicine Initiative, CNB, CSIC). DNA metabolism machineries at the single molecule level
- 17:05 - Borja Ibarra (CNB-IMDEA Nanociencia Associated Unit). Nanomotors at the nanoscale
- 17:30 - Luis Alberto Campos (Department of Macromolecular Structures, CNB, CSIC). Nanobiotechnology
La semana pasada, la red intergubernamental European Cooperation in Science and Technology presentó SALAAM, una iniciativa para compartir los avances obtenidos en la ingeniería genética y el fenotipado de los animales de granja utilizados para experimentación. Esta acción, dirigida por el científico alemán Eckhard Wolf y la francesa Pascale Chavatte-Palmer, tiene como meta el desarrollo de modelos de laboratorio que puedan ser utilizados en medicina traslacional. Entre otros científicos europeos, el investigador del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) Lluís Montoliu participa como experto en la construcción de transgenes.
Los pequeños animales de laboratorio, como los ratones, las ratas o las moscas de la fruta, han sido de una ayuda tremenda a la hora de estudiar y comprender los sistemas biológicos complejos. Sin embargo, para poder llevar a cabo futuros ensayos preclínicos más eficientes que los actuales parece que es necesario emplear conejos, cerdos, cabras, ovejas y vacas. Por eso, esta iniciativa se centra en los animales de granja como modelos para estudiar las enfermedades humanas.
Durante el tiempo que dure esta acción, Montoliu explica que “se organizarán diversas conferencias y cursos, abiertos a cualquier investigador interesado en el tema”. Los seminarios abordarán las nuevas tecnologías disponibles, la creación de bases de datos, la elección del modelo animal adecuado para cada tipo de experimento y, como no podía ser de otra manera, aspectos de bioética y bienestar animal.
En un estudio dirigido por investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han descubierto que los linfocitos T son capaces de capturar por transinfección bacterias de las células dendríticas y matarlas. Estos sorprendentes resultados muestran que los linfocitos T, ejemplo clásico de inmunidad adaptativa, desarrollan funciones que hasta ahora se suponían exclusivas del sistema inmune innato.
Los datos publicados en la revista Cell Host & Microbe "muestran por primera vez que los linfocitos T son capaces de capturar bacterias y matarlas", explica Esteban Veiga, investigador del CNB responsable principal de este estudio. Inesperadamente han descubierto que los linfocitos T transinfectados matan las bacterias de forma más eficiente que las propias células dendríticas.
Analizando en su laboratorio del Instituto de Investigación Sanitaria Princesa (Hospital de Santa Cristina) las diferencias entre los linfocitos T, Aránzazu Cruz-Adalia observó que cuando son transinfectados, producen más citoquinas inflamatorias (como IL-6, TNFα e IFN-γ) que los no infectados. Además, son capaces de proteger in vivo de las infecciones bacterianas.
- Cruz-Adalia A, Ramirez-Santiago G, Calabia-Linares C, Torres-Torresano M, Feo L, Galán-Díez M, Fernández-Ruiz E, Pereiro E, Guttmann P, Chiappi M, Schneider G, Carrascosa JL, Chichón FJ, Martínez del Hoyo G, Sánchez-Madrid F, Veiga E. T cells kill bacteria captured by transinfection from dendritic cells and confer protection in mice. Cell Host Microbe. 2014; 15: 611-622.
Resolviendo la estructura tridimensional de proteínas de la cápsida vírica mediante criomicroscopía electrónica, investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han identificado relaciones evolutivas hasta ahora desconocidas entre virus filogenéticamente distantes.
“Los virus evolucionan tan rápido que el análisis de sus secuencias genómicas no puede ser utilizado para encontrar relaciones entre virus filogenéticamente muy distantes”, explica José R. Castón, investigador responsable de un estudio que se acaba de publicar en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences USA. En este trabajo presentan la estructura de la proteína de la cápsida del virus de Penicillium chrysogenum (PcV) y muestran el plegamiento de la proteína progenitora del linaje de los virus ARN de doble cadena (dsRNA).
En colaboración con los grupos de Nùria Verdaguer (IBMB/CSIC), Niko Grigorieff (Brandeis University, USA) y Said Ghabrial (Kentuky University, USA), el equipo de Castón ha observado que la proteína de la cápside de este virus tiene dos mitades que, sin ser genéticamente similares, son dos α-hélices repetidas, indicando que provienen de la duplicación de un mismo gen. Este núcleo helicoidal conservado aumentó su complejidad por la duplicación inicial del gen y, seguidamente, por la inserción en puntos específicos (hotspots) de distintos segmentos peptídicos.
La identificación de los motivos estructurales ancestrales en el tipo de plegamiento conservado en el linaje de los virus dsRNA ha permitido la identificación de relaciones filogenéticas hasta ahora desconocidas.
- Luque D, Gómez-Blanco J, Garriga D, Brilot AF, González JM, Havens WM, Carrascosa JL, Trus BL, Verdaguer N, Ghabrial SA, Castón JR. Cryo-EM near-atomic structure of a dsRNA fungal virus shows ancient structural motifs preserved in the dsRNA viral lineage. PNAS. 2014; doi: 10.1073/pnas.1404330111.
Un estudio realizado por investigadores de CIBERNED del Centro Nacional de Biotecnología (CNB) y del Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CBMSO) ha identificado que la ausencia de la proteína WIP favorece la formación de contactos neuronales más grandes pero menos plásticos en respuesta a estímulos.
Estos contactos neuronales, conocidos como espinas dendríticas, posibilitan la conexión entre neuronas emisoras y receptoras, en estructuras conocidas como sinapsis, que cambian en número, tamaño y sensibilidad en respuesta a estímulos (plasticidad). Esta plasticidad sináptica es la base celular del aprendizaje y la memoria, relacionándose las alteraciones en la sinapsis con diferentes disfunciones neurológicas como el autismo, la esquizofrenia, la enfermedad de Alzheimer, el Síndrome de Down, la depresión o el trastorno bipolar.
La colaboración entre los laboratorios dirigidos por Inés Antón (CNB-CSIC; CIBERNED) y Lola Ledesma (CBMSO), ambos situados en el Campus de Excelencia UAM-CSIC, aborda la influencia en estos procesos de la proteína WIP, aportando nuevos datos sobre el mecanismo que regula la morfología y la actividad de las espinas dendríticas, al haber permitido identificar dicha proteína como el punto de conexión entre la composición lipídica de la membrana y el citoesqueleto en estas estructuras. Así, se ha llegado a la conclusión de que la ausencia de WIP reduce los niveles del lípido esfingomielina en la membrana plasmática, activando así un conjunto de proteínas que aumentan la cantidad de filamentos de actina del esqueleto celular y favoreciendo la formación de espinas dendríticas más grandes y estables.
Al relacionar este descubrimiento con los datos de otros estudios que sugieren que la estabilidad de las espinas dendríticas se relaciona con un incremento en la memoria frente a estímulos concretos y con una disminución en la capacidad de aprendizaje, se ha conseguido identificar en un modelo de ratón la contribución de la proteína WIP al correcto funcionamiento sináptico, y en su aplicación a humanos podrían explicar el origen de las alteraciones neurológicas descritas en pacientes con modificaciones en la región génica que codifica esta proteína.
Según explica Ana Franco-Villanueva, coautora del estudio, “con la simple adición del lípido esfingomielina hemos corregido el defecto sináptico en un modelo de cultivo neuronal de ratón deficiente en WIP, proporcionando la primera estrategia para el futuro tratamiento de los pacientes”.
- Franco-Villanueva A, Fernández-López E, Gabandé-Rodríguez E, Bañón-Rodríguez I, Esteban JA, Antón IM, Ledesma MD. WIP modulates dendritic spine actin cytoskeleton by transcriptional control of lipid metabolic enzymes. Hum Mol Genet. 2014; doi: 10.1093/hmg/ddu155.
En un estudio que investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han publicado en la revista PLoS Pathogens se identifica la proteína viral clave para que el coronavirus del SARS produzca lesiones pulmonares.
Luis Enjuanes, el investigador del CNB responsable principal de este trabajo, explica que “el coronavirus del SARS induce una respuesta inflamatoria incontrolada que causa daño pulmonar, edema, hipoxemia severa y eventualmente la muerte. Lo que hemos encontrado es que la actividad de la proteína E como transportadora de iones promueve las lesiones que causa el SARS”. Estos descubrimientos podrían llegar a usarse para desarrollar una terapia contra esta enfermedad.
En colaboración con científicos de la Universitat Jaume I de Valencia, el investigador del CNB José Luis Nieto Torres ha generado coronavirus del SARS en los que su proteína de la envoltura carece de sus propiedad como transportadora de iones. Sin esta función, el virus se atenúa, reduciéndose la respuesta inflamatoria dañina que provoca a los ratones infectados.
Como hay varios virus muy patógenos con proteínas transportadoras de iones similares a las de estos coronavirus, Enjuanes comenta que sus resultados podrían ser relevantes en el estudio de infecciones de virus como el de la gripe A, el sida o la hepatitis C.
- Nieto-Torres JL, Dediego ML, Verdiá-Báguena C, Jimenez-Guardeño JM, Regla-Nava JA, Fernandez-Delgado R, Castaño-Rodriguez C, Alcaraz A, Torres J, Aguilella VM, Enjuanes L. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus envelope protein ion channel activity promotes virus fitness and pathogenesis. PLoS Pathog. 2014; 10(5): e1004077.
El 27 de mayo de 2014 se celebra en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC una jornada sobre edición genómica.
Organizada en por el Servicio de Transgénesis CNB-CBMSO y Sigma, quien patrocina el evento, se llevará a cabo en el Salón de Actos del CNB desde las 10:20 hasta las 14:30. La inscripción se realiza a través del formulario.
Programa:
- Silvia Di Meglio (Sigma-Aldrich, EMEA)
Using CRISPr and ZFN Technologies for creation of Transgenic animals - Belen Pintado (CNB-CBMSO, Madrid)
Genome editing. Impact on animal use - Roger Badia (Hospital Germans Trias i Pujol)
Working with ZFN: Practical issues learnt from HIV research - Ignacio Anegon (INSERM UMR, Nantes)
Gene editing of the rat genome using ZFNs and other gene-specific nucleases - Davide
Seruggia (CNB-CSIC, Madrid)
From TALENs to CRISPR: new tools for genome editing
Para que el HIV-1 entre en los glóbulos blancos, debe unirse a la proteína CD4 y a los correceptores CXCR4 o CCR5. Las cepas X4 del HIV-1 usan el correceptor CXCR4, mientras que las cepas R5 utilizan el CCR5. En personas recién infectadas por el virus del sida se aísla principalmente la cepa R5 del HIV-1, la cual infecta a células del sistema inmune tales como macrófagos, células dendríticas y linfocitos T CD4+. Estas células, que expresan CCR5 y algo de CXCR4, se encuentran en la mucosa genital y rectal y en los órganos linfoides del aparato digestivo. En la mitad de los pacientes, las cepas R5 mutan a cepas X4, un cambio que se asocia a la pérdida de linfocitos T CD4+ y al desarrollo de la enfermedad.
En un estudio que investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) publican en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences USA se determina que CD4, CXCR4 y CCR5 forman oligómeros en las membranas de las células. Los resultados muestran además que la proporción de CXCR4 respecto a CCR5 controla la unión a las membranas de las cepas X4 del HIV-1, un paso necesario para que se produzca la entrada del HIV a las células hospedadoras. Los autores de este trabajo concluyen que según sean los niveles de CCR5 en las células diana, la unión de los virus X4 HIV-1 y por lo tanto su entrada en las células y la infección resultan bloqueadas. Este descubrimiento podría aplicarse para proteger a los linfocitos de la infección por HIV.
Sin la existencia en la actualidad de una vacuna efectiva contra el sida, “una nueva estrategia para impedir la infección del sida podría ser el diseño de fármacos que mimetizaran los efectos de CCR5 en las membranas celulares”, explica Mario Mellado, científico del CNB e investigador principal de este estudio. Comenta además que estos resultados ayudan a comprender por qué las cepas X4 del HIV-1 “conducen a una progresión más rápida de la enfermedad con un empeoramiento de los síntomas” y cómo la proporción de los receptores influye en la susceptibilidad a la infección.
- • Martínez-Muñoz L, Barroso R, Dyrhaug SY, Navarro G, Lucas P, Soriano SF, Vega, B, Costas C, Muñoz-Fernández MA, Santiago C, Rodríguez-Frade JM, Franco R, Mellado M. CCR5/CD4/CXCR4 oligomerization prevents HIV-1 gp120IIIB binding to the cell surface. Proc Natl Acad Sci USA. 2014; doi: 10.1073/pnas.1322887111.
Los virus ARN, entre los que se encuentran muchos patógenos para humanos, animales y plantas, replican sus genomas en membranas del interior de las células. En estas membranas los virus reclutan factores celulares que participan en el ensamblaje y actividades de los complejos replicativos. Estos agregados macromoleculares, que suelen ensamblarse en vesículas con aperturas al citosol o “esférulas”, se encargan de fabricar múltiples copias del genoma viral que se incorporarán posteriormente en las nuevas partículas virales infectivas. Aunque se han identificado numerosos factores necesarios para el ensamblaje funcional de los orgánulos de replicación viral se desconoce la función exacta de la mayoría de ellos.
En colaboración con investigadores de la Universidad de Kentucky en los Estados Unidos, el laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) dirigido por Cristina Risco han encontrado evidencias de una función inesperada y sorprendente que desempeña la proteína celular Vps4 en la replicación de un virus ARN perteneciente a la familia de los Tombusvirus, patógenos que infectan plantas y que causan importantes pérdidas en cosechas.
Vps4 es un componente de las proteínas celulares ESCRT y de la familia de las ATPasas AAA+ que usan ATP para remodelar estructuras macromoleculares en las células. Vps4 participa en una variedad de procesos biológicos como por ejemplo la fusión de membranas para la formación de vesículas. Utilizando nuevas técnicas de imagen en microscopía electrónica y según acaban de publicar en la revista PLoS Pathogens, los autores han demostrado que Vps4 participa en la estabilización del poro o cuello de las esférulas a través del cual se produce el intercambio de materiales con el citosol. Esta apertura controlada es necesaria para que el complejo replicativo desempeñe sus funciones y para que el ARN viral quede protegido de la degradación por nucleasas.
A diferencia de lo que ocurre en los procesos celulares habituales en los que participa, Vps4 se incorpora de manera estable en las vesículas virales o esférulas y pasa a formar parte del complejo replicativo. De hecho cuando Vps4 no está presente se forman esférulas totalmente abiertas, sin constricción o cuello y en las que el ARN viral de nueva síntesis está desprotegido. Los autores proponen que Vps4 y otras proteínas ESCRT son indispensables para la deformación de las membranas y el ensamblaje de los complejos replicativos de Tombusvirus. Es muy probable que otros virus de plantas y animales que transforman membranas celulares para construir esférulas también utilicen estas proteínas para ensamblar sus replicasas y proteger sus genomas recién sintetizados.
- Barajas D, Martín IFdC, Pogany J, Risco C, Nagy PD. Noncanonical role for the host Vps4 AAA+ ATPase ESCRT protein in the formation of Tomato bushy stunt virus replicase. PLoS Pathog. 2014; 10(4): e1004087.
The Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC) is organising its 2nd Course on Introduction to Research for students in the final years of any university degree in science. The course is designed for qualified, highly motivated students who would like to contact the scientists at the CNB. The goal of this course is to provide an overview of the centre’s cutting-edge research facilities.
The four-week course will be held from June 30 to July 25, 2014. Up to 12 selected students will be registered free of charge.
For four weeks, the students will participate in the scientific activities of two research departments of their choice (2 weeks each), attend seminars on hot topics in today’s life sciences, and meet and talk with CNB scientists. Candidates are counselled to visit our website to learn about our projects and interests.
The completed application (doc/odt/pdf) form must be received before 30 May 2014, by e-mail to Alfonso Mora or by post to the Centro Nacional de Biotecnología (2nd Course on Introduction to Research), c/ Darwin #3, 28049 Madrid, Spain.
SELECTED STUDENTS
- Ricardo Sánchez de la Nieta Moreno
- Sara Herrera de la Mata
- Alberto Jesús González Hernández
- Andrés Sanz Morejón
- Iris Barragán Sánchez
- Dorota Kuczek
- Sergio Gómez López
- Isabel Tundidor Pérez
- Adolfo Alsina López
- Lorena Blázquez Conchillo
- Pilar Montero Calle
- Julio Téllez de Pablos
A lo largo de su evolución, los virus ARN han incorporado una serie de mecanismos para solventar las limitaciones de tener un genoma pequeño y relativamente sencillo. Deben asegurar que dentro de la célula hospedadora esté disponible tanto en el espacio como en el tiempo todo aquello necesario para su replicación, ensamblaje y amplificación. En este tipo de virus, una de las estrategias más comunes para disponer en un momento preciso de las proteínas necesarias es la proteolisis de una poliproteína.
El grupo de investigación de Juan Antonio García y Carmen Simón centra sus esfuerzos en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) en la endopeptidasa P1 de uno de los principales grupos de virus ARN que infectan a las plantas, los potyvirus. Aunque no se sabía su contribución exacta a la infección viral, algunos datos indicaban que P1 estaba implicada en la selección de hospedadores por parte del virus. Ahora, este grupo acaba de mostrar que el extremo amino-terminal de la proteína P1 de los potyvirus reduce la actividad autoproteolítica de esta enzima según el hospedador en el que se encuentre. Fabio Pasin, que realiza sus tesis doctoral en el CNB gracias a una beca de la Fundación La Caixa, ha observado que al eliminar esta región de la proteína P1 se acelera la replicación temprana del virus y aumenta la severidad de los síntomas. Todo ello, acompañado en la planta de un mayor número de marcadores marcadores de resitencia y una menor acumulación de virus.
Estos resultados sugieren que el ajuste fino de la actividad de la proteasa P1 ha evolucionado para mantener la amplificación del virus a unos niveles no que causen demasiado daño al hospedador asegurando, eso si, la óptima replicación a largo plazo del virus. El estudio, que acaba de publicarse en la revista PLOS Pathogens, aporta nuevos datos experimentales que apoyan la teoría de que los virus mantienen unos niveles de replicación adecuados en dos hospedadores diferentes.
- Pasin F, Simón-Mateo C, García JA. The hypervariable amino-terminus of P1 protease modulates potyviral replication and host defense responses. PLoS Pathog. 2014; 10(3): e1003985.
Las células eucariotas cuentan con el llamado sistema ubiquitino-proteosómico para degradar sus proteínas. Pero no es solo un sistema de deshecho, si no que al actuar de forma selectiva sobre algunas de ellas, es un mecanismo de control de la homesotasis de las proteínas, algo esencial en procesos vitales de las plantas como puedan ser la embriogénesis o la floración.
En su laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB), el grupo de Vicente Rubio estudia cómo el sistema ubiquitino-proteosómico regula el crecimiento de las plantas cuando están sometidas a estreses ambientales. Y acaban de descubrir en Arabidopsis que la pequeña proteína DDA1, existente tanto en plantas como en animales, es esencial para la estabilidad de los receptores de la hormona ácido abscísico (ABA). Esta hormona vegetal participa en la germinación de las semillas, controla el desarrollo de las plántulas e inicia las respuestas ante los estreses ambientales. Conocido como la "hormona de la sequía", el ácido abscísico es fundamental para que las plantas se adapten a la salinidad y al estrés osmótico, permitiéndolas vivir en condiciones adversas.
En su último trabajo, que acaban de publicar en la revista Plant Cell, María Luisa Irigoyen y Elisa Iniesto, junto a otros miembrops del grupo de Rubio, demuestran en la planta Arabidopsis thaliana que DDA1 forma parte de un complejo de proteínas implicado en la degradación proteosomal. Han encontrado que en las semillas y en las plántulas, esta pequeña proteínas se una alos recpetores del ácido abscísico facilitando así su degradación. De este modo, explica Rubio, tiene una función "negativa en la regulación de las respuestas a los estreses abióticos medidadas por ABA".
Los niveles de ABA son elevados en las semillas secas, lo que impide sus germinación. En las plantas adultas, estos niveles elevados lo que hacen es inhibir el crecimiento de las raíces y promover en las hojas el cierre de los estomas por los que la planta intercambia los gases. Cuando las condiciones ambientales son óptimas, los niveles de ABA disminuyen, los complejos que contiene DDA1 se activan más, degradando los receptores de ABA. Esto último consigue mantener los niveles necesarios de ABA a la vez que minimiza sus efectos inhibitorios (cierre de los estomas y retraso del crecimeinto) justo en el momento que no es necesario, durante la germinación o cuando no hay estrés.
- Irigoyen ML, Iniesto E, Rodríguez L, Puga MI, Yanagawa Y, Pick E, Strickland E, Paz-Ares J, Wei N, De Jaeger G, Rodriguez PL, Deng XW, Rubio V. Targeted degradation of abscisic acid receptors is mediated by the ubiquitin ligase substrate adaptor DDA1 in Arabidopsis. Plant Cell. 2014; doi: 10.1105/tpc.113.122234.
La artritis reumatoide es una enfermedad autoinmune que aunque afecta principalmente a las articulaciones, causa también inflamación crónica en multitud de tejidos y órganos. Se calcula que afecta al 1% de la población, con síntomas desde la hiperplasia sinovial hasta la destrucción de las articulaciones. Todos estos síntomas son consecuencia de una liberación continua y desregulada de citoquinas inflamatorias.
El grupo de Ana Cuenda investiga en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) el papel que juegan en la regulación de la producción de citoquinas las cuatro quinasas de la familia p38MAPK. En concreto, centran sus esfuerzos en ver la implicación específica de cada una de ellas en la patogénesis de la artritis reumatoide con la intención de que se puedan desarrollar nuevos tratamientos más eficaces y seguros que los actuales.
En un trabajo que acaban de publicar en colaboración con investigadores del Hospital '12 de Octubre' de Madrid en la revista Arthritis and Rheumatism, el grupo de Cuenda presenta el descubrimiento de que la eliminación de los genes de las quinasas p38γ y p38δ “reduce significativamente tanto la incidencia como la severidad de la artritis“. Induciendo artritis en ratones con colágeno, la falta de estas dos proteínas se acompañaba además con una menor producción de citoquinas. Estos resultados, comenta Cuenda, muestran que las quinasas p38γ y p38δ son cruciales para regular la inflamación de las articulaciones y la destrucción de los huesos que se producen en la artrtitis y, por tanto, serían dos nuevas dianas terapéuticas en el tratamiento de la artritis reumatoide.
- Criado G, Risco A, Alsina-Beauchamp D, Pérez-Lorenzo MJ, Escós A, Cuenda A. Alternative p38 mitogen-activated protein kinases are essential for collagen-induced arthritis. Arthritis Rheum. doi: 10.1002/art.38327.
En la superficie de muchos tipos de células los mamíferos podemos encontrar cilios, los cuales participan en multitud de procesos fisiológicos que van desde el crecimiento celular y el desarrollo hasta la percepción del ambiente en el que se encuentran. Su importancia se pone de manifiesto si tenemos en cuenta algunas enfermedades causadas por defectos en estos orgánulos: el hidrocéfalo, la anosmia (pérdida del olfato) o la retinitis pigmentaria.
El grupo de investigación del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC dirigido por Karel H.M. van Wely estudia las proteínas involucradas en la formación y en el desensamblaje de los cilios. Si bien se conoce desde hace tiempo su regulación asociada a la mitosis de la céllulas, en este laboratorio del CNB se acaban de encontrar un mecanismo que regula el tamaño de los cilios cuando la célula no se está dividiendo. Los experimentos que ha realizado en este laboratorio Ainhoa Sánchez de Diego, y que acaba de publicar en la revista Nature Communications, muestran que cuando las céllulas no están creciendo la distribución subcelular de la deacetilasa HDAC6 es esencial para controlar el tamaño de los cilios.
En esta publicación se demuestra que no sólo es necesario que una quinasa active a HDAC6, es también clave para actuar sobre un sustrato u otro la localización de la deacetilasas en el interior de la célula. La proteína Dido3, descubierta por este mismo grupo, es fundametal a la hora de regular tanto los niveles de HDCA6 en la base de los cilios como el grado de acetilación de la tubulina.
- Sánchez de Diego A, Guerrero AA, Martínez-A C, van Wely KHM. Dido3-dependent HDAC6 targeting controls cilium size. Nat Commun. 2014; doi: 10.1038/ncomms4500.
El gobierno de la Comunidad de Madrid recientemente financió el proyecto de investigación PROFUN II: Interactomics of the Centrosome (CS Interactomics) que tiene como objetivo el estudio de la interactómica del centrosoma, un orgánulo celular clave en el proceso de organización de la arquitectura celular. En este proyecto, varios grupos de investigadores de Madrid están uniendo esfuerzos para proporcionar un impulso cualitativo al conocimientos del centrosoma, una pieza fundamental para la comprensión de la célula.
En este contexto, el grupo de Bioinformática funcional del CNB dirigido por Alberto Pascual-Montano ha desarrollado CentrosomeDB, una base de datos que recoge e integra información relevante sobre el centrosoma. Esta base de datos ofrece diferentes perspectivas para el estudio de las proteínas del centrosoma, incluyendo su estructura, su función y su evolución. Además, contiene información sobre las homologías con las proteínas de otras especies, así como datos de su función, su relación con enfermedades (SNP) o la estructura tridimensional de las mismas. Se han incorporado también, resultados sobre las interacciones demostradas entre las proteínas.
Desde su publicación, esta nueva jerramienta ha recibido ya más de 10.000 visitas al ser probablemente la base de datos más completa de proteínas del centrosoma. En estos momentos contiene 1.053 proteínas centrosomales humanas y 304 de Drosophila melanogaster, una mejora significativa respecto a otras herramientas y repositorios existentes.
La base de datos se puede consultar públicamente en http://centrosome.cnb.csic.es.
- Alves-Cruzeiro JM, Nogales-Cadenas R, Pascual-Montano AD. CentrosomeDB: a new generation of the centrosomal proteins database for Human and Drosophila melanogaster. Nucleic Acids Res. 2014; 42(1): D430-D436.
El Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) ha sido distinguido por un jurado internacional en el marco del programa de excelencia Severo Ochoa. La acreditación como centro de excelencia Severo Ochoa tiene una validez de cuatro años y proporciona un millón de euros anuales para el CNB.
Este reconocimiento, que llega en un momento de dificultades por la actual situación económica del país, es sobre todo, como explica la directora del CNB Carmen Castresana “un reconocimiento al trabajo y al esfuerzo de todos los que trabajamos y hemos trabajado en el CNB”.
La financiación Ochoa nos permitirá emprender acciones estratégicas que beneficien al centro en su conjunto. En concreto, en el Centro Nacional de Biotecnología, dedicaremos la financiación obtenida a implementar nuevas aproximaciones científicas basadas en programas de Biología de Sistemas, Biología Sintética y Biología Computacional, además de dedicar nuestros recursos a la incorporación de nuevos científicos, a la adquisición de equipos, y a actividades relacionadas con la transferencia tecnológica, la formación, y la divulgación.
El programa Severo Ochoa reforzará la ventaja competitiva y seña de identidad del CNB como centro multidisciplinar que desarrolla y aplica tecnología puntera para resolver problemas relacionados con la salud humana y animal, la agricultura y el medioambiente.
Las bacterias que atacan a las plantas, además de secretar toxinas, inyectan en las células vegetales proteínas efectoras que favorecen la infección. Algunas cepas de Pseudomonas producen una toxina llamada coronatina que desorganiza la fisiología de la célula e impide el funcionamiento de sus defensas. La coronatina imita el funcionamiento de una de las hormonas encargadas de activar las defensas contra los hongos, el jasmonato. Pero, al mismo tiempo, promueve el crecimiento bacteriano al inhibir los mecanismos de defensa dependientes del ácido salicílico, los cuales son fundamentales para resitir las infecciones por Pseudomonas.
El grupo dirigido por Roberto Solano en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC intenta elucidar cómo las cepas de Pseudomonas que no producen coronatina, la mayoría de ellas, son capaces de alterar las hormonas de las plantas y qué mecanismos han evolucionado para que puedan infectarlas.
Aparte de las fitotoxinas, las cepas de Pseudomonas producen hasta 30 proteínas efectoras de tipo III distintas que son capaces de suprimir de forma activa las defensas de las plantas infectadas. Para el caso concreto de uno de estos efectores, HopX1, Solano acaba de encontar en su laboratorio del CNB que en la planta modelo Arabidopsis, tanto la expresión exógena de HopX1 como la infección natural por cepas de Pseudomonas que producen este efector, promueven el crecimeinto bacteriano de manera similar a la coronatina: activando la expresión de los genes dependientes del jasmonato. Sus resultados indican que HopX1 es una cisteína proteasa que imita los efectos de la coronatina al degradar a represores esenciales en el funcionamiento de la vía de señalización del jasmonato, las llamadas proteínas jasmonate-ZIM domain (JAZ).
Estos resultados, publicados en la revista PLoS Biology, muestran un mecanismo hasta ahora desconocido por el que los patógenos manipulan los puntos clave de la respuesta hormonal que usan las plantas para protegerse frente a las infecciones.
- Gimenez-Ibanez S, Boter M, Fernández-Barbero G, Chini A, Rathjen JP, Solano R. The bacterial effector HopX1 targets JAZ transcriptional repressors to activate jasmonate signaling and promote infection in Arabidopsis. PLoS Biol. 2014; 12(2): e1001792.
La científica del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) Selena Giménez-Ibáñez ha sido becada en la 16º edición internacional del Programa L'Oréal-UNESCO For Women in Science. Giménez-Ibáñez se convierte de este modo en la tercera española becada en los 16 años de este programa.
Selena Gimánez-Ibáñez estudió Ingeniería Agrónoma en la Universidad Politécnica de Valencia y obtuvo su doctorado en The Sainsbury Laboratory (Norwich, Reino Unido), uno de los principales centros europeos en investigación de enfermedades en plantas, donde se especializó en fitopatología vegetal y mecanismos de resistencia de plantas a enfermedades.
Desde hace tres años trabaja en el CNB con el profesor Roberto Solano, intentando descubrir nuevos componentes de defensa en las plantas y cómo transferirlos a especies agronómicas con importancia económica. "Hacemos grandes esfuerzos por movilizar los descubrimientos del laboratorio al campo, y de ahí a la sociedad", afirma Selena.
Su trabajo se centra en averiguar los mecanismos de defensa de las plantas contra los microbios que las rodean, así como descubrir los mecanismos que utilizar ciertas bacterias patógenas para infectar a las plantas.
Sus logros más relevantes en los últimos años se han basado en la caracterización del sistema inmune de las plantas -el llamado sistema inmune basal-. Las plantas tienen unos 600 receptores que lo ven todo, son como ojos encargados de ver lo que pasa fuera y responder adecuadamente a cada estímulo. Precisamente, el segundo hito de su investigación es haber identificado moléculas microbianas que destruyen estos receptores para cegar a las plantas y poder hacer con ellas lo que quieran, es decir, causar una enfermedad. Muy recientemente, Selena ha demostrado que esas moléculas microbianas son capaces también de manipular las hormonas de las plantas y dejarlas desorientadas, lo que es completamente necesario para lograr la infección.
Convencida de que en la ciencia se esconden las respuestas de la mayoría de los problemas económicos actuales, el objetivo final de Selena Giménez-Ibáñez es solucionar el gran problema de las pérdidas de producción que se producen cada año por culpa de la plagas de enfermedades. "La FAO estima que aproximadamente el 10% de la producción mundial se pierde por enfermedades. Así que cualquiera puede imaginar el problema tan grave al que nos enfrentamos en un mundo con población creciente y grandes focos de hambre en el tercer mundo", explica la joven científica.
Respecto a la beca L’Oréal-UNESCO For Women in Science que recibirá en París el próximo 19 de marzo, destaca que le permitirá abrir su actual proyecto en curso, en áreas nuevas, manteniendo mis principales intereses científicos. "El objetivo es ir a un grupo líder de investigación como el de Dr. Vardis Ntoukakis en Inglaterra. Allí están haciendo cosas muy novedosas que permitirán solucionar problemas agronómicos que padecemos ahora".
La producción de interleuquina 4 (IL-4) por parte tanto de basófilos como de linfocitos de tipo Th2 es uno de los pasos clave en la respuesta contra helmintos. Sin embargo, la producción de IL-4 también forma parte de las reacciones alérgicas, las cuales pueden llegar a producir cuadros clínicos severos como el asma o la anafilaxis.
Estudiando el papel de la IL-4 en la respuesta inmunitaria de tipo TH2, el grupo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) dirigido por Carlos Ardavín ha descubierto que esta citoquina modula la función de las células dendríticas. En su trabajo, publicado en la revista Journal of Allergy and Clinical Immunology, describen tanto los genes de las células dendríticas regulados por la IL-4 como los mecanismos moleculares que regulan este proceso.
Analizando la respuesta de las céllulas dendríticas a los ligandos provenientes de patógenos que se unen a los receptores de tipo Toll, Ardavín y su grupo observaron que la IL-4 bloqueaba en las células dendríticas la expresión de los genes relacionados con la inducción de las reacciones inflamatorias y la polarización de la respuesta inmune de tipo Th1. Esto se produce a través de la hipoacetilación de las histonas situadas en las regiones promotoras de estos genes, con lo que se licencia a las células dendríticas a que induzcan una reacción alérgica de tipo Th2 en respuesta a los alergenos de los ácaros del polvo.
- López-Bravo M, Minguito de la Escalera M, Domínguez PM, González-Cintado L, del Fresno C, Martín P, Martínez del Hoyo G, Ardavín C. IL-4 blocks TH1-polarizing/inflammatory cytokine gene expression during monocyte-derived dendritic cell differentiation through histone hypoacetylation. J Allergy Clin Immunol. 2013; 132(6): 1409-1419.
Uno de los mayores retos de la era post-genómica es el de descifrar cómo se regula en los seres vivos la expresión de todos los genes. En el caso de las plantas, sabemos que los factores de transcripción se unen a miles de fragmentos distintos del ADN y que solo algunas de estas unionen inician la expresión de estos genes. Algo que dificulta enormemente averiguar cuáles son las secuencias clave para que se produzca o no una proteína.
En el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, los grupos de investigación de Roberto Solano y José M. Franco-Zorrilla, en colaboración con el grupo de Pablo Vera en el Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas de Valencia, han conseguido identificar en Arabidopsis thaliana la secuencia diana específica de 63 factores de transcripción. Para ello han tenido que desarrollar unas matrices de hibridación de alta capacidad (microarrays). Para poder diferenciar la uniones biológicamente significativas, analizaro también los genes regulados por mutantes de estos factores de transcripción y analizaron los datos del transcriptoma de los mismos. Combinando las secuencias de ADN con los datos obtenidos de la expresión de los genes, han conseguido hacer una serie de predicciones que indican el papel de cada factor de transcripción bien como activador, bien como represor de la expesión de genes concretos.
Estos resultados, que acaban de publicar en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences USA, muestran que con los microarrays desarrollados en la Unidad de Genómica del CNB son capaces de identificar la especificidad de unión de los factores de transcripción al ADN. este nuevo método es mejor que los anteriores tanto por su precisión como por su capacidad de analizar grandes cantidades de secuencias. De hecho, la tecnología desarrollada por Franco-Zorrilla y Solano ha sido ya empleada en un estudio publicado en la revista Cell en el que descubren un mecanismo molecular por el que la auxina controla el crecimiento y desarrollo de las plantas.
- Franco-Zorrilla JM, López-Vidriero I, Carrasco JL, Godoy M, Vera P, Solano R. DNA-binding specificities of plant transcription factors and their potential to define target genes. Proc Natl Acad Sci USA. 2014; 111(6): 2367-2372.
- Boer DR, Freire-Rios A, van den Berg WA, Saaki T, Manfield IW, Kepinski S, López-Vidrieo I, Franco-Zorrilla JM, de Vries SC, Solano R, Weijers D, Coll M. Structural basis for DNA binding specificity by the auxin-dependent ARF transcription factors. Cell. 2014; 156(3): 577-589.
Los rhinovirus humanos son los causantes del resfriado común, una enfermedad contagiosa ampliamente extendiada y que, debido al coste de la medicación y al absentismo laboral que causa, supone un impacto económico elevado. Al no existir un tratamiento efectivo, la medicación actual tan solo alivia los síntomas que nos causa.
El grupo de investigación del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC dirigido por José R. Castón estudia como los rhinovirus humanos consiguen liberar su genoma al citoplasma de la célula a la que infectan, paso previo imprescindible para poder así iniciar su multiplicación. Para ello, mediante crio-microscopía y cristalografía de rayos X, estudian los cambios que sufre el virus durante el proceso infectivo.
En colaboración con los grupos de Dieter Blaas (Max F. Perutz Laboratories de la Medical University of Vienna), de Nuria Verdaguer (Instituto de Biología Molecular de barcelona-CSIC) y de Benes L. Trus (National Institutes of Health en Bethesda, EE.UU.), Castón ha observado una serie de cambios sustanciales que se producen cuando los rhinovirus se hacen infectivos. En concreto, en los contactos entre el ARN y las proteínas del virus durante uno de los pasos intermedios de este cambio, la partícula A. Cabe destacar además que estas modificaciones en la parte interior de la partícula viral A provocan unos cambios fundamentales en la conformación del ARN de virus, que pasa a estar organizado a modo de capa bajo la cubierta proteica.
Estos datos, que acaban de publicarse en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences USA, apoyan un modelo en el que para que el genoma pase de forma eficiente al citoplasma de la célula infectada, antes el ARN debe abandonar su estado relajado inicial y contactar con la membrana proteica. Solo así podrá dirigirse de forma dinámica hacia el poro por el que saldrá.
Como se puede apreciar en el siguiente vídeo, el virus nativo (azul) sufre una serie de cambios conformacionales y progresa hacia la partícula A (verde). Estos cambios, tanto de la cápsula proteica como del ARN, se siguen produciendo hasta que el virus adquiere la forma infectiva como partícula B (naranja).
- Pickl-Herk A1, Luque D, Vives-Adrián L, Querol-Audí J, Garriga D, Trus BL, Verdaguer N, Blaas D, Castón JR. Uncoating of common cold virus is preceded by RNA switching as determined by X-ray and cryo-EM analyses of the subviral A-particle. Proc Natl Acad Sci USA. 2013; 110(50): 20063-20068.
A través de la participación del Centro Nacional de Biotecnología (CNB) y del Centro de Investigaciones Biológicas (CIB), el CSIC participa en una iniciativa, junto a más de 30 universidades europeas, institutos de investigación y empresas, para desarrollar nuevos antibióticos frente a patógenos Gram- negativos. El programa, denominado ENABLE, tiene una duración de 6 años y está liderado por GlaxoSmithKline y la Universidad de Uppsala. Cuenta además con el apoyo de la Iniciativa sobre Medicamentos Innovadores (IMI).
La crisis de los antibióticos
El mundo se enfrenta a una creciente epidemia de resistencia a los antibióticos, sin embargo sólo se han introducido en el mercado dos nuevas clases de antibióticos en los últimos 30 años. El descubrimiento y desarrollo de nuevos antibióticos es esencial para mantener los avances médicos, pero plantea retos científicos, clínicos y financieros importantes, en particular para los antibióticos activos contra las bacterias Gram- negativas (como E. coli). Estas bacterias tienen barreras eficaces contra las drogas, su tratamiento resulta difícil, y adquieren resistencias con facilidad. Los nuevos antibióticos que se descubren han de ser siempre utilizados con precaución para retrasar la aparición de resistencias en los microbios que se quieran tratar, por lo que se dificulta la amortización de las inversiones realizadas para su desarrollo.
Colaboración privada y pública
En respuesta a estas barreras en el desarrollo de nuevos antibióticos, IMI, una asociación de investigación entre la Comisión Europea y las principales compañías farmacéuticas (a través de la EFPIA, la Federación Europea de Industrias y Asociaciones Farmacéuticas), ha puesto en marcha una serie de proyectos llamados ND4BB, unas siglas con cierta gracia en lengua inglesa que significan “nuevas drogas para bichos malos”. Su propósito es superar los cuellos de botella en el desarrollo de nuevos antibióticos y propugnar que se usen de forma eficaz.
El proyecto ENABLE, el tercero en la serie ND4BB, agrupa 13 países y reúne a 32 socios con la misión de establecer una importante herramienta para encontrar fármacos antibacterianos promocionando el avance de los programas de investigación a través del descubrimiento de nuevos compuestos y de la realización de la primera fase de ensayos clínicos. La cartera de compuestos inicial se ampliará a través de convocatorias abiertas para mantener un flujo de desarrollo que logre así el objetivo final que es completar esa primera fase de ensayos clínicos para obtener en 2019 al menos un antibiótico nuevo para tratar las infecciones por bacterias Gram- negativas.
La inversión conjunta pública y privada a través de IMI responde a cambios en la estrategia para obtener algunos medicamentos que, como los antibióticos, necesitan una inversión arriesgada para su descubrimiento y desarrollo. Esta colaboración tiene la misión de movilizar en Europa la experiencia de las universidades, institutos de investigación y la industria para responder a los desafíos globales. Coloca a Europa en la vanguardia de la investigación en colaboración entre la industria y el mundo académico para responder a los retos que presenta la salud.
El CNB: impedir la proliferación de patógenos
“Estudiando la bacteria E. coli como modelo, en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC,” manifiesta Miguel Vicente, “hemos obtenido conocimientos y experiencia técnica del más alto nivel para ensayar la eficacia de nuevos antibióticos en la lucha contra patógenos Gram-negativos”. A lo largo del proyecto ENABLE el CNB recibirá compuestos desarrollados por otros socios, como la fundación MEDINA, la Universidad de Barcelona y la empresa Biomol-Informatics para determinar si frenan el crecimiento o la proliferación de la bacteria. “Cuando lo sepamos, realizaremos ensayos más detallados para averiguar si alguno de ellos bloquea la máquina molecular que dirige la división de la bacteria y así proponer modificaciones de su estructura química que los hagan más eficaces”.
Cuando nuestro propio sistema inmune ataca a las células del páncreas encargadas de producir insulina no hay mucho que podamos hacer. Tenemos diabetes de tipo 1, y el único recurso que tienen los médicos es el de recetarnos insulina para que nos la inyectemos.
Sin embargo, a pesar de que con la insulina podemos tener contralada la diabetes, no existe cura y, con los años, la diabetes puede acabar acarreando complicaciones serias: problemas oculares, úlceras e infecciones en las extremidades, presión arterial y colesterol altos, o problemas renales.
En su laboratorio del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC, el grupo de investigación dirigido por Mario Mellado ha identificado una manera que evita que el sistema inmune ataque a las células del páncreas. Empleando un modelo murino de la enfermedad, los resultados que han obtenido parecen bastante prometedores: la hormona del crecimiento, usada por los médicos desde los años 50 del siglo pasado para tratar de su deficiencia a niños y adolescentes, retrasa el desarrollo de la diabetes de tipo 1.
En colaboración con científicos de la Universidad Complutense, han demostrado que la hormona de crecimiento favorece la proliferación de los islotes pancreáticos, protege su integridad y tiene efectos sobre el sistema inmunológico, favoreciendo la presencia de macrófagos antiinflamatorios y, entre otras cosas, mantiene la actividad de la población de linfocitos T encargada de reducir la respuesta inmune (células T reguladoras). Como acaban de publicar en la revista PNAS, el estudio remarca la importancia del control endocrino del las funciones asociadas al sistema inmunológico y sugiere que terapias basadas en análogos de la hormona de crecimiento podrían ser útiles en le tratamiento de la diabetes autoinmune.
- Villares R, Kakabadse D, Juarranz Y, Gomariz RP, Martínez-A C, Mellado M. Growth hormone prevents the development of autoimmune diabetes. Proc Natl Acad Sci USA. 2013; 110(48): E4619-E4627.
Los días 28 y 29 de abril de 2014 se celebrará en el Centro de Investigaciones Biológicas del CSIC el 3rd Madrid Meeting on Dendritic cells and Macrophages con el fin de promover la interacción entre los investigadores que trabajan en España en Células Dendríticas y Macrófagos, en el contexto de la respuesta inmune, la inflamación y el metabolismo.
Del 2 al 4 de abril de 2014 se va a celebrar en el Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) VIII Reunión de la Red Nacional de Estructura y Función de Proteínas.
Organizada por los científicos del CNB José María Valpuesta y José L. Carrascosa, la reunión pretende reunir a gran parte de la comunidad científica española que estudia distintos aspectos de las proteínas, para intercambiar conocimientos y fomentar colaboraciones. En esta reunión seguirá el formato de las anteriores, con charlas cortas que permitan mostrar los resultados al mayor número posible de investigadores, dando preferencia para las charlas a investigadores junior.
Para la organización de la reunión se cuenta con la ayuda del Ministerio de Economía y Competitividad y con apoyo por parte del Centro Nacional de Biotecnología y de varias sociedades científicas (SEBBM y SME) y empresas colaboradoras de la Red (Bruker, Sigma-Aldrich y Diffractia). Todo ello ha permitido la invitación de varios científicos que abrirán los simposios de la Reunión (ver Programa provisional).
La asistencia a la reunión será por cuenta de los investigadores participantes, tal como ha ocurrido en anteriores eventos, aunque habrá un número de ayudas a la asistencia para investigadores, financiadas por distintas sociedades científicas, cuyo número y cuantía está aun por determinar.
Many cellular processes can in the end be understood in terms of decisions; should a damaged cell decide to repair or to die? should a virus stay as a lysogen or rather cause host lysis? should a bacteria differentiate or not into a spore state when nutrients become limiting? Recent research is starting to understand these type of decisions by applying quantitative measurements and mathematical modeling. Notably, in many of these scenarios cellular 'strategies' that combined biological noise and nonlinearities in response are starting to be unravelled.
On 24 January 2014, the CNB Systems Biology Programme is bringing a number of experts on these very topics next week as part of its annual colloquium, with talks including aspects of decision making in mammalian cells, plants, microbes, etc. (see programme), so we expect that this meeting could be of interest for a wide range of life sciences scientists. You are all most welcome to attend.
PROGRAMME
Morning Session I (Chairman: Víctor de Lorenzo)
09:45 Welcome and General Information
10:00 - WILFRIED WEBER, University of Freiburg, Germany. Optical Control of Mammalian Cells
10:30 - ALEX DE MENDOZA, EB UPF-CSIC, Spain. Comparative genomics at the origins of multicellularity: transcription factors and signaling systems
11:00 - FRANCISCO ROMERO-CAMPERO, University of Seville, Spain. Plant development evolution based on gene co-expression networks
11:30 Coffee Break
Morning Session II (Chairman: Juan F Poyatos)
12:00 - PETER SWAIN, University of Edinburgh, UK. Microbial decision-making: phosphorylations and mating in yeast
12:30 - THIERRY EMONET, Yale University, USA. Functional trade-offs and phenotypic diversity in cellular migration
13:00 – EDO KUSSELL, New York University, USA. Memory accelerates bacterial adaptation in fluctuating environments
13:30 Lunch
Afternoon Session I (Chairman: Florencio Pazos)
14:30 - FERNANDO CASARES, CABD (CSIC-U. Pablo de Olavide), Spain. Gene Network Wiring and Eye Architectures in Drosophila
15:00 - CARSTEN PETERSON, Lund University, Sweden. Transcriptional regulation of lineage commitment in hematopoiesis - a stochastic model of cell fate decision
15:30 - NADIA MERCADER, CNIC, Spain. Cardiac regeneration vs. fibrotic repair: learning from the zebrafish
16:00 Coffee Break
Afternoon Session II Chairman: (Javier Tamames)
16:30 - MARTIN ACKERMANN, ETH, Switzerland. An Evolutionary Perspective on Bacterial Individuality
17:00 General Discussion and Conclusions
La vigésima primera edición de las tradicionals Jornadas Científicas del CNB se celebrará este año los días 17 y 18 de diciembre de 2013. Como se puede apreciar en el programa, 23 científicos del CNB explicarán sus investigaciones, siendo una magnífica oportunidad de ponerse al día de las investigaciones que se llevan a cabo en la actualidad en el campo de las ciencias de la vida.
Como en años anteriores, desde el 9 de diciembre, se desarrolla en paralelo una sesión de pósters en la que los estudiantes de doctorado muestran sus trabajos. Tras la sesión presencial del jueves 12 de 11:00 a 13:00, se elegirán los dos mejores que darán una charla en la última sesión del miércoles 18 de diciembre.
PROGRAMA
Packing bacterial components in unusual containers allows to explore how complex machineries work without the limitations imposed when using the whole cell. This approach, central to Miguel Vicente's HFSP grant, has produced valuable information on the cell division machinery, the divisome. New interactions between elements of the machinery have been revealed and functional assemblies have been reconstructed in the test tube.
On 28 February 2014 they will summarize the results of their project and discuss future Synthetic Biology developments in this field during a one day workshop at the Spanish National Centre for Biotechnology in Madrid. For more information and registration please visit the workshop's website.
PROGRAMME
10:00 Registration
10:30 - PETRA SCHWILLE. The contractile ring - facts and fiction
11:15 - WILLIAM MARGOLIN. Inhibiting the proto-ring, from A to Z
12:00 - MARTIN THANBICHLER. Mechanisms of MipZ-mediated division control in Caulobacter crescentus
13:15 Lunch
14:30 - MIGUEL VICENTE. Divisome adventures in maxicells
15:15 - GERMÁN RIVAS. Biochemical reconstruction of bacterial division in minimal systems
16:00 - DANIEL DALEY. The final stages of cell division in Escherichia coli: What happens and when?
El Centro Nacional de Biotecnología del CSIC celebra en Madrid el jueves 19 de diciembre de 2013 la vigesimoprimera edición de su tradicional jornada Avances en Biología Molecular por Jóvenes Investigadores en el Extranjero.
Las jornadas incluyen este año una mesa redonda en la que se comentarán las distintas posibilidades de financiación a nivel europeo.
PROGRAMA
Como el resto de centros del CSIC, el CNB participa activamente en la Semana de la Ciencia y la Tecnología, un hito anual de divulgación científica que se celebra en España desde 2001.
Estas son las actividades de este año en las que participan los investigadores del CNB:
- 5 de noviembre de 2013 (9:30 - 12:00). Visita guiada al CNB.
- 5 de noviembre de 2013 (12:00). El Puzzle del Cerebro. Charla divulgativa a cargo de Rosario Fernández.
- 12 de noviembre de 2013 (9:30 - 12:00). Visita guiada al CNB.
- 14 de noviembre de 2013 (15:30 - 17:00). Visita guiada al CNB.
- 14 de noviembre de 2013 (17:00). ¿Puede la Biotecnología curar las Enfermedades Raras? Mesa redonda con la participación de Lluís Montoliu
Investigadores del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) han obtenido una patente en los Estados Unidos que les permite utilizar bacterias no patógenas como si de jeringuillas microscópicas se trataran.
Las bacterias modificadas tienen en su membrana unas proteínas a modo de jeringuilla con las que son capaces de inyectar anticuerpos de pequeño tamaño (nanoanticuerpos) y otras proteínas con potencial terapéutico (p.ej. enzimas) a células humanas, evitando de esta manera la barrera que representa la membrana plasmática de la célula. En el caso de usar nanoanticuerpos, estos se podrían unir dentro de la célula a una proteína diana que participase en un proceso patológico para inactivar su función.
Para comprobar la viabilidad de esta tecnología, el grupo dirigido en el CNB por el Dr. Luis Ángel Fernández, introdujo estos nanoanticuerpos en el citoplasma de células humanas demonstrando que se unían especificamente a su proteína diana.
Una de las principales ventajas de este sistema es que la producción de los nanoanticuerpos la realiza la propia bacteria de manera continua, lo que podría reducir el coste y el número de dosis necesario para administrar estos anticuerpos de forma efectiva. Fernández recalca además su seguridad, ya que la inyección de los anticuerpos por parte de E. coli no conlleva ni la invasión de la células por parte de las bacterias ni la transferencia de manterial genético, al contrario que lo que ocurre con virus modificados.
El objetivo actual de este grupo de investigación es combinar estas jeringas moleculares en bacterias "probióticas" con nuevas modificaciones de forma que actuasen en el intestino y otras mucosas del organismo como autenticos "microrobots" dirigidos tanto para la detección como el tratamiento in situ de lesiones de tipo inflamatorio o tumoral.
- Luis Ángel Fernández y Ana Blanco-Toribio. Una bacteria recombinante capaz de inyectar anticuerpos monodomino intracelularmente en células humanas. Ref. CSIC/AH_015.
THIS COURSE HAS BEEN CANCELLED.
Organised by the EuPA Education Committee, Proteored-ISCIII and the Spanish Proteomics Society, from 4 to 8 Novembre 2013 the basic course Chromatography for Proteomics will be held in Madrid at the National Centre for Biotechnology-CSIC and the Faculty of Pharmacy-UCM.
In accordance with the HUPO/EuPA guidelines, the course aim to
- Provide a theoretical basis for understanding chromatographic separations
- Illustrate how the techniques are being applied in modern proteomics studies
- Help students to design their own experiments
- Provide practical instruction in laboratory techniques
- Provide extensive tutorial/discussion sessions
Course Description:
There are two main separation methods used in modern proteomics, electrophoresis and chromatography. The course is part of a series designed to give researchers a thorough basis to understand the new trends in protein expression analysis and to enable scientists entering the field to evaluate how useful these new techniques are to their own research and how to apply them effectively.
Theoretical Lectures:
- Basic liquid chromatography terms and theory
- Methods for separating protein and peptide mixtures
- Designing multi-dimensional separations
- Mass Spectrometry and database searching
Practical Classes:
- Sample preparation and extraction
- Evaluating and optimising separations
- Making nanocolumns, plumbing and HPLC troubleshooting
For inscriptions (before 21 September 2013), visit the website of the Chromatography for Proteomics.
El próximo 18 de octubre de 2013 comienza el VII Ciclo de Seminarios Júnior con una conferencia impartida por el investigador del la Universidad de Copenhague Peter Brodersen.
Con la colaboración de Sigma-Aldrich, AppliChem, VWR y Panreac, los estudiantes predoctorales del CNB han organizado una serie de 10 conferencias durante el curso 2013-2014. En ellas, los ponenten explicarán sus últimas investigaciones en el campo de la Ciencias de la vida.
Las conferencias tendrán lugar los viernes a las 12:00 en el Salón de Actos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC.
Las células "madre" embrionarias reciben este nombre por su capacidad de generar cualquier tipo celular de las tres capas del embrión a partir de las cuales se originarán los tejidos y órganos en el individuo adulto: el endodermo, el mesodermo o el ectodermo (diferenciación). Además, y al contrario que las células adultas especializadas, las células madre tienen la asombrosa capacidad de poder multiplicarse indefinidamente en el laboratorio (división), lo que las hace tremendamente útiles en el campo de la medicina regenerativa.
En la actualidad, los científicos tratan de comprender los mecanismos moleculares que regulan en las células madre el equilibrio entre ambos procesos, la división y la diferenciación. Últimamente se han identificado genes que permiten reprogramar células especializadas y convertirlas en células madre pero aun hay muchos genes específicos de estas células cuya función es desconocida.
Un ejemplo es el gen Dido al que dedica sus esfuerzos el grupo del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC (CNB) dirigido por Carlos Martínez-A. Este gen aparece evolutivamente en vertebrados y se manifiesta en tres proteínas distintas: Dido1, Dido2 y Dido3. Esta última se expresa en células madre y se modula su expresión en las células especializadas. Se une a estructuras esenciales para la división celular como son el centrosoma y el complejo sinaptonémico. Alteraciones de esta proteína causan síndromes preleucémicos y tumorales y bloquean la capacidad de diferenciarse de las células madre en cualquier tipo celular específico (diferenciación) manteniendo su capacidad de división (proliferación).
En colaboración con investigadores de la Universidad de Colorado, los científicos del CNB acaban de publicar un trabajo en el que identifican al dominio PH de Dido3, y determinan su estructura cristalina a 1.8 A de resolución, como el responsable de la unión al cromosoma. Esta unión causaría modificaciones en la expresión de diferentes genes que le dan a las células madre su capacidad de dividirse y diferenciarse en células adultas.
Además de identificar la zona de la proteína que se une a las histonas que organizan los cromosomas, los investigadores han profundizado en cómo se regula su función según el momento del ciclo celular en que se encuentre la célula. Sus datos indican que cuando las células madre se diferencian, Dido3 es desplazada del cromosoma por el aumento de Dido1. Esto conlleva una disminución en la expresión de genes que dotan a las células madre de su pluripotencia.
En este mismo aspecto, durante la mitosis han observado que Dido3 pasa de estar unido a la cromatina a desplazarse hasta el huso mitótico que dispone a los cromosomas en el ecuador de la célula como paso previo a separarlos hacia los polos cuando se va a producir la división de una célula en dos. De este modo, queda descrita por primera vez a través de Dido relación entre la expresión de genes durante el desarrollo embrionario y la regulación del ciclo celular
- Gatchalian J, Fütterer A, Rothbart SB, Tong Q, Rincon-Arano H, Sánchez de Diego A, Groudine M, Strahl BD, Martínez-A C, van Wely KH, Kutateladze TG. Dido3 PHD modulates cell differentiation and division. Cell Rep 2013 Jul 2. pii: S2211-1247(13)00292-1.
El próximo 4 de octubre de 2013 comienza el XVIII Ciclo de Seminarios del CNB con una conferencia impartida por Matteo Iannacone.
Con la colaboración de Sigma-Aldrich, AppliChem, VWR y Panreac, a lo largo del curso 2013-2014 contaremos con la presencia de 13 magníficos científicos que explicarán sus últimas investigaciones en el campo de la Ciencias de la vida.
A execpción de la ponencia de Philip Cohen que será un jueves, el resto tendrá lugar los viernes a las 12:00 en el Salón de Actos del Centro Nacional de Biotecnología del CSIC.
La presencia de arsénico en la naturaleza debido a las erupciones volcánicas ha sido una de las amenazas más importantes para el desarrollo de la vida en la tierra. Hoy en día el arsénico presente en los suelos, puede ser solubilizado en las aguas subterráneas exponiendo a los organismos a uno de los carcinógenos más potentes que se conocen. De hecho la exposición a arsénico es responsable del envenenamiento masivo más importante que ha sufrido la humanidad en toda su historia.
En plantas, la tolerancia al arsénico es esencial para su supervivencia ya que la forma química más abundante en la tierra (el arseniato) guarda una gran similitud con el fosfato y las plantas lo incorporan fácilmente a sus células a través de los transportadores de fosfato. En el CNB, el grupo dirigido por Antonio Leyva estudia las bases moleculares de los mecanismos de percepción de arsénico en plantas con el fin de identificar y desarrollar plantas que eviten la exposición de este carcinógeno a los seres vivos.
En este trabajo, merecedor de un comentario especial por parte de los editores de la revista Plant Cell, el grupo de Leyva ha descubierto que cuando las plantas detectan el arseniato impiden de forma inmediata su captación mediante la represión y deslocalización del transportador de fosfato. Este sistema está controlado mediante la acción de una proteína represora conocida como WRKY6.
En colaboración con otros dos grupos del CNB, han podido además descubrir que el arseniato provoca la activación masiva de transposones, unos elementos del ADN móviles capaces de “saltar” de un sitio a otro del genoma en respuesta a estrés y por tanto actuar como agentes mutagénicos. Una activación que también está controlada por el represor WRKY6.
Estos resultados indican que las plantas poseen un mecanismo de percepción del arseniato que controla la activación de transposones y la incorporación del arseniato. Todo ello proporciona un sistema integrado de tolerancia y de estabilidad genómica.
- Castrillo G, Sánchez-Bermejo E, de Lorenzo L, Crevillén P, Fraile-Escanciano A, Tc M, Mouriz A, Catarecha P, Sobrino-Plata J, Olsson S, Leo Del Puerto Y, Mateos I, Rojo E, Hernández LE, Jarillo JA, Piñeiro M, Paz-Ares J, Leyva A. WRKY6 transcription factor restricts arsenate uptake and transposon activation in Arabidopsis. Plant Cell 2013 Aug 6 tpc.113.114009.
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